徐海燕 作品数:45 被引量:138 H指数:6 供职机构: 内蒙古农业大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家高技术研究发展计划 国家现代农业产业技术体系建设项目 更多>> 相关领域: 轻工技术与工程 生物学 农业科学 医药卫生 更多>>
测序技术的研究进展及三代测序的应用 被引量:14 2016年 简述了一代和高通量测序技术的基础上重点介绍以单分子实时测序为代表的第三代测序技术及其他的应用,并对单分子测序技术和未来发展方向进行展望。 乌日拉嘎 徐海燕 冯淑贞 孙志宏 孟和毕力格 张和平关键词:高通量测序技术 不同地区自然发酵乳中乳酸乳球菌多位点序列分型研究 本研究以分离自内蒙古赤峰市、巴彦淖尔市、呼伦贝尔市、锡林郭勒盟和鄂尔多斯市,西藏自治区、青海省、云南省、四川省、甘肃省和蒙古国的204株乳酸乳球菌为研究对象,应用多位点序列分型技术,通过双向测序技术获得dnaA、pyrG... 徐海燕关键词:乳酸乳球菌 多位点序列分型 文献传递 利用看家基因序列构建干酪乳杆菌及其近缘物种的系统发育分析 [背景]16S rRNA基因序列分析已广泛应用于细菌的分类鉴定,但是存在一定局限性,而使用看家基因作为分子标记在近缘种及亚种间的系统发育分析中具有其独特的优势.[目的]研究16S rRNA、uvrC(核酸外切酶ABC,C... 多拉娜 宋宇琴 李伟程 李晶 徐海燕 孙志宏 张和平关键词:干酪乳杆菌 系统发育分析 肠膜明串株菌及其近缘种部分管家基因的系统发育分析 肠膜明串珠菌是隶属于明串珠菌属的乳酸菌菌种,具有抗氧化、高产酸和拮抗致病菌等能力.本文利用管家基因dnaA、rpoB 作为分子标记对分离自传统乳制品中的8株Leuconostoc mesenteroides(Leu.me... 冯淑贞 徐海燕 宋宇琴 孙志宏 张和平关键词:肠膜明串珠菌 系统发育分析 基因 DNAA RPOB 肥胖人群肠道细菌多样性研究 被引量:18 2018年 目的:研究长期高脂饮食为主的肥胖个体的肠道细菌多样性,比较不同健康状态的肥胖者肠道菌群的差异。方法:对14个肥胖个体根据健康状况分为3组(健康组,H组;胃肠道疾病组,D组;慢性病组,T组),提取3组样品粪便细菌宏基因组DNA,扩增其16S r RNA基因全长序列,利用三代测序技术测定样品宏基因组DNA的16S r RNA基因全长序列,采用相关生物信息学与统计学方法分析。结果:肥胖个体肠道细菌多样性降低,高丰度细菌含量增加,低丰度细菌含量减少,拟杆菌属是肥胖人群肠道细菌中含量最高的菌属。慢性病肥胖患者肠道菌群的B/F值(拟杆菌门/厚壁菌门)降低,同时产气柯林斯菌和Lachnospira peotinoschiza的相对含量显著高于健康组的肥胖个体(LDA>2)。此外,患有腹泻等胃肠道疾病的肥胖个体(D组)变形菌门下的一些致病菌相对含量增加。结论:肥胖个体的健康状态影响其肠道菌群结构和组成,肥胖引发的不同并发症可能与肠道菌群相关。 徐海燕 马慧敏 王彦杰 赵飞燕 刘亚华 海棠 张和平 孙志宏关键词:肥胖 肠道细菌 高脂饮食 利用看家基因序列构建干酪乳杆菌及其近缘物种的系统发育分析 【背景】16S rRNA基因序列分析已广泛应用于细菌的分类鉴定,但是存在一定局限性,而使用看家基因作为分子标记在近缘种及亚种间的系统发育分析中具有其独特的优势。【目的】研究16S rRNA、uvr C(核酸外切酶ABC,... 多拉娜 宋宇琴 李伟程 李晶 徐海燕 孙志宏 张和平关键词:干酪乳杆菌 系统发育分析 文献传递 主食变换对蒙古国志愿者肠道菌群的影响 膳食是影响肠道菌群的重要因素,目前膳食对肠道菌群的影响机制依然尚未明确。因此,为深入了解膳食对肠道菌群的影响,本研究开展了对蒙古国志愿者连续三周主食变换干预的试验以探究不同种类碳水化合物对肠道菌群的影响。本试验以7天为一... 李晶 侯强川 张家超 徐海燕 孙志宏 孟和毕力格 张和平关键词:肠道菌群 SHOTGUN 文献传递 高脂饮食对雄性SD大鼠肠道菌群的影响 被引量:26 2012年 目的探讨通过膳食饲喂高脂饲料诱发的高脂血症大鼠肠道菌群结构的变化。方法 24只SD(Spra-gue Dawley,SD)雄性大鼠随机分为A、B两组,分别连续饲喂基础饲料和高脂饲料42 d,并于第0、9、18、30和42天采集大鼠粪便,应用DGGE(Denaturing gradient gel electrophoresis)和q-PCR技术对肠道菌群进行定性定量分析。结果第42天时A、B组大鼠血清总胆固醇值(TC)分别为(2.01±0.14)mmol/L、(5.16±0.22)mmol/L,B组TC水平较A组明显增高(P<0.05)。DGGE电泳图谱显示B组42 d时肠道菌群构成较0 d时变化显著,而A组不同时期肠道菌落构成无明显差异。q-PCR定量结果显示,随着饲喂高脂饲料天数的增加,B组小鼠肠道内乳杆菌属和双歧杆菌属较0 d明显降低(P<0.01),而拟杆菌门数量呈递减趋势且趋势比较平缓;梭菌属呈递增趋势且增幅相对拟杆菌门的变化较大。结论高脂饮食可导致肠道菌群结构的改变,这种改变会进一步促进高脂血症的形成。 曹宏芳 张家超 王芳 徐洁 徐海燕 吕嫱 王丽凤 张和平关键词:高脂饮食 肠道菌群 高脂血症 基于PacBio SMRT技术的鲜马奶细菌多样性研究 【目的】:研究鲜马奶中细菌的多样性,为鲜马奶的合理开发利用提供数据支持。【方法】:本研究采集4份鲜马奶样品,使用PacBio SMRT测序技术对鲜马奶的细菌多样性进行分析。【结果】:鲜马奶样品中共鉴定出9个细菌门、100... 刘亚华 王宇 徐海燕 李伟程 赵飞燕 孙志宏 张和平关键词:细菌 多样性 文献传递 应用多位点序列分型分析保加利亚乳杆菌遗传多样性 Lactobacillus delbrueckii subsp.bulgaricus最早是1905年由保加利亚医生Stamen Grigoro发现的,革兰氏阳性、长杆状和丝状杆菌,不运动、不形成芽孢,利用乳糖产生乳酸。其... 孙志宏 吕嫱 徐海燕 张和平文献传递