王志鹏
- 作品数:38 被引量:87H指数:7
- 供职机构:东北农业大学动物科学技术学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家现代农业产业技术体系建设项目黑龙江省教育厅科学技术研究项目更多>>
- 相关领域:农业科学生物学文化科学更多>>
- 鸡DNAJB6基因生物信息学和组织表达谱分析
- 根据鸡腹脂性状的全基因组关联分析结果筛选出DNAJB6基因作为影响鸡腹脂性状形成的重要基因,对DNAJB6基因进行生物信息学和组织表达谱分析.结果表明,鸡DNAJB6基因编码含有326个氨基酸的蛋白,等电点为8.86,分...
- 王守志李辉王志鹏张慧
- 关键词:生物信息学组织表达谱
- 文献传递
- 猪的全基因组范围内Fox转录因子家族的识别和进化分析
- 2010年
- Fox蛋白是一类在后口生物界中广泛存在的转录因子,属于"螺旋-转角-螺旋"(helix-turn-helix)类蛋白的一个亚群。我们对其进行了全基因组的分析,探讨了此基因家族的分类。从猪中共识别27个含有Fox结构域的基因。通过利用Fox结构域内的氨基酸序列构建了NJ进化树,结果表明,27条基因内有20条分别归属到9个Fox基因家族中。本研究发现Fox基因在染色体上的分布呈不均衡性且存在3个基因簇。另外通过基因重复使得Fox基因家族得以扩增。基于人类Fox基因的研究结果,也讨论了猪Fox基因家族的功能分化和保守性。
- 宫磊王志鹏高会江
- 关键词:全基因组系统发育分析
- 一种新型羊子宫角输精器
- 一种新型羊子宫角输精器属于畜牧兽医器械;在壳体内可上下移动地配装齿条,齿轮可转动地安装在壳体上,齿轮与齿条啮合,在壳体下端部上安装杆套,推液杆可上下移动地插装在杆套内,推液杆上端与齿条下端连接,活塞可拆卸地安装在推液杆下...
- 姚玉昌亓美玉王志鹏陆明海李武刘玉峰王素梅
- 文献传递
- 一种能同时预示和鉴定绵羊羊毛细度和卷曲度的分子标记方法
- 一种能同时预示和鉴定绵羊羊毛细度和卷曲度的分子标记方法,它涉及分子标记方法。方法:一、设计引物对提取绵羊基因组DNA进行扩增,然后酶切,得酶切产物;二、酶切产物电泳分离,根据电泳分离结果进行基因型判定;三、进行关联分析,...
- 王宁荣恩光于磊杨华李辉王守志王志鹏
- 文献传递
- 一种与细管配合使用的羊胚胎移植器
- 一种与细管配合使用的羊胚胎移植器属于动物生物工程器械;在输入管座的下端和上端分别配装锥形胚胎输入管和紧固件,胚胎细管的下部插装在输入管座内,胚胎细管的下端部与锥形胚胎输入管的锥形内壁面密封配合,通过紧固件将胚胎细管在输入...
- 姚玉昌亓美玉王志鹏陆明海李武刘玉峰王素梅
- 文献传递
- 基于高密度SNP标记的肉牛人工选择痕迹筛查被引量:1
- 2012年
- 近年来随着遗传改良工作的实施,人工选择大大提高了肉牛的生产性能并使其遗传基础发生巨大改变。文章基于Illumina BovineSNP50(54K)和BovineHD(770K)两款芯片数据,采用FST检验方法分析牛群的遗传分化,并筛查人工选择在牛的基因组留下的印记。通过全基因组范围内的扫描,共发现47 104个"离群"位点和3064个群体特异的人工选择"候选基因",如CLIC5、TG、CACNA2D1、FSHR等。通过基因注释对基因的生物学过程和分子功能进行富集分析。文章构建了我国肉牛的全基因组的选择信号图谱,为深入研究人工选择和理解生物进化提供线索,且研究结果也显示人工选择对基因组的影响在牛品种遗传改良中发挥了重要作用。
- 刘喜冬王志鹏樊惠中李俊雅高会江
- 关键词:单核苷酸多态性基因注释
- 绵羊IGF-Ⅰ基因Ⅱ类变异剪接体生物信息学及组织表达分析
- 2019年
- 为明确绵羊IGF-Ⅰ基因变异剪接体的生物学特性及其在生长发育过程中的功能,本研究成功获得了IGF-Ⅰ基因Ⅱ类的2种变异剪接体(Ea和Eb型),利用生物信息学方法预测分析2种变异剪接体的结构特性,并探讨其在不同组织中的表达规律。结果表明:Ea和Eb型由同一基因通过选择性剪切形成,均是绵羊中新发现的类型,预测其分别编码138 aa和172 aa,2种变异剪接体的信号肽剪切位点、进化同源性、亚细胞定位、蛋白质空间结构预测结果类似,但二者包含不同的共价修饰位点。组织表达分析表明,2种变异剪接体在肝组织中表达量均最高,其次为脂肪、胃、睾丸、肌肉和皮肤组织,心、脾、肺、肾、肠、膀胱组织的表达水平较低;在胃中,羔羊期2种变异剪接体表达水平均极显著高于成羊期(P<0.01),在睾丸中,羔羊期IGF-Ⅰ基因Ⅱ类Ea型表达水平显著高于成羊期(P<0.05)。总体上来看,在各种组织中IGF-Ⅰ基因Ⅱ类Ea型的表达水平高于Eb型,为优势转录本类型。
- 宋旭婷翟羽飞张嘉楠亓美玉王志鹏王志鹏姚玉昌
- 关键词:绵羊IGF-I基因生物信息学分析
- 鸡全基因组选择信号筛选研究进展被引量:3
- 2016年
- 人工选择对家鸡驯化及品种形成具有重要作用,基因组上留有选择痕迹。随着基因组技术和选择信号检测方法完善,在基因组上检测选择信号成为进化生物学领域研究热点。文章主要描述选择信号定义,总结检测选择信号的重要统计方法,分析鸡基因组选择信号检测结果,以期为鸡全基因组领域研究提供参考。
- 王志鹏景军红周萌
- 关键词:基因组
- 有效结合SPSS统计软件,提高《生物统计学》教学效果被引量:4
- 2012年
- 《生物统计学》是高等农业院校生物学相关专业的专业基础课程,是生物学领域科学研究和实际工作中必不可少的基础工具。但是其理论相对抽象、复杂,课程内容量大,学生很难掌握,课程结束后实际应用能力也不强。为了提高教学效果,将SPSS软件与《生物统计学》教学实践有机结合起来,对传统的教学方法进行改革、创新,分别从教学形式、SPSS统计软件上机实践、准双语教学的引入等方面进行改革和优化,显著提高了《生物统计学》的教学效果,并有效提高了学生应用《生物统计学》解决实际问题的综合能力。
- 姚玉昌滕小华赵骞王志鹏
- 关键词:生物统计学SPSS统计软件本科教学教学改革
- 猪全基因组范围ETS基因家族成员的鉴定、进化与表达分析被引量:1
- 2020年
- ETS转录因子家族在动物中广泛存在,参与细胞分化调控、细胞周期控制、细胞凋亡等多个生物学过程。文章采用生物信息学方法系统分析猪ETS家族成员进化关系和调控图谱,结合RNA-Seq数据分析其组织表达规律。研究利用Pfam鉴定ETS保守结构域序列检索猪(Sus scrofa)蛋白序列,最终在猪基因组上鉴定得到23个ETS家族基因。分析ETS家族基因、蛋白一级结构和高级结构及亚细胞定位预测。基于最大似然法,构建ETS家族系统发育树发现,可分为11个子家族,子家族成员保守结构域、基因结构、理化性质相似。通过生信分析构建由ETS家族、靶基因和miRNA构成的基因调控网络,筛选出40个"ETS家族基因-miRNA-靶基因"前馈回路。转录表达谱提示ETS家族基因在成年公猪和母猪28种不同类型组织中均有表达,且ETS1基因在免疫组织(淋巴、脾脏)和外周血单核细胞中高表达,SPIC基因在免疫组织(淋巴、脾脏)高表达。研究结果为揭示ETS家族成员生物学功能奠定基础。
- 王志鹏周萌周萌郭媛媛王涛刘胜伟王涛丁坤闫晓红杨里昂
- 关键词:系统发育树表达谱基因调控网络