朱勃
- 作品数:16 被引量:13H指数:2
- 供职机构:浙江大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划杭州市农业发展基金更多>>
- 相关领域:农业科学医药卫生更多>>
- 一种多重PCR法检测水稻病原细菌的引物组及试剂盒和方法
- 本发明公开了一种多重PCR法检测水稻病原细菌的引物组及试剂盒和方法。引物组包括六对引物,第一对引物的碱基序列如SEQ ID No.1~2所示,第二对引物的碱基序列如SEQ ID No.3~4所示,第三对引物的碱基序列如S...
- 崔舟琦谢关林朱勃李斌
- 梨火疫病病原菌(Erwinia amylovora)三型分泌系统的鉴别及Erwinia spp. HrpA的分析
- 2009年
- 【目的】明确梨火疫病病原菌(Erwinia amylovora)三型分泌系统(type Ⅲ secretion system,TTSS)的所在区域、相关基因及Erwinia spp.的HrpA(hypersensitive response and pathogenicity gene A)选择压水平。【方法】利用生物信息学方法,通过BLAST程序对梨火疫病菌基因组的核苷酸数据库进行同源比对,同时对Erwinia spp.与宿主互作的表面蛋白HrpA进行选择压分析。【结果】TTSS分析结果显示在40kb大小的毒力岛上有27个TTSS相关基因。通过与看家基因及毒力岛上的致病性相关的重要基因HrpN的比较、选择压分析、多序列比较,发现HrpA基因处于较强的选择压作用下,且HrpA蛋白N端主要受正向选择,C端主要受净化选择。NJ法构建的HrpA系统发育树显示Erwinia spp.形成两个明显的分支,表明HrpA基因可能在种间分化后产生了不同的选择压变化。【结论】梨火疫病病原菌基因组3.14-3.18Mb为其TTSS分布区域。该病原菌通过TTSS侵染寄主植物,在其病原菌表面有一种类鞭毛结构的TTSS蛋白HrpA,HrpA作为传输者起着将效应分子输送到宿主内部的功能,在进化上受到了较强的选择压影响。
- 朱勃金谷雷怀雁谢关林
- 关键词:梨火疫病
- 进化分支节点距离法结合基因获得丢失检测大规模物种基因水平转移
- 基因水平转移(horizontal gene transfer,HGT),又称基因横向转移(lateral gene transfer,LGT),是指在差异生物个体之间,或单个细胞内部细胞器之间所进行的遗传物质的交流。差...
- 朱勃金谷雷徐铭杨楼妙苗谢关林
- 文献传递
- 用于诊断桑细菌性枯萎病的引物及诊断方法
- 本发明公开了一种用于诊断桑细菌性枯萎病的引物,上游引物的碱基序列如SEQ ID NO:1所示,下游引物的碱基序列如SEQ ID NO:2所示。本发明还公开了一种利用该引物诊断细菌性枯萎病的方法,包括以下步骤:将经表面消毒...
- 朱勃谢关林楼妙苗王国芬周勤余山红李斌
- 文献传递
- 一种检测壳聚糖抑制细菌最佳浓度和时间的方法
- 本发明公开了一种检测壳聚糖抑制细菌最佳浓度和时间的方法,包括:提供若干份壳聚糖浓度呈梯度分布的溶液,同时每份溶液中含有相同浓度的被抑制细菌和培养基,将所有溶液静置培养,培养过程中,选取若干时间点测量每份溶液的OD<Sub...
- 苏婷谢关林朱勃李斌
- 文献传递
- 防治植物青枯病和根肿病的生防制剂及其制备方法和应用
- 本发明公开了一种防治植物青枯病和根肿病的生防制剂及其制备方法和应用。该生防制剂的制备方法包括:将经活化的解淀粉芽孢杆菌ZJUB2008接种到培养液中,于25-45℃发酵培养6-120h;其中,以体积1L计,所述的培养液含...
- 周青谢关林苏婷刘宝平朱勃李斌
- 进化分支节点距离法结合基因获得丢失检测大规模物种基因水平转移
- 基因水平转移(horizontal gene transfer, HGT),又称基因横向转移(lateral gene transfer, LGT),是指在差异生物个体之间,或单个细胞内部细胞器之间所进行的遗传物质的交流...
- 朱勃金谷雷徐铭杨楼妙苗谢关林
- 关键词:生物物种基因水平转移
- 用于诊断桑细菌性枯萎病的引物及诊断方法
- 本发明公开了一种用于诊断桑细菌性枯萎病的引物,上游引物的碱基序列如SEQ ID NO:1所示,下游引物的碱基序列如SEQ ID NO:2所示。本发明还公开了一种利用该引物诊断细菌性枯萎病的方法,包括以下步骤:将经表面消毒...
- 朱勃谢关林楼妙苗王国芬周勤余山红李斌
- 基因水平转移在植物细菌致病性及其进化上的影响研究
- 基因重组、复制及丢失一直以来被认为在细菌进化过程中起着最主要的作用,尽管一些学者一直怀疑在致病基因的进化过程中,水平转移(Horizontal Gene Transfer,HGT)起着一定的作用,但是只有在最近几年随着测...
- 朱勃金谷雷谢关林
- 关键词:基因重组基因水平转移
- 文献传递
- 防治植物青枯病和根肿病的生防制剂及其制备方法和应用
- 本发明公开了一种防治植物青枯病和根肿病的生防制剂及其制备方法和应用。该生防制剂的制备方法包括:将经活化的解淀粉芽孢杆菌ZJUB2008接种到培养液中,于25-45℃发酵培养6-120h;其中,以体积1L计,所述的培养液含...
- 周青谢关林苏婷刘宝平朱勃李斌
- 文献传递