解敏敏
- 作品数：18 被引量：49H指数：4
- 供职机构：中国农业科学院烟草研究所更多>>
- 发文基金：中国烟草总公司科技项目中央级公益性科研院所基本科研业务费专项湖南中烟工业有限责任公司科技项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 绒毛状烟草和林烟草全长cDNA文库构建及EST序列分析
- 2018年
- 表达序列标签(EST)广泛应用于基因功能研究和分子标记开发。以普通烟草两个二倍体祖先种绒毛状烟草(Nicotiana tomentosiformis, TT)和林烟草(Nicotiana sylvestris, SS)多个组织为试验材料,使用CloneMiner cDNA文库构建方法构建了均一化全长c DNA文库,测序并进行序列拼接、功能注释、进化分析和标记开发。绒毛状烟草和林烟草均一化全长c DNA文库容量分别为0.72×106和1.12×106pfu/mL,重组率分别约为94%和93%,插入片段平均长度为1.4kb。测序获得20 953条EST序列,拼接为10 504个unigenes。与普通烟草EST序列混合拼接,产生34 450条contigs,123 511条singletons,烟草异源四倍体中T和S基因与绒毛状烟草、林烟草之间的相似性远高于两个二倍体祖先种之间。预测获得104 915个编码序列,其中73 670个序列包含功能结构域,81%unigenes在番茄中具有同源基因。鉴定了11 869个微卫星位点(SSR)和25 209个单核苷酸多态性位点(SNP)。这些数据信息对于烟草基因功能研究和分子育种具有重要价值。
- 孙榕陈明丽解敏敏孙玉合龚达平
- 关键词：烟草CDNA文库SSR
- 烟草叶片全长cDNA文库构建及EST序列分析被引量：5
- 2012年
- 【目的】构建烟草叶片全长cDNA文库并测序,发掘与烟叶发育、代谢和抗逆相关的基因,为进一步研究功能基因奠定基础。【方法】以烟草苗期叶片为试验材料,利用改进的Cap-trapper法构建烟草叶片全长cDNA文库。利用测序技术获得大量的EST序列,采用生物信息分析手段,对所测EST进行拼接和功能注释。【结果】构建了烟草叶片的全长cDNA文库,该文库滴度为1.2×106pfu.mL-1,平均插入片段在1.4 kb左右。利用该文库测序了5 280个克隆,获得5 233条高质量表达序列标签(EST),序列拼接出3 922个单一基因;同源比对分析表明,89.7%的基因与已知功能基因具有较高的同源性,这些基因涉及细胞生长、信号转导、翻译合成、抗逆反应和能量代谢等功能;并详细鉴定了部分与烟碱合成和抗病相关的基因。【结论】通过Cap-trapper法成功构建了高质量的烟草幼苗叶片全长cDNA文库;大规模EST测序分析挖掘到大量与烟草幼苗叶片发育、抗逆、抗病、烟碱代谢相关的侯选基因。
- 龚达平解敏敏孙玉合
- 关键词：烟草全长CDNA文库表达序列标签功能注释
- 烟草细胞色素P450的基因组学分析被引量：19
- 2013年
- 细胞色素P450是一类含血红素的单加氧酶超基因家族,在植物多种代谢途径中起着重要作用。为了解烟草中的P450的种类和数量,文章将植物代表性P450蛋白质序列与烟草基因组序列比对,在烟草基因组中鉴定了44个P450家族共263个成员。将这些烟草P450基因与烟草表达序列标签(EST)比对,发现173个成员有EST证据。通过与拟南芥中已知的P450蛋白序列比较,分析了部分烟草P450蛋白序列的特征和二级结构。根据烟草基因芯片数据和部分基因的RT-PCR结果,发现73个烟草P450基因能够在不同的生长发育时期表达,其中部分基因具有组织特异性。这些研究结果为烟草P450基因功能的深入分析奠定了基础。
- 解敏敏龚达平李凤霞刘贯山孙玉合
- 关键词：烟草细胞色素P450基因芯片
- 一种根结线虫分子鉴定引物集及其制备方法与应用
- 本发明提供了一种根结线虫分子鉴定引物集，通过如下方法获得：利用预测的南方根结线虫蛋白序列分别与南方根结线虫基因组和北方根结线虫基因组比对，设置比对序列的相似度即percent参数为75，得到单拷贝基因；将单拷贝基因蛋白序...
- 龚达平解敏敏孙玉合晁江涛
- 文献传递
- 一种鉴定或辅助鉴定待测烟草黑胫病抗性的方法
- 本发明公开了一种鉴定或辅助鉴定待测烟草黑胫病抗性的方法。该方法包括如下步骤：检测待测烟草的基因型为基因型I还是基因型II，基因型I的烟草具有或疑似具有黑胫病抗性，基因型II的烟草不具有或疑似不具有黑胫病抗性。基因型I的烟...
- 龚达平陈明丽向小华高军平郝俊杰蒲文宣徐秀红解敏敏
- 文献传递
- 一种鉴定或辅助鉴定待测烟草黑胫病抗性的方法
- 本发明公开了一种鉴定或辅助鉴定待测烟草黑胫病抗性的方法。该方法包括如下步骤：检测待测烟草的基因型为基因型I还是基因型II，基因型I的烟草具有或疑似具有黑胫病抗性，基因型II的烟草不具有或疑似不具有黑胫病抗性。基因型I的烟...
- 龚达平陈明丽向小华高军平郝俊杰蒲文宣徐秀红解敏敏
- 参与木葡聚糖合成的糖基转移酶基因研究进展被引量：9
- 2015年
- 半纤维素多糖木葡聚糖(Xy G)存在于大多数植物的初生细胞壁中,对细胞壁的结构组织和生长发育具有重要的调控作用。Xy G在植物进化中存在结构的多样性。该文概述了参与Xy G合成的糖基转移酶的最新研究进展,Xy G合成需要多种糖基转移酶参与,这些酶类很可能以蛋白酶复合体的形式存在并发挥作用,Xy G的结构和组成的改变对植物的生长发育也产生影响。
- 解敏敏晁江涛孔英珍
- 关键词：糖基转移酶细胞壁生物合成
- 烟草腺毛分泌特性相关基因Nt‑te分子标记定位及获得方法与应用
- 本发明公开了烟草腺毛分泌特性相关基因Nt‑te分子标记定位及获得方法与应用。本发明利用腺毛分泌型烤烟K326与白肋烟突变体腺毛非分泌型TI1406构建K326×TI1406F<Sub>2</Sub>杂交群体、F<Sub>...
- 陈明丽龚达平郝俊杰孙榕解敏敏
- 烟草NtHDZIV8基因在腺毛发育中的功能验证被引量：3
- 2023年
- 为验证NtHDZIV8在腺毛发育过程中的功能,在红花大金元中克隆了NtHDZIV8基因并进行生物信息学分析,通过荧光定量PCR(qRT-PCR)探究了NtHDZIV8的表达模式,进一步利用亚细胞定位与病毒诱导的基因沉默(VIGS)技术初步验证了NtHDZIV8基因对烟草腺毛发育的调控作用。结果表明,NtHDZIV8进化高度保守,具有典型的HD-LZ、START和SAD结构域,属于HDZIP IV家族。表达模式分析表明,NtHDZIV8在腺毛中高表达,并受植物激素NAA、GA3和MeJA的诱导。亚细胞定位结果显示NtHDZIV8定位于细胞核。病毒诱导本氏烟中NbHDZIV8基因沉默导致长柄腺毛的柄细胞基部膨大,而不影响短柄腺毛形态和腺毛密度。该研究表明NbHDZIV8对烟草腺毛形态具有调控作用,为解析烟草腺毛发生发育调控机制奠定了理论基础。
- 崔露莹陈明丽余文李志远巫升鑫李东徽盖梦琦解敏敏龚达平程崖芝
- 关键词：烟草腺毛基因沉默
- 一种启动子及其应用
- 本发明提供一种损伤诱导型启动子，其核苷酸序列为SEQ ID NO:1。该启动子可以用来构建真核表达载体，用于在植物中表达外源基因。本发明对烟草高效诱导型启动子的分离鉴定，能够为烟草生物反应器的研发提供实验和技术支撑。利用...
- 解敏敏王根洪夏庆友孙玉合龚达平
- 文献传递
