石米娟
- 作品数:19 被引量:31H指数:3
- 供职机构:中国科学院水生生物研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划中国科学院知识创新工程重要方向项目更多>>
- 相关领域:农业科学生物学自动化与计算机技术经济管理更多>>
- 基于亲本基因型与子代表型的全基因组关联分析方法
- 本发明公开了一种基于亲本基因型与子代表型的全基因组关联分析方法,包括以下步骤:获取待分析群体的亲本基因型、子代表型以及子代父母本信息,根据亲本对的基因型建立子代的组合基因型矩阵,获得每个SNP位点不同子代的可能基因型组合...
- 夏晓勤石米娟张婉婷程莹寅
- 沙棘在防治豆粕饲料引起的鱼类肠肝炎症中的应用
- 本发明公开了沙棘在防治豆粕诱导的鱼类肠炎和肝脏炎症中的应用,结合草鱼疾病建模的肠组织转录组结果与整合生物信息学分析,推测沙棘是潜在的防治豆粕诱导肠肝炎症的药物;经斑马鱼动物试验证明,沙棘果粉或果油通过饲料添加,抑制肠道炎...
- 夏晓勤吴南黎明石米娟程莹寅张婉婷
- 文献传递
- 基于微单体型分子标记的草鱼亲子鉴定方法被引量:3
- 2020年
- 研究选择一种新型分子标记--微单体型用于亲子鉴定,构建了高效的标记筛选和亲子鉴定流程,并以草鱼(Ctenopharyngodon idellus)为例评估了该亲子鉴定方法的效果。结果表明,利用基因组重测序数据能够准确完成微单体型标记的分型,效果和适应性明显优于传统的基于群体遗传学推断的分型;通过信息熵的大小能够高效筛选微单体型标记组合, 3个和5个微单体型标记的亲子鉴定结果与微卫星序列(SSR)鉴定结果的一致性分别达到97.08%和99.42%。研究表明使用微单体型分子标记可以快速而准确地完成鱼类的亲子鉴定工作。
- 夏雷夏雷石米娟段攸张婉婷吴南夏晓勤
- 关键词:亲子鉴定草鱼高通量测序
- 青藤碱在防治豆粕饲料引起的鱼类肠肝炎症中的应用
- 本发明公开了青藤碱在防治豆粕诱导的鱼类肠炎和肝脏炎症中的应用,结合草鱼疾病建模的肠组织转录组结果与整合生物信息学分析,推测青藤碱是潜在的防治豆粕诱导肠肝炎症的药物;经斑马鱼动物试验证明,青藤碱通过饲料添加,抑制肠道炎症,...
- 夏晓勤吴南黎明石米娟程莹寅张婉婷
- 草鱼Ⅰ型微卫星标记的发掘及其多态性检测被引量:11
- 2011年
- 表达序列标签(EST)是发掘Ⅰ型微卫星标记的重要资源。研究运用生物信息学方法,从草鱼头肾组织3027条EST序列中搜索到322个微卫星位点,占整个EST数据库的10.6%。其中,二核苷酸重复位点151个(46.9%),三核苷酸重复位点137个(42.5%),四、五、六核苷酸重复位点较少;在二核苷酸重复位点中,AC/GT重复位点最为丰富,占二核苷酸重复位点总数的50.3%,AG/CT重复次之,占二核苷酸重复位点总数的40.4%,AT和GC重复较少。10个微卫星位点的多态性检测结果显示,4个位点在草鱼测试群体中呈多态性,多态性位点的平均多态信息含量(PIC)和平均遗传杂合度(H)分别为0.5236和0.5441,其中,2个多态性位点的PIC值大于0.5,呈现高度多态性特征。Ⅰ型微卫星标记将为草鱼遗传连锁图谱构建和QTL分析提供有效的基因分子标记。
- 李偲刘航黄容李华英石米娟廖兰杰朱作言汪亚平
- 关键词:草鱼微卫星标记多态信息含量
- 一种基于人工智能实现的鱼类体表多尺寸测量方法
- 本发明公开了一种基于人工智能实现的鱼类体表多尺寸测量方法,采集鱼类图片,鱼类图片背景中包括比例尺;对于鱼类图片进行标注,将鱼类图片和对应的标签作为一个样本,生成训练数据集和验证数据集;将训练数据集输入到深度学习模型,对深...
- 夏晓勤曹丹莹石米娟张婉婷程莹寅
- 一种直接从全基因组重测序数据中得到微单体型及其分型的方法
- 本发明公开了一种直接从全基因组重测序数据中获取微单体型及其分型的方法,包括以下步骤:获取待测个体的全部SNP位点信息,根据测序深度筛选SNP位点,获得全基因组范围的微单体型及其信息,针对待测个体上有两种及以上分型情况的二...
- 夏晓勤夏雷石米娟段攸张婉婷程莹寅吴南
- 一种筛选用于二倍体群体亲子鉴定的分子标记组合的方法
- 本发明公开了一种从给定二倍体物种亲本群体的分子标记中筛选用于亲子鉴定的标记组合的方法,包括以下步骤:将所有亲本对作为树状结构的根节点,依据各亲本对所有可能产生的子代的分型,将亲本对进行分类构建子节点,所获得的子节点中亲本...
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- 文献传递
- 寄生于鲫的锚首虫一新种被引量:1
- 2018年
- 文章报道了寄生于鲫(Carassius auratus)鳃部的锚首虫一新种,鲫锚首虫(Ancyrocephalus carassii sp.nov.)。该虫几丁质结构与寄生于鳜(Siniperca chuatsi)的河鲈锚首虫(A.mogurndae)在整体上很相似,尺寸略大,但鲫锚首虫的背联结棒上有两个突起,背中央大钩基部较后者更粗壮,且在近钩顶处有一明显的小凹。这是首次在鲫上发现锚首虫科(Ancyrocephalidae)单殖吸虫的寄生。
- 夏晓勤黄晓丽石米娟程莹寅张婉婷陆承平
- 关键词:单殖吸虫
- 一种基于人工智能实现的鱼类体表多尺寸测量方法
- 本发明公开了一种基于人工智能实现的鱼类体表多尺寸测量方法,采集鱼类图片,鱼类图片背景中包括比例尺;对于鱼类图片进行标注,将鱼类图片和对应的标签作为一个样本,生成训练数据集和验证数据集;将训练数据集输入到深度学习模型,对深...
- 夏晓勤曹丹莹石米娟张婉婷程莹寅