李雪楠
- 作品数:5 被引量:0H指数:0
- 供职机构:中国科学院更多>>
- 相关领域:生物学农业科学医药卫生环境科学与工程更多>>
- ACOT1蛋白突变的分子动力学研究
- 2014年
- 酰基辅酶硫酯酶(Acyl-CoA thioesterases,ACOTs),也被称作酰基辅酶A水解酶,是一类能够水解酰基辅酶A酯类水解的酶,在脂肪酸的代谢中起着重要的作用。文中通过将序列分析得到的ACOT1的有害突变序列(ACOT1_MULT)和野生型序列利用同源建模的方法得到了相应的蛋白结构,并利用分子动力学模拟的方法研究了突变氨基酸对蛋白结构造成的影响。研究结果发现:突变蛋白在分子动力学过程中活性中心上面的"盖子"(LEU374-SER380)区域打开,而野生型一直处于关闭状态。通过对氢键和疏水作用的分析发现,突变位置的氨基酸(ALA189THR)与蛋白序列中的GLY169形成了新的氢键,突变残基附近的氢键也发生了很大的变化,导致了邮水解酶区域的第3个β折叠的末端Loop区(160Loop)朝着外侧的亲水性区域拉伸。160Loop区域的变化使得它与"盖子"区域之间的疏水相互作用消失,"盖子"区域的稳定性下降,并最终导致了"盖子"的打开。该结果对ACOT1蛋白相关的人类免疫病毒缺陷疾病和附睾炎等疾病的发病机理的研究具有很好的借鉴作用,同时也为基于该活性区域的抑制剂筛选工作提供了新的靶点。
- 张丽杰李雪楠李昊阳周家蓬陈禹保
- 关键词:氢键疏水相互作用分子动力学模拟
- 干热河谷稀树灌丛藤本植物叶片养分重吸收特性
- 2024年
- 为探明我国西南干热河谷地区特殊的植被类型稀树灌丛的养分重吸收规律,选取元江干热河谷的稀树灌丛10种优势藤本植物为研究对象,测定叶片热值、灰分含量、形态性状、成熟叶和凋落叶的氮磷元素含量,计算叶片构建成本,探讨叶片构建成本、叶片性状与氮磷重吸收效率之间的相互关系。结果显示:元江干热河谷稀树灌丛藤本植物叶片的氮磷重吸收效率在不同物种之间存在较大的变异,叶片氮和磷重吸收效率平均值分别为48.0%和46.2%;叶片磷重吸收效率与氮重吸收效率呈显著正相关关系(P<0.05),而氮磷重吸收效率与叶片构建成本、比叶重呈显著负相关关系(P<0.05)。叶片构建成本较低的植物采取较快速的养分周转策略,以提高养分再利用效率;叶片构建成本较高的植物采取较保守的养分利用策略,养分回收效率较低。元江干热河谷的稀树灌丛藤本植物存在生活史策略的分化,以适应长期干热的生境。
- 李雪楠李雪楠李发文温韩东温韩东
- 关键词:干热河谷藤本植物比叶重
- 云南哀牢山退化常绿阔叶林乔木多样性和生物量的恢复
- 2024年
- 为了探究退化森林的树种组成变化和生物量储量的恢复规律,该研究选取云南哀牢山不同演替阶段的常绿阔叶林为对象,比较了不同演替阶段森林群落结构、树种多样性和生物量变化。结果表明,从演替早期到演替末期,乔木的科数先减少后增多,属数和种数则逐渐增加;Margalef丰富度指数、Simpson优势度指数、Shannon-Wiener多样性指数和Pielou均匀度指数随演替进程均呈增加的趋势;乔木生物量储量随演替进程逐渐升高,演替早期和演替中期的生物量分别为演替末期生物量的9.87%和65.98%;群落水平的树种多样性指数与总生物量呈显著正相关关系(P<0.05)。树木的生长和树种多样性的提高是影响群落乔木生物量储量递增的因素,且哀牢山处于湿冷的气候条件,退化森林植被的恢复相对比较缓慢。
- 李雪楠李雪楠杞金华鲁志云范泽鑫鲁志云张树斌
- 关键词:森林演替群落结构植物多样性生物量
- Using Imputation Method with reference panel reconstruction to Improve Whole Exome Sequencing analysis
- Background: With the advances of Next Generation Sequencing technology, the application of bioinformatics to s...
- 裴智勇李雪楠周家蓬桂小柯陈禹保
- 关键词:BIOINFORMATICSIMPUTATIONEXOMEGENOMESREFERENCEPANEL
- 睡眠分期中心率变异性研究
- 背景:随着人们生活压力的增大,睡眠问题已经严重影响人们的生活质量。睡眠分期是研究睡眠质量和一些相关疾病的重要依据。依据美国睡眠医学会睡眠分期方法,睡眠分期以30秒为单位,将睡眠过程划分为:醒觉期(Wake)、快速眼动期(...
- 李雪楠张秀玲卜祥霞文明伟李福明杨娟王春雷钟爱秒陈天禅Nicholas Archibald张永辉
- 文献传递