夏燕
- 作品数:5 被引量:24H指数:3
- 供职机构:复旦大学更多>>
- 发文基金:国家高技术研究发展计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:自动化与计算机技术文化科学自然科学总论医药卫生更多>>
- 生物数据整合若干技术的研究与实现
- 近年来,生命科学研究蓬勃发展。各个生命科学领域产生了大量生物数据,形成了众多大规模的生物数据库。如何利用这些生物数据,进行高效的生命科学研究是生物信息学的主要工作之一,这离不开数据整合。如何有效地整合分布于各个异构数据库...
- 夏燕
- 关键词:数据处理元数据生物数据库
- 文献传递
- 语义异构生物数据源中的数据集成与更新被引量:8
- 2008年
- 针对生物数据源的分布性、异构性和动态性等特性,探讨生物信息技术服务支撑系统整体解决方案,构建基于基因本体的信息集成模式以实现生物语义学上的数据集成。设计一种以半结构化形式规范生物元数据及基于MD5算法的增量更新技术,用以解决通用扩展性和效率问题,实现生物数据仓库中数据的共享并提高管理效率。
- 杨森夏燕曹顺良邓绪斌朱扬勇
- 关键词:基因本体半结构化MD5算法
- 生物语义相似性在数据仓库中的应用与实现被引量:3
- 2005年
- 通过有效手段从整合的异构生物信息资源中获取高质量的生物数据,能够为生物信息的分析和挖掘提供强有力的支持。本文基于B ioDW———一个整合的生物信息数据仓库系统,以Gene Ontology作为语义模型,应用信息的语义相似度计算方法,获取不同基因产物生物特征的相似度;考虑更多的生物结构信息,使相似性的计算更加符合基因产物自身的生物特征。基于信息的语义相似度计算方法与单纯的相似度计算相比,具有扩展性、准确率高等优点,为生物信息的进一步研究奠定了坚实的基础。
- 夏燕张忠平朱扬勇
- 关键词:数据仓库生物信息资源数据挖掘生物特征
- 肝癌组织中GABARAPL1基因表达变化的意义初探(暨中国人类功能基因克隆与鉴定研究的文献与专利分析)
- 第一章肝癌组织中GABARAPL1基因表达变化的意义初探 肝癌被世界卫生组织界定为十大恶性肿瘤之一。现在我国每年有40-50万人死于原发性肝癌,其死亡率在消化系统肿瘤中列第三位。肝癌因其早期症状隐匿,肿瘤恶性程度高,病...
- 夏燕
- 关键词:肝癌基因克隆发病机制数据库
- Gene Ontology在生物数据整合中的应用被引量:13
- 2005年
- 异构数据的高效整合,在生物数据呈爆炸性增长、生物数据库复杂度不断增加的今天,具有重要的理论价值和实际意义。该文基于BioDW——一个整合的生物信息学数据仓库平台,利用统一的GeneOntology语义模型,建立异构数据库之间的语义链接,在概念和联系层次上有效地解决了生物异构数据的整合问题,实现了对生物数据智能化的多重、复合和交叉检索,为生物信息的进一步研究奠定了坚实的基础。
- 夏燕张忠平曹顺良朱扬勇李亦学
- 关键词:数据整合异构数据库语义模型数据仓库