申伟科 作品数:7 被引量:12 H指数:3 供职机构: 河北大学生命科学学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 河北省科技攻关计划 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 自动化与计算机技术 更多>>
癌症基因表达谱挖掘中的特征基因选择算法GA/WV 被引量:1 2010年 鉴定癌症表达谱的特征基因集合可以促进癌症类型分类的研究,这也可能使病人获得更好的临床诊断?虽然一些方法在基因表达谱分析上取得了成功,但是用基因表达谱数据进行癌症分类研究依然是一个巨大的挑战,其主要原因在于缺少通用而可靠的基因重要性评估方法。GA/WV是一种新的用复杂的生物表达数据评估基因分类重要性的方法,通过联合遗传算法(GA)和加权投票分类算法(WV)得到的特征基因集合不但适用于WV分类器,也适用于其它分类器?将GA/WV方法用癌症基因表达谱数据集的验证,结果表明本方法是一种成功可靠的特征基因选择方法。 申伟科 钟理 葛昆 张波 王建飞 张小刚 秦向东关键词:模式识别 非小细胞肺癌预后相关评价标志物的筛选 被引量:4 2014年 目的利用生物芯片技术和非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者血清及随访结果,筛选出新型NSCLC高敏感性和特异性的血清自身免疫抗体作为分子标志物用于NSCLC的预后评价。方法 (1)提取NSCLC组织总mRNA构建T7噬菌体cDNA文库;(2)用NSCLC预后良好和不良患者血清对T7文库进行生物淘洗;(3)构建蛋白芯片,分别用预后良好和不良患者血清孵育芯片进行Cy5/Cy3双荧光标记并分析芯片结果;(4)对挑选出的标志物进行测序及分析。结果筛选得到最佳评价组合含6个NSCLC预后相关标志物,其联合诊断准确率80.7%,敏感性85.3%,特异性73.9%,AUC为0.825;测序及BLAST分析显示,abl-interactor 1、pleiotrophin、surfactant protein B 3个标志物是已知癌细胞转移和预后相关分子。结论成功筛选得到1个含有6个标志物的最佳评价组合,可对NSCLC预后进行较准确诊断。 李俊甫 申伟科 祖金池 仉洁 张旭朏 张磊 钟理关键词:非小细胞肺癌 预后 蛋白芯片 自身免疫抗体 肿瘤基因表达谱分类的特征基因选择研究 目前,恶性肿瘤的治疗依然是当今世界的难题,发病类型多样而且难于治愈。早期诊断和精确分类有助于对患者进行有效的临床治疗,在最大程度上挽救宝贵的生命。当今,对肿瘤诊断和分类的主要手段是通过组织病理学特征进行判断的。但是,这个... 申伟科关键词:恶性肿瘤 基因芯片 基因表达谱 文献传递 乳腺癌蛋白质芯片的构建及其肿瘤标志物的筛选 2009年 目的制备乳腺癌蛋白芯片并初步用于乳腺癌肿瘤标志物(TM)筛选。方法利用蛋白芯片检测系统及双荧光标记法用30份乳腺癌患者和30份正常对照人群血清样品进行淘洗、初筛、诊断鉴定,从系统中寻找可用于乳腺癌检测的TM。结果通过筛选,有Ⅱ-B3(0.056 1)、Ⅱ-B4(0.067 9)、Ⅱ-D10(0.071 2)其P值在0.05附近。结论初步筛选得到的蛋白特异性较低,需对实验条件优化提高筛选效率。 张波 钟理 葛昆 申伟科 王建飞 张小刚 秦向东关键词:乳腺肿瘤 蛋白芯片 肿瘤标志物 基因表达聚类分析及在肿瘤研究中的应用 被引量:4 2008年 基因芯片技术日益广泛应用于生物学和医学领域,包括肿瘤研究。其中一项重要的工作是分析实验产生的海量数据。聚类分析是基因表达数据分析的一种重要工具,它包括三种常用的聚类算法:分层聚类,K-均值聚类和SOM聚类。基因表达谱在肿瘤研究中有广泛的应用,通过基因表达聚类分析已经获得许多有价值的发现。该文介绍了基因聚类分析的常用算法,以及聚类分析在肿瘤基因表达研究中的应用。 申伟科 钟理关键词:基因芯片 聚类分析 肿瘤 非小细胞肺癌早期诊断蛋白芯片的研究 钟理 张惠卿 祖金池 柳峰松 赵隆华 张超 康现江 李继刚 葛昆 赵丽坤 吴策 赵美玲 申伟科 王海霞 李秀敏 许若丹 张伟 刘艳 孙鲁华 张波 张小刚 王建飞 郭蕊 本项目旨在研制非小细胞肺癌早期诊断蛋白芯片。研究的主要内容包括:1、收集不同时期肿瘤组织和血清标本和构建肺癌T7噬菌体展示文库。2、利用淘洗富集技术筛选文库中的肺癌肿瘤标志物。3、制备肺癌肿瘤标志物蛋白微阵列并利用荧光抗...关键词:关键词:蛋白芯片 癌症 肿瘤标志物 非小细胞肺癌