张国忠
- 作品数：17 被引量：55H指数：4
- 供职机构：杭州市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：浙江省医药卫生科学研究基金杭州市科技发展计划项目浙江省自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 杭州地区新生儿腹泻A组轮状病毒VP7型别分析被引量：2
- 2013年
- 目的:研究杭州地区一起新生儿腹泻疫情A组轮状病毒(RV)的VP7基因型。方法:收集杭州某医院2011年7月-2011年8月住院的新生儿腹泻粪便标本10份。采用轮状病毒抗体胶体金试剂盒快速检测RV抗原,荧光RT-PCR方法检测RVRNA,并用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)法以及巢式聚合酶链反应(net-PCR)进行RV VP7基因分型。结果:检出3份阳性标本,阳性率30%。RV VP7(G)血清型为G1G4G9混合型。结论:此次杭州地区新生儿腹泻疫情RV VP7(G)血清型为G1G4G9混合型。
- 邱晓枫张国忠孙昼黄志成胡国涛潘劲草
- 关键词：轮状病毒腹泻患儿逆转录聚合酶链反应
- 埃可病毒9型荧光RT-PCR快速检测方法的建立及应用被引量：2
- 2017年
- 为了建立特异、灵敏、快速的荧光定量RT-PCR方法用于检测埃可病毒9型病毒核酸,并初步应用于埃可病毒9型的临床标本检测。根据GenBank登录的埃可病毒9型毒株VP1基因序列,应用生物学软件进行序列比对,在保守区设计特异性引物和TaqMan探针。对反应条件进行优化,验证方法的特异性、灵敏度和重复性,同时对疑似埃可病毒9型病例标本进行检测。该方法对埃可病毒9型的检出有高度特异性,与EV71、CA16、CA24v、CA6、CA10、埃可病毒30型等均无交叉反应,检测灵敏度均达0.1TCID50/mL,可从疑似埃可病例粪便标本中直接检测病毒核酸,检测仅需3~4h。本研究建立的埃可病毒9型TaqMan荧光定量RT-PCR检测方法特异、灵敏,适用于临床早期诊断。
- 邱晓枫张国忠黄志成潘劲草于新芬
- 关键词：荧光定量RT-PCRTAQMAN探针
- 杭州市肠道病毒71型的分离与VP1区域序列分析被引量：6
- 2011年
- 目的了解杭州市2008年和2011年肠道病毒71型(EV71)流行株VP1基因特征。方法手足口病患者咽拭子、粪便等样本先通过荧光RT-PCR方法初筛,然后选部分肠道病毒71型阳性样本进行病毒分离、培养;通过逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)鉴定上述培养物,并扩增VP1区全长基因和序列测定,利用生物信息学软件对序列进行分析,构建基因进化树。结果从2008年和2011年手足口样本中分离到EV71阳性毒株各4株,VP1基因全序列测定结果显示其与C4亚型代表株核苷酸和氨基酸的相似性最高,分别为93.8%～95.2%、99.0%～99.7%。结论杭州市手足口病患者感染EV71病毒的流行株属C基因型的C4亚型。
- 邱晓枫祝水芬濮小英叶榕张国忠李钧缪凡黄志成
- 关键词：手足口病肠道病毒71型VP1基因基因型
- 大流行后杭州地区甲型H1N1流感病毒的流行及其支系更替特征分析被引量：2
- 2022年
- 目的通过分析甲型H1N1流感病毒[A(H1N1)pdm09]本地流行株的支系更替特征,了解并掌握A(H1N1)pdm09亚型流感病毒在当地的流行情况,比较历年流感疫苗与本地流行株支系的匹配程度,为本地区流感的防控策略微调提供基础数据支持。方法对2009—2020年期间A(H1N1)pdm09病毒本地流行情况进行统计分析,对随机选取的覆盖12个连续监测年度、10次流行高峰的208株代表性流行株进行血凝素基因(HA)全序列测定。通过与疫苗株和各支系参考株的序列比对,分析其基因变异情况、遗传进化和流行株支系更替特征。结果自2009年大流行以来,A(H1N1)pdm09亚型成为了本地近10年来最主要的季节性流感之一,常常与甲型H3N2、乙型流感共同流行。在2009—2020年连续12个监测年度里,由A(H1N1)pdm09亚型引起的流感流行高峰高达10次。通过HA基因序列分析发现,本地A(H1N1)pdm09亚型流行株支系来源复杂,变异切换快速。各个流行高峰的流行株与北半球当季流感疫苗推荐株相比较,常常出现因支系更替所造成遗传距离增加的现象。结论本研究提示每年更新疫苗推荐株非常必要,同时需要加强对A(H1N1)pdm09病毒流行和支系更替等特征的监测和分析,结果对指导下个流行季A(H1N1)pdm09流感病毒流行的防控具有重要参考价值。
- 李钧赵刚于新芬邱晓枫肖骁周银燕张国忠
- 关键词：流感病毒血凝素支系
- 杭州地区新生儿腹泻A组轮状病毒VP7型别分析
- 目的：研究杭州地区一起新生儿腹泻疫情A组轮状病毒(RV)的VP7基因型。方法：收集杭州某医院2011年7月-8月住院的新生儿腹泻粪便标本10份。采用轮状病毒抗体胶体金试剂盒快速检测RV抗原，荧光RT—PCR方法检测RVR...
- 邱晓枫张国忠孙昼黄志成胡国涛潘劲草
- 关键词：儿科疾病新生儿腹泻轮状病毒病原体检测
- 文献传递
- 大流行后流感病毒A(HlN1)pdm09亚型的支系更替与抗原性变异规律
- 目的 2009年A(H1N1)pdm09亚型大流行后,流感病毒在中国东南部城市杭州的流行特征以A(H1N1)pdm09、季节性A(H3N2)亚型以及B型流感病毒Yamagata系和Victoria系交替混合流行为主要趋势...
- 李钧邱晓枫周银燕张国忠于新芬王婧杨旭辉刘牧文汪皓秋潘劲草
- 关键词：抗原性变异流行株流感病毒
- 2018年杭州市登革热流行病学及病原特征研究被引量：4
- 2021年
- 目的了解2018年杭州市登革热疫情的流行病学及病原特征。方法应用RT-PCR方法检测血清标本中的登革病毒核酸及其型别,并对阳性标本进行病毒分离、E基因扩增、序列测定及进化分析;描述病例的时间、人群和地区分布特征。结果2018年杭州市共检测登革热病例80例,其中输入性病例55例,本地病例25例(DENV-124例,DENV-31例)。本地病例集中在7月下旬—10月上旬,68%的病例年龄在50岁以上。E基因进化分析表明,本地病例余杭分离株、江干-上城分离株、钱塘新区分离株均属DENV-1基因Ⅰ型,分别与2015年印度尼西亚毒株、2017年缅甸毒株、2018年宁波毒株及2018年杭州的泰国输入性病例毒株最接近。另一DENV-3本地毒株为基因Ⅲ型,与2013年新加坡毒株同源性最高,核苷酸序列一致性为99.5%。结论杭州市登革热流行以输入性病例为主。输入病例引起本地暴发的风险较高,疫情呈多点输入引起多点小规模暴发的特点。
- 文艳苹汪皓秋于新芬张国忠周银燕钱昕
- 关键词：登革热登革病毒E基因进化分析
- 浙江衢州地区儿童病毒性脑炎埃可病毒优势血清型与VP1基因分析被引量：4
- 2020年
- 目的了解浙江省衢州地区儿童病毒性脑炎埃可病毒(Echovirus,ECHOV)优势血清型与变迁并分析ECHOV VP1基因分子特征。方法采集53例病毒性脑炎患儿脑脊液标本进行病毒分离培养。采用荧光RT-PCR和PCR分别检测脑脊液标本中人肠道病毒(human enterovirus,HEV)包括ECHOV、柯萨奇病毒(coxsackie virus,CV)和新型肠道病毒(enterovirus,EV),以及流行性乙型脑炎病毒(japanese encephalitis virus,JEV)、腮腺炎病毒(mumps virus,MuV)、西尼罗病毒(west nile virus,WNV)、基孔肯雅病毒(chikungunya virus,CHIKV)、单纯疱疹病毒(herpes simplex virus,HSV)和巨细胞病毒(cytomegalovirus,CMV)。HEV阳性脑脊液标本采用RT-PCR法扩增HEV-B组全长VP1基因序列,测序后用多种生物信息学软件分析ECHOV VP1基因型、基因重组和遗传进化特征。结果RD细胞分离培养出6株毒株,但Hep-2细胞分离培养结果均阴性。11份标本HEV通用荧光RT-PCR结果阳性,但其他病毒检测结果均阴性。11份HEV阳性标本中6份检出ECHOV,与分离培养结果一致,分别为4株ECHO6、1株为ECHO7和1株ECHO30血清型,柯萨奇病毒和EV检测结果均阴性。4株ECHO6病毒属于ECHO6-C2基因亚型,但分为ECHO6-41/46和ECHO6-45/48两个流行克隆,ECHO7和ECHO30分别属于ECHO7-C和ECHO30-C基因型。ECHO6与ECHO30病毒在进化过程中存在VP1基因重组。结论ECHOV是该地区儿童病毒性脑炎主要病原体,且可能存在局部暴发流行。ECHO6与ECHO30病毒VP1基因存在重组可能性,ECHO6有成为ECHOV优势血清型的可能。
- 邱晓枫曹国平潘劲草张国忠李钧占炳东陈树昶吕华坤
- 关键词：病毒性脑炎埃可病毒VP1基因
- 埃可病毒9型VP1蛋白的原核表达及多克隆抗体制备被引量：1
- 2015年
- 目的原核表达并纯化埃可病毒9型(ECHO9)VP1蛋白,免疫兔子制备多克隆抗体,鉴定重组蛋白的免疫活性,为ECHO9血清学检测试剂和疫苗研究提供依据。方法 PCR方法扩增VP1基因,构建原核表达质粒p ET28a-VP1并转化到大肠杆菌(E.coli BL21),诱导表达并纯化VP1重组蛋白,免疫兔子制备抗VP1多克隆抗体,ELISA检测抗VP1抗体效价,Western blot鉴定抗体特异性。病毒中和试验鉴定抗体中和ECHO9病毒的能力。结果 VP1重组蛋白在大肠杆菌BL21中高效表达,制备的抗VP1抗体效价为1∶105。Western blot检测结果显示,抗VP1多克隆抗体可以识别原核表达的VP1蛋白。中和试验显示抗体对ECHO9病毒有中和作用,其效价为1∶10。结论本研究成功原核表达了ECHO9的VP1蛋白并制备出抗VP1多克隆抗体,有助于ECHO9的临床诊断、疫苗开发和分子病毒学研究。
- 邱晓枫黄志成张国忠濮小英潘劲草王咪咪
- 关键词：病毒性脑炎VP1基因多克隆抗体
- 一种用于检测奥司他韦耐药突变的引物、探针及检测方法
- 本发明提供一种用于检测奥司他韦耐药突变的引物、探针及检测方法，涉及基因检测技术领域。本发明提供一种用于检测奥司他韦耐药突变的引物和探针，所述引物和探针为：正向引物F：5’‑ATGTGCATGTGTAAATGGTTCTTG...
- 李钧赵刚陈树昶 杨字许珂陈仁华徐珏岑斌张国忠
