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迟浩
作品数:
72
被引量:47
H指数:4
供职机构:
中国科学院计算技术研究所
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发文基金:
国家重点基础研究发展计划
国家高技术研究发展计划
国家自然科学基金
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相关领域:
自动化与计算机技术
生物学
理学
文化科学
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合作作者
贺思敏
中国科学院计算技术研究所
孙瑞祥
中国科学院计算技术研究所
刘超
中国科学院计算技术研究所
王乐珩
中国科学院计算技术研究所
曾文锋
中国科学院计算技术研究所
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作者
72篇
迟浩
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贺思敏
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孙瑞祥
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刘超
22篇
曾文锋
22篇
王乐珩
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2篇
2011
8篇
2010
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一种蛋白质鉴定的大规模分布式并行加速方法及其系统
本发明有关于一种蛋白质鉴定的大规模分布式并行加速方法及其系统,其中该方法包括:步骤1,用并行处理方法,对蛋白质序列进行理论酶切得到肽序列,对肽序列进行排序、去冗余处理,以创建肽索引文件块;步骤2,对质谱谱图进行排序,并将...
王乐珩
王文平
迟浩
吴妍洁
周郴
付岩
孙瑞祥
贺思敏
文献传递
一种检测差异表达蛋白质的方法
本发明涉及一种检测差异表达蛋白质的方法,面向定量蛋白质组学中的基于一级谱图信息的标记和非标记的相对定量数据分析,包括肽谱匹配、可信度评价、肽段信号提取、肽段比值计算、蛋白质比值计算、统计学分析,根据某蛋白质在两种或多种样...
刘超
宋春青
迟浩
孙瑞祥
董梦秋
贺思敏
开放式蛋白质鉴定的数据库搜索方法及其系统
本发明有关于一种开放式蛋白质鉴定的数据库搜索方法及其系统,其中该方法包括:步骤1,输入蛋白质序列,模拟切分每一条蛋白质序列,并将所有生成的子序列按照质量排序,生成肽序列数据表,并根据该肽序列数据表建立索引文件;步骤2,输...
迟浩
孙瑞祥
王乐珩
张文力
贺思敏
文献传递
一种肽段液相色谱保留时间预测方法及系统
本发明提出一种肽段液相色谱保留时间预测方法及系统,涉及生物信息学,该方法包括对原始质谱数据文件进行搜索,获取肽段‑谱图匹配作为鉴定结果,对于所述鉴定结果中FDR小于1%的来自目标库的肽段‑谱图匹配,提取肽段‑谱图匹配中相...
涂慧君
刘超
迟浩
贺思敏
文献传递
一种从头测序方法
本发明提一种从头测序方法,该方法包括:在通过酶切产生的两个数据集中查找镜像肽段对应的镜像谱图;从所述镜像谱图中检测高可信谱峰和普通谱峰;根据所述高可信谱峰和普通谱峰构建有向无环图,其中,所述高可信谱峰对应的结点是高可信结...
杨皓
迟浩
曾文锋
周文婧
刘超
贺思敏
一种蛋白质鉴定的大规模分布式并行加速方法及其系统
本发明有关于一种蛋白质鉴定的大规模分布式并行加速方法及其系统,其中该方法包括:步骤1,用并行处理方法,对蛋白质序列进行理论酶切得到肽序列,对肽序列进行排序、去冗余处理,以创建肽索引文件块;步骤2,对质谱谱图进行排序,并将...
王乐珩
王文平
迟浩
吴妍洁
周郴
付岩
孙瑞祥
贺思敏
肽段-谱图匹配可信度检验方法、系统、存储介质及装置
本发明提出一种肽段‑谱图匹配可信度检验方法、系统、存储介质及装置,包括:将待检测结果中图谱数据输入至开放式搜索引擎,得到待检测结果的鉴定结果;获取限定式搜索引擎对待检测结果的打分,得到第一分值,同时提取第一分值排前n名候...
周文婧
杨皓
曾文锋
张昆
迟浩
贺思敏
文献传递
一种检测差异表达蛋白质的方法
本发明涉及一种检测差异表达蛋白质的方法,面向定量蛋白质组学中的基于一级谱图信息的标记和非标记的相对定量数据分析,包括肽谱匹配、可信度评价、肽段信号提取、肽段比值计算、蛋白质比值计算、统计学分析,根据某蛋白质在两种或多种样...
刘超
宋春青
迟浩
孙瑞祥
董梦秋
贺思敏
文献传递
氨基酸可信度和修饰位点定位的评估方法
本发明提供了一种氨基酸可信度评估模型训练方法。该方法包括:根据包含待训练氨基酸的训练肽段产生所述待训练氨基酸的背景肽段集合;从所述训练肽段和所述待训练氨基酸提取多个特征;以所提取的多个特征作为输入向量,以所述待训练氨基酸...
杨皓
迟浩
曾文锋
周文婧
王钊伟
王瑞敏
牛秀南
陈振霖
刘超
贺思敏
一种串联质谱谱图鉴定方法
本发明提供一种串联质谱谱图鉴定方法,其特征在于,包括下列步骤:1)对于待鉴定谱图数据集中的每张谱图,分别在全局序列库中进行限制性搜索,获得各谱图的匹配肽段;2)根据步骤1)所得各谱图的匹配肽段,构建局部序列库,对于待鉴定...
何昆
曾文锋
付岩
迟浩
贺思敏
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