刘蓉杰
- 作品数：2 被引量：0H指数：0
- 供职机构：湘潭大学信息工程学院更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 基于DNA结构特性的启动子预测方法研究
- 在过去的几年中,我们已经完成了多个物种基因组的测序计划,对这些已经完整测序的基因组进行详细的注释变得越来越重要,而识别核心启动子是基因组注释中最具挑战性的工作之一。核心启动子包含了指导转录起始所必需的DNA序列,因此识别...
- 刘蓉杰
- 关键词：MARKOV链启动子预测
- 文献传递
- 基于具有多茎环特征GA-SVM的人类Pre-miRNA的预测研究
- 2011年
- MicroRNA(miRNA)是一类长度约为21 nt的非编码RNA,在动植物中发挥着重要而广泛的转录后调控作用.现有的计算预测方法通常不能很好地识别具有多分枝茎环二级结构的pre-miRNA.为进一步提高对pre-miRNA的预测精度,本文在以往研究的基础上,新引用了一类多茎环生物学特征,将遗传算法(GA)与支持向量机(SVM)结合以进行特征选择,同时优化SVM分类器模型参数(c,g),并对数据集的不平衡性进行处理,构造出新的分类器.本文采用人类pre-miRNA作为研究数据集,通过5折交叉验证,实验结果显示,新的分类器能够有效地提高预测精度.
- 熊大鹏刘蓉杰胡凯谭艳平张园唐广宇曾寅
- 关键词：PRE-MIRNA
