李晋 作品数:31 被引量:32 H指数:3 供职机构: 哈尔滨工业大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家教育部博士点基金 国家高技术研究发展计划 更多>> 相关领域: 自动化与计算机技术 生物学 医药卫生 经济管理 更多>>
一种面向制造领域的MDA建模工具的实现方法 一种面向制造领域的MDA建模工具的实现方法,它涉及制造领域和信息技术领域。它解决了现有的建模工具缺乏支持建模语言演化和定义新建模语言的能力从而无法满足制造领域建模需求的问题,本发明的方法包括步骤一:建立基于元对象机制MO... 战德臣 徐晓飞 聂兰顺 李晋统计遗传学精品课建设探索与实践 被引量:1 2010年 统计遗传学是生物信息专业的主干课程,同时也是生物信息学的一个重要方向。在生物信息学迅猛发展的今天,统计遗传学精品课程的建设工作尤为重要。在《统计遗传学》精品课建设过程中,我们在师资队伍、教学改革和教材建设、科研教学相结合、突出培养目标、精品课程网络平台建设等几个方面进行了探索与实践,并达到比较好的效果。这对于同领域相关课程的建设具有一定的指导意义。 张明明 张瑞杰 李晋 吕洪超关键词:统计遗传学 精品课 课程建设 教学改革 SVM与主动学习方法相结合的蛋白质相互作用预测 被引量:2 2014年 提出了基于SVM的主动学习算法,用来解决蛋白质相互作用的预测问题。细胞中的生物过程是通过蛋白质相互作用实现的。但是通过实验验证蛋白质之间是否具有相互作用的代价非常大,而且数据很难获取。为了在有限的阳性样本情况下更加快速准确地预测蛋白质之间是否具有相互作用,引入了主动学习方法。主动学习算法可以用来构造有效训练集,其目标是通过迭代抽样,每次寻找最富有信息量的数据点,找到最有利于提升分类效果的样本,进而减小分类训练集的大小。比较了5种不同的主动学习算法,以寻找在有限资源前提下提高分类算法效率的最佳途径。实验表明,主动学习方法与SVM算法相结合,能够在保证SVM分类性能的前提下,有效减少学习所需的样本数量。 史文丽 郭茂祖 李晋 刘晓燕关键词:支持向量机 蛋白质相互作用 利用eQTL构建基因-基因网络挖掘类风湿性关节炎风险基因 2014年 目的:类风湿性关节炎是一种全身的慢性炎症型疾病,可能影响许多组织和器官,主要发作于灵活的关节。全世界人群中大约有1%会患有类风湿性关节炎。目前已经证实了一些基因与类风湿性关节炎相关,但是这些基因只能解释一小部分遗传风险,因此我们需要新的策略和方法来解决这个问题。方法:表达数量性状位点(eQTL)是指能够调控基因或蛋白质表达的基因组位点,本文采用了eQTL数据构建基因-基因网络并挖掘候选类风湿性关节炎风险基因。结果:首先,利用eQTL数据,基于基因之间的共调控系数,建立基因-基因网络,我们建立了5个不同阈值(0、0.2、0.4、0.6和0.8)的基因-基因网络;然后,在OMIM和GAD数据库中搜索已经证实的与类风湿性关节炎相关的186个基因;最后我们将已证实与类风湿性关节炎相关的186个基因分别投入到这5个网络中,利用基因与基因之间的相关性来挖掘到一些可能与类风湿性关节炎相关的候选风险基因。结论:本文基于eQTL构建了基因-基因网络,结合已知类风湿性关节炎风险基因,挖掘未知风险基因,得到了较好的结果,证明了本方法的有效性,且对于类风湿性关节炎的发病机制研究具有重要价值。除了类风湿性关节炎外,本方法还可推广到其它复杂疾病中,因此本方法对人类复杂疾病的研究具有很强的学术理论价值和应用价值。 张卓然 毕小慢 李晋 王丽美关键词:类风湿性关节炎 功能注释 一种支持MDD的ICES-Modeling建模语言和建模工具 2014年 随着模型驱动体系结构的理论和技术的不断发展,模型已成为软件开发的核心元素。因此,支持模型驱动体系结构的建模语言和建模工具成为研究热点。本文提出一种支持模型驱动的软件开发的ICES-Modeling建模语言,该语言融合了现有的建模方法的一些思想,可以有效地描述领域内的概念,概念与概念之间的关系。还针对该建模语言,设计并开发了建模工具,该建模工具具有支持建模语言的定义,方便模型的理解,支持多角度建模等特点。 李晋 战德臣 聂兰顺关键词:模型驱动体系结构 生物信息学专业《统计遗传学》课程建设探索与实践 被引量:1 2009年 探讨了统计遗传学课程建设的若干问题,总结了我校生物信息学专业统计遗传学课程建设现状及特色,并提出了下一步需要完善的工作。本文对统计遗传学学科建设具有一定的指导作用。 李晋 张瑞杰 张明明 吕洪超关键词:生物信息学 统计遗传学 课程建设 支持ERP模型输出的可配置文档生成器 2006年 在建立ERP业务模型之后,需要将其进行文档化输出,以协助ERP系统设计与开发人员理解模型并快速开发系统。分析了ERP模型的文档化需求,提出了一种基于页结构的ERP文档模型,建立文档与ERP模型之间的映射关系,并提出了基于XML的文档描述语言DDL。在此基础上,设计了一种文档生成器,通过标准文档模板配置以满足文档格式与内容的个性化需求,通过将ERP模型数据自动写入标准模板以自动生成DDL文档和最终Word文档。 战德臣 王忠杰 徐晓飞 李晋关键词:文档模型 可配置性 可扩展标记语言 SNP-基因关联网络的功能特征研究 从人类基因组计划完成到最近的人类基因组单体型图确定,全基因组关联分析研究变得越来越强大。
本文首次采用了GAW15中的一套正常人群的SNP基因型与基因表达数据。用方差组分的关联分析模型进行研究,并构建了SNP—... 李晋关键词:SNP 全基因组关联分析 关联网络 转录因子 基于信息增益理论的整体基因中基因互作挖掘方法 2015年 复杂疾病一般由多个基因共同作用发生,单个基因的效应微小,为了更好地研究基因互作对复杂疾病的影响,提出了一种基于基因的信息增益模型。信息增益在分类系统中指变量为分类带来信息的多少,带来的信息越多,该变量对分类越重要。该模型从一个整体基因的所有单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphism,SNP)出发,采用病例-对照数据来检测基因互作对疾病的影响。由于基因是功能表达的最小单位,与基于SNP的交互作用分析方法相比,该模型更能从生物学的角度解释疾病的遗传机制。最后,采用模拟数据和类风湿性关节炎疾病的真实数据进行实验,并与基于SNP的熵模型以及基于基因的核典型相关分析模型(kernel canonical corelation based U statistic,KCCU)两种模型比较,结果均验证了该模型的有效性。 黄冬丽 郭茂祖 李晋 刘晓燕 王春宇关键词:复杂疾病 基因互作 信息增益 银纳米结构及银微纳米球光纤的光学特性 在微纳米尺寸的金属结构或者粒子表面激发,基于表面等离子体共振(SurfacePlasmonResonance,SPR)效应的消逝场,对外界环境变量和结构自身参数的变化非常敏感。金属纳米结构可以突破常规光学器件的衍射极限,... 李晋关键词:表面等离子体共振 光学特性