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董薇
作品数:
4
被引量:14
H指数:2
供职机构:
中国农业科学院棉花研究所
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发文基金:
国家重点基础研究发展计划
国家科技支撑计划
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相关领域:
农业科学
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合作作者
杜雄明
中国农业科学院棉花研究所农业部...
贾银华
中国农业科学院棉花研究所农业部...
赖童飞
中国农业科学院棉花研究所农业部...
庞保印
中国农业科学院棉花研究所
孙君灵
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2011
1篇
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1篇
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一种SSR分子指纹鉴定方法
本发明提供了一种SSR分子指纹鉴定方法,通过筛选SSR引物对DNA进行扩增,建立指纹图谱,并进行SSR丰度统计,进一步区分各个品种。采用本发明SSR分子指纹鉴定方法可以大量区分不同类型的植物品种,具有快捷高效,灵敏度高、...
杜雄明
潘兆娥
孙君灵
周忠丽
贾银华
董薇
刘国强
庞保印
文献传递
一种SSR分子指纹鉴定方法
本发明提供了一种SSR分子指纹鉴定方法,通过筛选SSR引物对DNA进行扩增,建立指纹图谱,并进行SSR丰度统计,进一步区分各个品种。采用本发明SSR分子指纹鉴定方法可以大量区分不同类型的植物品种,具有快捷高效,灵敏度高、...
杜雄明
潘兆娥
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文献传递
雷蒙德氏棉和亚洲棉SSR重复序列类型和丰度差异比较
被引量:2
2008年
利用生物信息学相关方法对NCBI数据库中39277条亚洲棉(Gossypium arboretum L.)及63588条雷蒙德氏棉(Gossypium raimondiiL.)的EST序列共计64.08Mb(约相当于基因组的6.02%)分别进行拼接,比较分析了两棉种简单重复序列的重复类型及丰度差异。结果表明:拼接后的一致性序列中,亚洲棉比雷蒙德氏棉存在较高比例的单条序列簇;亚洲棉一至六碱基6种重复类型的SSR间隔距离分别比雷蒙德氏棉的大;亚洲棉中二到六碱基等5种重复类型的比例高于雷蒙德氏棉,但单碱基重复类型比例低于雷蒙德氏棉;两棉种的单碱基、四碱基和六碱基重复类型的优势重复基序和丰度也不同。因此,认为利用四、五、六碱基三种重复类型设计的SSR引物可以有效地鉴定亚洲棉和雷蒙德氏棉的基因组差异。对四倍体棉种的A、D亚组供体棉种中SSR的差异分析,为SSR标记开发、棉种起源和进化的深入研究提供更多有用的信息。
董薇
杜雄明
赖童飞
关键词:
亚洲棉
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