韦朝春
- 作品数:33 被引量:11H指数:1
- 供职机构:上海生物信息技术研究中心更多>>
- 发文基金:国家高技术研究发展计划引进国际先进农业科技计划比尔和梅琳达·盖茨基金更多>>
- 相关领域:农业科学医药卫生生物学更多>>
- 小肠结肠炎耶尔森氏菌的快速恒温检测方法、引物组及试剂盒
- 本发明公开了一种针对小肠结肠炎耶尔森氏菌的快速恒温检测方法、引物组及试剂盒。所述方法为:从待测样品中提取基因组DNA;以所述基因组DNA为模板,以能扩增小肠结肠炎耶尔森氏菌特异性序列的引物组为引物,在酶反应体系下进行恒温...
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- 快速恒温检测金黄色葡萄球菌的方法、引物及试剂盒
- 本发明公开了一种快速恒温检测金黄色葡萄球菌的方法、引物组及试剂盒。所述方法为:从待测样品中提取基因组DNA;以所述基因组DNA为模板,以能扩增金黄色葡萄球菌特异性序列的引物组为引物,在酶反应体系下进行恒温扩增反应;通过判...
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- 沙门氏菌的快速恒温检测方法、引物组及应用
- 本发明公开了一种针对沙门氏菌的快速恒温检测方法、引物组及试剂盒。所述方法为:从待测样品中提取基因组DNA;以所述基因组DNA为模板,以能扩增沙门氏菌特异性序列的引物组为引物,在酶反应体系下进行恒温扩增反应;通过判断反应结...
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- 基于元基因组学的未知病原快速鉴定系统及分析方法
- 本发明提供一种基于元基因组学的未知病原的快速鉴定系统及分析方法,运用元基因组学的方法进行未知病原鉴定及分析:包括:测序质量控制系统:对测序数据进行质量分析,把测序质量不合要求的部分去除;Meta-All分析系统:本系统的...
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- 创伤弧菌的快速恒温检测方法、引物组及试剂盒
- 本发明公开了一种针对创伤弧菌的快速恒温检测方法、引物组及试剂盒。所述方法为:从待测样品中提取基因组DNA;以所述基因组DNA为模板,以能扩增创伤弧菌特异性序列的引物组为引物,在酶反应体系下进行恒温扩增反应;通过判断反应结...
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- 沙门氏菌的快速恒温检测方法、引物组及试剂盒
- 本发明公开了一种针对沙门氏菌的快速恒温检测方法、引物组及试剂盒。所述方法为:从待测样品中提取基因组DNA;以所述基因组DNA为模板,以能扩增沙门氏菌特异性序列的引物组为引物,在酶反应体系下进行恒温扩增反应;通过判断反应结...
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- FIND:从下一代单端测序数据中快速查找Indel的方法
- 2010年
- 目的:针对下一代测序数据,尤其是单端测序数据,研究快速、准确查找Indel的方法。方法:先与全基因组参考序列进行快速比对,筛选出包含Indel的序列;再对这些序列进行双向的二次比对,确定Indel长度;最后借助长度信息在锁定范围内查找Indel的确切位置和相关信息。结果:本文成功构建FIND(Fast INDel detection system)系统,用于从单端测序数据中查找Indel信息。以模拟测序数据作为测试数据,在12X测试数据情况下,FIND的灵敏度和特异性分别为87.71%和99.66%,而且该性能还随着测序倍数的增加而提升。结论:充分利用比对过程获取的信息,在确定Indle长度的同时也确定出其大致位置,最终在局部范围内实现对单端测序数据中Indle的快速而准确的查找。
- 宋琳琳顾朝辉韦朝春
- 关键词:下一代测序滑动窗口算法
- 一种荧光成像分析系统
- 本实用新型公开了一种荧光成像分析系统,所述系统包括外壳、以及设置在外壳内部的至少一个激发装置以及成像装置。所述激发装置包括激发光源和激发滤光片;激发光源发出的光线经过激发滤光片形成单色的激发光照射到样品台,被检测物受激发...
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- 快速恒温检测创伤弧菌的方法、引物及试剂盒
- 本发明公开了一种快速恒温检测创伤弧菌的方法、引物组及试剂盒。所述方法为:从待测样品中提取基因组DNA;以所述基因组DNA为模板,以能扩增创伤弧菌特异性序列的引物组为引物,在酶反应体系下进行恒温扩增反应;通过判断反应结果是...
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- 检测人乳头瘤病毒的检测试剂盒及其制备和使用
- 本发明公开了一种用于检测人乳头瘤病毒的检测试剂盒,包括人乳头瘤病毒测序引物溶液。本发明还公开了上述用于检测高危型人乳头瘤病毒的试剂盒的制备方法和使用方法。本发明的试剂盒可以确定待测样本中是否包含HPV病毒,以及具体病毒亚...
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