管德龙
- 作品数：13 被引量：34H指数：4
- 供职机构：陕西师范大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：中央高校基本科研业务费专项资金陕西省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学环境科学与工程更多>>
- 菲牛蛭肠道细菌的群落结构及功能
- 2018年
- 为了揭示肠道细菌对菲牛蛭(Hirudinaria manillensis)消化、代谢等生理活动的影响,采用二代测序技术测定了三个菲牛蛭个体肠道细菌的群落结构并推断了其功能。结果共鉴定出细菌7门,16纲,24目,29科,36属,40个操作分类单元(operation taxonomic units,OTUs);其中优势属分别为色杆菌属(Chromobacterium)、甲基菌属(Methylovorus)和Jonquetella。采用PICRUSt软件对菲牛蛭肠道细菌进行功能预测,结果显示其主要功能依次是膜转运、碳水化合物代谢、氨基酸代谢、细胞迁移、能量代谢、基因复制和修复、辅酶因子和维生素代谢、外源物质降解、细胞进程和信号转导等。
- 刘宇张秀秀管德龙王晓雯许升全
- 关键词：肠道细菌
- 柑橘属SAUR基因家族的全基因组鉴定及表达分析被引量：13
- 2020年
- 分析SAUR(Small auxin up-regulated RNA)基因家族在不同柑橘基因组中的数量、连锁群分布、基因结构、系统进化、基因表达模式等,从香橼、柚、莽山野橘和克里曼丁橘等基因组中分别鉴定到69、62、58和70个SAUR基因。SAUR在基因组上分布不均,呈现明显的串联重复现象,基因家族成员的差异可能是由于串联重复和染色体大片段复制引起。大多数柑橘SAUR基因不含内含子,含有SAUR特有的4个保守motif。系统进化树分析显示,来源于拟南芥、水稻、番茄、马铃薯和柑橘的629个SAUR基因分为9组,每一组都含有5个物种的家族成员,并且同一个物种的SAUR基因具有较近的遗传距离。顺式元件分析表明,CclSAUR基因家族成员的上游序列含有光响应、转录因子结合、激素响应、伤害响应、低温响应、玉米素代谢和类黄酮生物合成相关的元件。q RT-PCR分析结果显示,大多数CclSAUR都能响应外源IAA和低温处理。
- 王福生余洪胡洲管德龙张盼朱世平赵晓春
- 关键词：柑橘属基因表达
- 果蝇DNA及组蛋白甲基化与寿限
- 2012年
- 物种寿限受多种因素调控,根据现有假说,DNA甲基化与组蛋白甲基化对寿限起主动作用,并引起特征性形态学改变及衰老性生长停滞。果蝇中DNA甲基化系统包含唯一的甲基转移酶dDNMT2及唯一的甲基结合蛋白MBD2/3,二者均显示其在结构上的广泛保守性,且表达的时期恰好与检测到DNA甲基化的时期高度一致,具有影响胚胎发育、染色体重塑、反转录转座子沉默等重要功能。果蝇中组蛋白甲基转移酶SETDB1和Su(VAR)3-9诱导的H3K9甲基化对DNA甲基化可能在上游起指导作用。H3K4甲基化与H3K27甲基化分别起活化与沉默作用,与DNA甲基化有协同或阻遏效应,越来越多的研究证实果蝇正常寿命的维持与H3K4及H3K27之间的调控密切相关,因此H3K4与H3K27的甲基化模式是新的研究热点。文章对果蝇DNA甲基化及组蛋白甲基化对于果蝇寿限影响的研究进行了综述。
- 管德龙梁露张敏
- 关键词：果蝇寿限DNA甲基转移酶甲基结合蛋白
- 小鲵科动物Cytb基因密码子偏好性分析被引量：5
- 2016年
- 利用Mobyle在线工具的CUSP程序以及CodonW、Cluster3.0软件对NCBI数据库中16种小鲵科动物的细胞色素b（Cytochrome b,Cytb）基因密码子偏好性进行了分析,并探讨密码子偏好性对系统发育分析的影响。结果表明：16种小鲵科动物Cytb基因的有效密码子数范围为34.45~47.18,平均值为41.01,该基因有密码子使用偏好。该基因在组成上偏好使用以A或T碱基结尾的密码子。通过计算各物种每个密码子的同义密码子相对使用度值并做密码子和物种的分层聚类发现,在不同属间密码子使用的模式明显不同。基于Cytb基因密码子偏好性的物种聚类结果与基于Cytb基因序列构建的最大似然法和贝叶斯系统发育树结果不完全一致。
- 姜艳张全星管德龙许升全
- 关键词：小鲵科细胞色素B基因密码子偏好性系统发育
- 水蛭肠道微生物的研究进展被引量：2
- 2015年
- 水蛭(蚂蝗)是一种重要的中药材,其唾腺分泌的水蛭素具有抗凝血作用,被广泛应用于医疗手术和心血管疾病治疗,具有较高的医疗价值与经济价值。水蛭肠道微生物与水蛭的消化、营养、免疫和抗菌等功能密切相关,也可能与水蛭素的分泌有关。对水蛭肠道微生物的研究方法、菌群组成及作用等方面的研究进展进行了综述,以期为水蛭肠道微生物的深入研究和利用提供理论和方法参考,为推动水蛭养殖业发展和扩展水蛭和水蛭素的医学应用提供理论基础。
- 陈亚莉王贵虎张全星管德龙
- 关键词：水蛭肠道微生物研究方法
- 线粒体DNA及相关基因与衰老的关系被引量：4
- 2016年
- 线粒体是存在于绝大多数真核细胞内的一种基本功能细胞器,是细胞进行氧化磷酸化的场所。线粒体DNA（mt DNA）属于真核细胞核外遗传物质,结构简单,位于线粒体基质中,有时与线粒体内膜结合存在。大多数多细胞生物的mt DNA都是以共价、闭合的环状分子形式存在。不同物种的mt DNA大小悬殊,一般植物mt DNA较大,
- 莫菲管德龙韩燕张敏
- 关键词：线粒体DNA多态性衰老
- 重金属镉诱导果蝇DNA甲基化相关基因表达改变及数字基因表达谱分析
- 镉（Cadmium,Cd）作为重要的重金属污染物,近年来已成为热门研究课题。镉被广泛应用于制造镍镉电池、颜料、合金和电镀等行业,导致每年有大量的镉通过工业活动排入环境,经由雾霾、污水、食物链等途径后大量积累,进入人体并危...
- 管德龙
- 关键词：黑腹果蝇细胞凋亡相关基因
- 文献传递
- 三种水蛭全基因组精细图谱构建及其抗凝血机制演化研究
- 水蛭(Leech)俗称蚂蟥,是环节动物门蛭纲动物的统称。营外寄生生活,短暂寄生于鱼类、爬行类、哺乳类的体表,吸血为食;或取食软体动物。其中吸血种类因在吸血过程中产生高效的抗凝血活性物质而被中、西医广泛应用于临床治疗血栓性...
- 管德龙
- 关键词：水蛭基因组学抗凝血酶
- 文献传递
- dDnmt2与dMBD2/3在果蝇不同发育时期的转录表达
- 2012年
- 为了深入了解果蝇DNA甲基化修饰系统及其相关基因的表达特点及功能,以黑腹果蝇Canton S品系为材料,应用实时荧光定量PCR方法检测分析不同发育时期果蝇dDnmt2与dMBD2/3基因的转录表达.结果表明:dDnmt2与dMBD2/3分别在6～9 h和0～3 h胚胎期表达量最高,在12～15 h和18～21 h胚胎、三龄幼虫、蛹、成虫期表达明显降低.果蝇dDnmt2和dMBD2/3基因的表达特点与果蝇不同发育时期基因组DNA甲基化水平相一致.
- 毛雪梁露管德龙张敏
- 关键词：黑腹果蝇DNA甲基转移酶甲基结合蛋白
- 镉对果蝇寿命及生殖力的影响及其可遗传性分析被引量：5
- 2013年
- 为探讨镉胁迫对果蝇寿命及生殖力的影响,以及这种影响是否具有可遗传性,应用生存试验及统计分析方法分析不同质量浓度（7.5 mg/L、15.0 mg/L、30.0 mg/L、60.0 mg/L）镉对经口染毒后黑腹果蝇（Drosophila melanogaster）Canton-S品系亲代（F0代）及其未经镉处理的子一代（F1代）寿命和生殖力的影响。结果表明,与对照组（未处理组）相比,经不同质量浓度镉处理后的F0雌、雄果蝇平均寿命、中间寿命和最高寿命均显著缩短,且呈现质量浓度依赖性,其中最大质量浓度组（60.0 mg/L）的果蝇寿命与对照组相比缩短了约80%,而未经镉处理的F1代也出现寿命缩短现象;亲代（F0代）镉处理组所产子代的羽化数量减少,且与对照组相比,高质量浓度组（15.0 mg/L、30.0mg/L、60.0 mg/L）果蝇的羽化数量减少30%~40%,差异显著且具有质量浓度依赖效应。研究表明,镉对果蝇具有一定的毒性效应,可使果蝇寿命缩短,并且这种影响可延续至F1代,同时会使果蝇生殖力减弱。
- 梁露毛雪管德龙张敏
- 关键词：遗传学镉黑腹果蝇生殖力
