徐磊
- 作品数:10 被引量:19H指数:3
- 供职机构:暨南大学生命科学技术学院生态学系更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金全球变化研究国家重大科学研究计划国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域:生物学环境科学与工程农业科学理学更多>>
- 中国秀体溞属常见种类记述被引量:3
- 2011年
- 秀体溞是枝角类中重要的属,其分类一直存在较大分歧。目前我国秀体溞属有10个种,即短尾秀体溞Diaphanosomabrachyurum Lievin,1848、兴凯秀体溞D.chankensis Ueno,1939、奥氏秀体溞D.orghidani Negrea,1982、模糊秀体溞D.dubiumManujlova,1964、杜蒙特秀体溞D.dumonti Korovchinsky,1996、镰角秀体溞D.excisum Sars,1885、蒙古秀体溞D.mongolianumUeno,1938、多刺秀体溞D.sarsi Richard,1894、大眼秀体溞D.macrophtalma Korovchinsky&Mirabdullaev,1995、热带秀体溞D.tropicum Korovchinsky,1998。在综合现有文献和研究模式标本的基础上,建立了上述10个种的分类检索表,并对我国最为常见的4个种:短尾秀体溞D.brachyurum Lievin,1848、奥氏秀体溞D.orghidani Negrea,1982、模糊秀体溞D.dubium Manujlova,1964、镰角秀体溞D.excisum Sars,1885的形态特征和地理分布进行了详细描述。分析了目前我国与国际在秀体溞分类上的一些异同,讨论了我国秀体溞分类中存在的同名异种或同种异名的问题。
- 陈花林秋奇徐磊韩博平
- 两种提取枝角类休眠卵基因组DNA方法的比较被引量:3
- 2014年
- 休眠卵是枝角类在环境胁迫条件下通过有性生殖形成的,休眠卵的孵化对种群补充与恢复有着重要作用.沉积于底泥中的休眠卵保存了不同阶段的种群遗传信息,有效地提取枝角类休眠卵基因组DNA是进一步研究水体枝角类遗传多样性的关键环节.采用目前国际上使用的氯仿异戊醇提取法和玻璃乳提取法分别对流溪河水库底泥中表层和底层的盔型溞(Daphnia galeata)休眠卵进行基因组DNA提取的比较分析.结果显示,氯仿异戊醇提取法成功率为27.5%,平均浓度为14.25±1.84 ng/μl;玻璃乳提取法成功率为65.0%,平均浓度为28.37±2.56 ng/μl.无论是提取成功率还是提取浓度玻璃乳提取法都显著高于氯仿异戊醇提取法,且玻璃乳提取法所用试剂少,不涉及有毒试剂,操作步骤简单,整个提取过程所用时间短,玻璃乳提取法提取枝角类休眠卵基因组DNA是一种快捷实用的方法.
- 徐磊李思嘉王晟韩小玉韩博平
- 关键词:休眠卵DNA提取
- 西藏湖泊长刺溞复合种的系统进化关系
- 2015年
- 本文通过对西藏湖泊长刺溞复合种(Daphnia longispina complex)中分布最广的3个物种,即长刺溞(D.longispina)、盔形溞(D.galeata)和颈齿溞(D.dentifera)线粒体COI基因序列以及Gen Bank中欧洲的长刺溞、加拿大的颈齿溞和我国东部低海拔地区的盔型溞COI基因序列的比较分析,研究了西藏湖泊长刺溞复合种的系统进化关系,发现西藏地区的盔型溞、颈齿溞和长刺溞均已出现较大分化。颈齿溞种群内遗传差异度为0.33–2.32%,盔型溞为0.33–2.74%,长刺溞的遗传差异度最高,为1.31–5.50%。基于COI基因序列构建的最大似然树和贝叶斯系统树均表明,长刺溞复合种由3个进化分支组成,分别对应长刺溞、盔型溞和颈齿溞,三者之间的遗传差异度为9.40–16.98%(Kimura 2-parameter双参数模型)。基于COI基因单倍型(haplotype)所构建的网络关系也支持上述3个分支的存在。早期记录虽然显示长刺溞在我国分布较广,但本次调查只在班公错有发现,相比之下,盔形溞和颈齿溞则分布更广。我们的研究表明,由于形态学鉴定上的局限性,早期的长刺溞记录很可能混杂了容易引起混淆的盔型溞或颈齿溞。
- 谢理丽徐磊林秋奇韩博平
- 关键词:线粒体基因系统进化
- 模糊秀体溞(Diaphanosoma dubium)和奥氏秀体溞(D.orghidani)在广东水库中的分布特征被引量:1
- 2011年
- 秀体溞(Diaphanosomaspp.)是华南地区水库中枝角类的优势属.于2000年对广东省19座大中型水库丰水期和枯水期2次采样和2001-2006年对飞来峡水库、新丰江水库和大镜山水库分别进行了16、12和7次采样.这19座水库的样品中,5座水库仅有模糊秀体溞(D.dubium),8座水库仅有奥氏秀体溞(D.orghidani),2个种在6座水库中同时存在.模糊秀体溞与奥氏秀体溞所占居的生境有明显差异,以模糊秀体溞为优势种的水体主要为富营养化水库,以奥氏秀体溞为优势种的水体则多为贫营养水体.在数量上,丰水期秀体溞的丰度高于枯水期.模糊秀体溞和奥氏秀体溞在形态、食物需求和对鱼类捕食的逃避能力上的差别决定了它们在水库中的分布差异.
- 陈花程丹徐磊林秋奇韩博平
- 关键词:种群分布水库
- 西藏湖泊长刺溞复合种(Daphnia longispina complex)系统进化关系分析
- 本文通过对西藏湖泊长刺潘复合种(Daphnia longispina complex)中分布最广的三个物种(长刺潘Daphnia longispina、盔形潘Daphnia galeata、颈齿溞Daphnia dent...
- 谢理丽徐磊林秋奇韩博平
- 关键词:COI基因
- 广东流溪河水库盔型溞(Daphnia galeata)休眠种群与现生种群的单倍型多样性和遗传分化被引量:3
- 2017年
- 休眠卵库作为淡水枝角类生物与遗传信息的储藏库,从沉积物休眠卵库中萌发的枝角类对现生种群的数量与种群遗传结构有着直接的影响.分别采集流溪河水库盔型溞的现生种群和沉积物表层(0~10 cm)的休眠卵,扩增现生种群与休眠卵的线粒体细胞色素C氧化酶亚基I基因,构建了单倍型网络.休眠种群相比现生种群有着较高的单倍型多样性和核酸多样性,初期现生种群分别为0.562、0.00104,末期现生种群分别为0.726、0.00331,休眠种群分别为0.815、0.00761.流溪河盔型溞现生种群与休眠种群存在双向基因流,现生种群到休眠种群的有效迁移率为490.9,休眠种群到现生种群的有效迁移率为527.5.通过构建贝叶斯系统树验证了休眠种群和现有种群中并不存在隐种或者亚种的分化,休眠种群与现生种群之间没有出现较大的遗传分化,现生种群遗传多样性来自于休眠种群,水库的休眠种群更能反映种群真实的遗传多样性.休眠种群与现生种群之间的基因流与休眠卵库大小无关,与休眠卵的萌发有关.
- 黄琦徐少林徐磊韩博平
- 关键词:基因流
- 盔型溞(Daphnia galeata)四个地理种群遗传多样性及分化的RADP分析被引量:2
- 2015年
- 利用RAPD技术对采自云南和广东省的盔形溞的四个不同地理种群(拉市海、程海、洱海和流溪河水库)遗传多样性进行了分析。从20条寡聚核苷酸中筛选出了12条扩增产物稳定的随机引物。在4个群体180个个体中共检测到72个可重复位点,其中多态位点65个,多态率超过90%。四个种群的遗传多样性指数(Shannon指数)介于0.405—0.440之间,其中以流溪河水库群体遗传多样性最高,拉市海群体遗传多样性最低。四个不同地理的盔形溞种群间的遗传分化系数Gst为0.23。分子方差分析(AMOVA)表明,四个地理种群内的分子变异为71%,种群之间为29%,说明4个地理种群之间的遗传分化水平较高;云南三个种群内变异为70%,种群之间的变异为30%,说明距离较近云南省内的3个湖泊种群内存在较大的遗传变异,以上分子方差分析中P值为0.001,表明差异极显著(P<0.01)。Jaccard距离和Nei’s无偏遗传距离分析显示,地理距离最近的程海种群(CH)与拉市海种群(LS)并未首先聚在一起,而是与洱海种群(EH)聚在一起,之后与地理距离最远的流溪河种群(LX)相聚;种群分化与距离之间的弱相关性支持资源垄断假说。
- 谢理丽徐磊任晶晶徐少林韩博平
- 关键词:种群分化RAPD分析
- 以端粒酶为靶标的抗肿瘤药物设计合成及活性研究
- 徐磊
- 关键词:钌多吡啶配合物相互作用端粒酶
- 新亚种—中华拟同形溞(Daphnia similoides sinensis)被引量:7
- 2013年
- 记述了一种溞属新亚种:中华拟同形溞Daphnia similoides sinensis,模式标本保存在暨南大学水生生物研究所。在蒋樊治先生的《淡水枝角类》等中国文献中,该种被描述为隆腺溞,直至最近几年才陆续有中国学者报道了中国的拟同形溞,并有较多有关该种的生物学与生态学研究,但一直未见其形态学的研究结果。除此之外,仅台湾学者YOUNG Shuh-Sen公布了台湾的拟同形溞的COI序列。中华拟同形溞与已知印度的Daphnia similoides主要区别在于其雄性第一触角上的嗅毛较短、鞭毛分节不同,鉴于雄性第一触角在分类学上的重要性,将其划分为新亚种。该亚种的COI基因序列与已知台湾的D.similoides有99%的相似度。比较了广东、安徽、浙江和江苏等地的D.similoides种群,它们仅在第一触角处有细微差别。
- 顾杨亮徐磊林秋奇Henri J.Dumont韩博平
- 关键词:形态学COI序列
- 广东流溪河水库表层沉积物中枝角类休眠卵的多样性及空间分布被引量:4
- 2011年
- 为了解华南地区深水水库中枝角类休眠卵在底泥中的种群特征,于2009年2月对广东省流溪河水库沉积物中的枝角类休眠卵种类、数量和分布进行研究。在湖泊区、过渡区和河流区共设置8个采样点,采集表层15 cm柱状底泥,经600、200和35μm三种孔径的网筛分离休眠卵后显微镜下计数。15cm样品根据柱状底泥的纹层确定为18~24年的沉积物。共检出12种枝角类休眠卵,河流区采样点未检出,两条入库河流汇合区种类数为10,其余采样点有4至5种。15 cm沉积物中休眠卵的平均密度为1.3x105 ind.·m。休眠卵的多样性及密度分布特征与生境相关,过渡区底泥中的多样性高于湖泊区,但湖泊区底泥中密度高。卵库中的优势种类为微型裸腹溞(Moina micrura)、船卵溞属(Scapholeberis sp.)和溞属(Daphnia sp.),均为逃避能力弱的种类。流溪河位于热带北缘,水温常年较高,多数枝角类可通过孤雌生殖终年存在于水体中,导致休眠卵的种类数量与密度均明显地低于温带湖泊。
- 韩小玉徐磊陈向韩博平
- 关键词:休眠卵枝角类多样性生境水库