刘玉林
- 作品数：12 被引量：72H指数：5
- 供职机构：西北农林科技大学林学院更多>>
- 发文基金：国家科技支撑计划国家林业公益性行业科研专项中央高校基本科研业务费专项资金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 仁用杏果肉3个发育阶段的转录组分析被引量：2
- 2017年
- 仁用杏果肉糖酸比低是造成其鲜食性差的主要原因。该研究以仁用杏‘山苦2号’开花后30、60和90d的果肉为材料,利用RNA-seq对仁用杏果肉进行转录组测序及差异表达基因的筛选,以了解可能与糖酸合成相关的基因及其表达模式,为进一步解析仁用杏果肉糖酸比低的分子调控模式与机制,深入研究仁用杏果肉糖酸代谢转化机制提供依据。结果显示:(1)在仁用杏果肉发育的3个阶段共获得差异表达的单基因簇(unigene)28 989条;根据单基因簇的功能注释,共发掘出19条单基因簇编码5个与仁用杏果肉中糖合成代谢相关的酶,54条单基因簇编码15个与仁用杏果肉中酸合成代谢相关的酶。(2)在所选3个发育阶段的仁用杏果肉中共发现9条与糖代谢相关的单基因簇和27条与酸代谢相关的单基因簇呈现差异表达。(3)编码与蔗糖合成积累相关的蔗糖磷酸酶和蔗糖合成酶的单基因簇主要呈下调表达,而与糖分解相关的果糖激酶和己糖激酶却呈上调表达。(4)与仁用杏果肉中主要有机酸组分苹果酸积累相关的苹果酸脱氢酶主要呈上调表达,而分解苹果酸的苹果酸酶呈下调表达。研究推测,仁用杏果肉在发育中糖积累受阻,而有机酸却得到大量的合成积累,这可能是造成仁用杏果肉糖酸比例小,鲜食口感差的主要内在因素之一。
- 谭金花候丽秀刘永红王胜琪魏安智刘玉林
- 关键词：仁用杏果肉转录组
- 杏核仁主要性状变异及概率分级被引量：4
- 2017年
- 杏核仁含有丰富的变异性状,对核仁主要性状进行合理分级可以在数量化和规范化的基础上对杏种质资源进行评价,建立更为具体精确的评价标准是杏种质开发利用的基础。该研究选取22个杏种质,测定核仁主要性状指标并对其变异和概率分级进行分析。结果表明:杏核仁主要性状的变异较为丰富,在8.02%~69.59%,各个主要性状指标间变化规律不一致;杏核仁主要性状Sig.值均处于0.16~1.00,所有主要性状指标均符合正态分布。通过对杏核仁主要性状的分析,提出了基于杏核仁主要性状分布特征的杏种质资源概率分级指标体系,将杏品种依据各性状指标分为3级,并指出各级质量指标范围,使用这一标准可以将杏种质区分出来。不仅可以补充和完善杏分类和鉴定的评价标准,还可以为其它植物种质资源评价中观测数据的规范化和标准化处理提供参考。
- 李玄刘玉林刘永红王媛
- 关键词：主要性状
- 文冠果转录组SSR特征分析及EST-SSR标记开发被引量：24
- 2017年
- 【目的】利用高通量测序技术分析文冠果转录组中SSR位点分布类型与特征,并设计开发EST-SSR标记,为文冠果的遗传多样性分析提供标记资源。【方法】利用MISA软件筛选文冠果51 867条unigenes中的SSR(2~6bp)位点,统计分析SSR位点的分布特征、发生频率和平均分布距离。利用Prime 3在线软件随机设计合成60对EST-SSR标记,用我国7个省份的16份文冠果材料对所设计的标记进行多态性筛选;用Popgene 32软件分析标记的等位基因数(NA)、观测杂合度(HO)、期望杂合度(HE)和多态性信息含量(PIC)等。【结果】从文冠果unigenes中筛选出6 707个SSR位点,其平均发生频率为12.93%,平均分布距离5.38kb,平均长度17.30bp,其中2、3核苷酸重复单元的发生频率分别为6.24%和4.93%。设计的60对标记中有47对能扩增出与目的片段长短相符的产物,其中14对多态性较高,共扩增到52个等位基因,HO和HE分别为0~0.813和0.353~0.762,PIC为0.283~0.701。【结论】文冠果转录组SSR重复单元以2、3核苷酸重复为主;新开发的14个EST-SSR标记可作为文冠果种质资源多样性分析的标记资源。
- 刘玉林李伟董树斌沐先运张志翔
- 关键词：转录组EST-SSR标记多态性分析
- 仁肉兼用杏新品种‘山苦2号’选育被引量：2
- 2017年
- ‘山苦2号’杏是以山杏的自然实生种中选出的优良植株为接穗,普通杏作为砧木嫁接而来的仁肉兼用的优良品种。果实卵圆形,顶平、微凹、梗洼深,缝合线明显,平均单果质量19.32g。果实6月下旬成熟,果面光滑明亮、橙黄色,果肉较厚、多汁、口感酸甜,离核,仁饱满,核出仁率31.75%,平均单仁质量0.30g,味苦。丰产、耐寒,抗病性强,可作为仁用、鲜食兼用品种。
- 候丽秀魏安智刘玉林王胜琪
- 花椒离体愈伤组织诱导研究被引量：5
- 2016年
- 以"凤县大红袍"花椒嫩叶为外植体,研究不同种类和浓度的植物生长调节剂、不同盐浓度的培养基以及同一低温不同处理时间对花椒愈伤组织诱导及其生长的影响。结果表明,MS为最适培养基;诱导花椒愈伤组织较优的生长调节剂组合为,0.5mg/L 6-BA+0.5mg/L 2,4-D,诱导出的愈伤生长旺盛,质地松散,无褐化现象;在0℃处理2、4h仍可以获得正常的愈伤组织,不影响再分化。
- 崔丹魏安智侯娜刘玉林
- 关键词：花椒愈伤组织诱导分化
- 樟子松SSR反应体系优化被引量：7
- 2013年
- 从模板DNA、Taq酶含量、dNTP浓度、引物浓度、退火温度、循环次数6个方面,分别设置单因素多水平试验,观察条带的亮度及清晰度,以确定合适的反应体系。然后利用L16(45)正交试验,对DNA模板浓度、Taq酶含量、dNTP浓度、引物浓度这4个因素在4个水平上做进一步优化。建立了樟子松SSR最佳反应体系:25μL的反应体系中包含模板DNA50ng,Taq酶1.0U,dNTP0.3mmol/L,引物0.15μmol/L,10×TaqBuffer(含Mg2+)2.5μL。樟子松SSR反应体系的优化,有助于对樟子松SSR分子标记的研究,为分析樟子松天然群体和人工群体的遗传结构多样性,构建遗传图谱和定位功能基因奠定了基础。
- 方攀张运城袁虎威刘玉林李伟
- 关键词：樟子松SSR反应体系正交试验
- 基于高通量测序的辽东栎转录组学研究被引量：10
- 2014年
- 应用Illumina Solexa Hiseq 2000高通量测序技术对辽东栎的芽、花、叶及果实的混合样品进行转录组测序,结果共获得3.8 Gb的有效数据。应用Trinity软件对有效序列从头拼接去重复后,共获得95 800条unigene,总长度为73.57 Mb,最大长度、平均长度和N50分别为11 284 bp、768 bp和1 373 bp。利用Blastx与公共数据库Nr和Swiss-Prot的同源性比较(E值<1×10-5)发现,38 163条unigene未发现与公共数据库中的序列具有同源性。通过KEGG数据库中参与淀粉合成与代谢的pathway分析,共发掘出67条参与淀粉合成的unigene,编码9个关键酶。此外,在13 380条unigene中共搜索到15 901个SSR位点,其中二核苷酸和三核苷酸的重复类型占所有SSR位点的98.16%。
- 刘玉林李伟张志翔
- 关键词：辽东栎ILLUMINA转录组SSR
- 仁用杏抗寒性研究进展被引量：6
- 2018年
- 仁用杏是以杏仁为主要产品的杏属果树的统称,在北方普遍栽植,耐干旱、抗性强且易于管理,对于改善生态环境、防止水土流失和荒漠化均有良好效果,是理想的经济型树种。但在实际生产中,仁用杏常遭受冬季严寒和早春晚霜的危害,产量受到影响,造成仁用杏的产业化发展受到制约。仁用杏的抗寒研究主要集中于新品种选育和生理生化机制方面:‘围选1号'等抗寒新品种已应用于抗逆研究及生产中;通过抗逆相关。物质的分析也使抗寒机制研究趋于深入。综合论述了仁用杏在分子生物方面的研究及其同科植物的抗寒性等,为仁用杏的进一步抗寒研究做参考和理论依据。
- 田介云魏安智刘玉林王胜淇刘永红
- 关键词：仁用杏品种选育生理研究抗寒基因
- 花椒cpSSR标记开发及在种间、种内的通用性分析被引量：2
- 2019年
- 叶绿体基因组为母系遗传,保守性高,因此叶绿体基因组中的简单序列重复(SSR)标记可在更高分类水平上进行种质资源鉴定和群体遗传结构分析。利用TRF软件和SSR Hunter软件相结合对花椒Zanthoxylum bungeanum叶绿体基因组中的SSR位点进行筛选。结果显示:花椒叶绿体基因组中共有144个SSR位点,位点间的平均分布距离为1 100.00 bp。基于检测软件设置参数,SSR重复类型主要集中在一、三核苷酸重复,二者占SSR位点总数的91.67%。此外,随机设计合成30对SSR引物对10份花椒种质、5份竹叶花椒Zanthoxylum armatum种质和1份日本花椒Zanthoxylum piperitum种质进行PCR扩增检测,共筛选出10对多态性引物,其中单核苷酸重复位点的多态性高于多核苷酸重复位点。本研究开发的叶绿体SSR标记可有效区分花椒、竹叶花椒和日本花椒,但在花椒种内并未检测出多态性。表明花椒叶绿体基因组的SSR标记可用于花椒属Zanthoxylum不同种间的遗传多样性分析。
- 李思巧韦伊刘洪妤张志东张野王丽华刘玉林
- 关键词：花椒叶绿体基因组多态性分析
- 杏16个主要农艺性状的多元统计分析被引量：6
- 2015年
- 研究选取具有代表性的17份杏品种,应用相关性分析、主成分分析与Q型聚类分析对杏的16项主要农艺性状进行多元统计研究。结果表明,提出的5个反映杏主要农艺性状的主成分,累积方差贡献率达到87.17%。果实产量与叶长、叶宽呈极显著和显著正相关,而果实单果重与出核率之间呈极显著负相关。通过聚类分析将17个杏品种分为3组,第1组包括10个品种,核仁干重和出核率均值最高,但冠幅、树高和地径最小;第2组冠幅、树高、地径及单果果重最大;第3组叶长、叶宽、果实产量和出仁率最高。研究结果为杏品种的栽培与选育提供了数据参考。
- 陈毅琼刘玉林杨途熙魏浩华魏安智
- 关键词：农艺性状主成分分析聚类分析
