吴静
- 作品数:23 被引量:113H指数:5
- 供职机构:南京医科大学基础医学院更多>>
- 发文基金:南京医科大学科技发展基金江苏省高等学校大学生实践创新训练计划项目江苏省高校自然科学研究项目更多>>
- 相关领域:医药卫生理学文化科学生物学更多>>
- 甲型H1N1流感病毒HA基因的简单重复序列预测被引量:5
- 2013年
- 目的:探讨应用ARIMA模型对甲型H1N1流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)基因简单重复序列(simple sequencerepeats,SSRs)的相对丰度和相对密度值进行预测的可行性,为防控流感流行制定措施提供科学依据。方法:应用Eviews 6.0软件对1970~2007年38条同源性相对较高的甲流H1N1流感病毒HA核苷酸序列中SSRs的相对丰度和相对密度进行拟合,建立时间序列模型,用模型对2008~2010年SSRs的相对丰度和相对密度进行预测,并用实际数据评估模型预测效果,进而预测2011年数据。结果:ARIMA模型较好地拟合了既往相对丰度和相对密度的实际序列,对2008~2010年的相对丰度和相对密度的预测也获得了较好的预测效果。结论:ARIMA模型能较好地模拟甲型H1N1流感病毒HA基因中SSRs的相对丰度和相对密度的变动趋势,可用于SSRs相对丰度和相对密度值的短期预测和动态分析。
- 吴静丁勇刘成友
- 关键词:时间序列ARIMA模型简单重复序列甲型H1N1流感病毒
- 利用基因芯片技术筛选差异表达基因的方法研究被引量:6
- 2017年
- 为了探讨高维基因芯片基因表达谱数据筛选差异表达基因的方法,分析比较t检验法、秩和检验法、BON法、SIDAK法及ALSU法5种算法的差异表达基因筛选效率;采用模拟实验对t检验法、ALSU法等5种算法进行比较,并使用第一类、第二类错误率、总体错误率、筛选差异表达基因数及其均方根误差等5种指标进行评价;t检验法、秩和检验法计算结果过于灵敏,筛选差异表达基因个数较多,会促使筛选差异表达基因中假阴性事件的发生,BON法、SIDAK法筛选结果过于保守,筛选的差异表达基因个数较少,假阳性事件发生率较为显著,ALSU法能较稳定的抑制第一、二类错误率的发生,同时ALSU法筛选结果受系统扰动误差影响较笺LSU方法能够稳定的、高效的筛选差异表达基因,在使用高纬基因表达谱数据筛选差异表达基因时应首选ALSU法.
- 刘成友刘康余晶宋宁宁丁勇吴静秦航
- 关键词:基因芯片差异表达基因
- 微阵列数据扰动对错误发现率方法筛选差异表达基因的影响被引量:2
- 2014年
- 目的:探讨微阵列数据的扰动对错误发现率(FDR)方法筛选差异表达基因的影响。方法:用计算机模拟仿真的方法,对1 991个结肠癌微阵列基因数据给予不同相对误差限的随机扰动,每个扰动进行1 000次随机模拟;用FDR的ALSU方法对无扰动数据与有扰动数据分别筛选差异表达基因,比较两者之间的重复率;分析数据扰动对每次基因排序位次变化的影响。结果:差异表达基因的单个平均重复率与总体平均重复率都随数据扰动的增加而下降。差异表达越显著的基因,受扰动误差的影响越小;在扰动误差限≤50%时,数据扰动与差异表达基因总体平均重复率呈线性递减趋势,数据扰动误差限每增加1%,总体平均重复率约下降1.85%。扰动误差限越大,基因排序位次的波动越大。结论:数据扰动是导致差异表达基因可重复性差的原因,用计算机模拟的方法可定量探讨数据扰动对差异基因筛选的影响。
- 陈婉婷刘成友吴静丁勇
- 关键词:微阵列差异表达基因
- ARIMA乘积季节模型在我国甲肝发病预测中的应用被引量:17
- 2014年
- 目的:应用求和自回归移动平均模型(ARIMA)乘积季节模型对我国病毒性甲型肝炎进行预测分析,为甲型肝炎的防治提供决策依据。方法:对1994~2012年我国甲型肝炎月发病数的历史疫情数据建立ARIMA乘积季节模型,应用Eviews 6.0软件进行模型拟合,对2013年上半年甲型肝炎的月发病数进行预测,并用实际数据评估模型预测效果。结果:ARIMA(1,1,0)(2,1,2)12模型较好地拟合了既往甲肝的实际发病序列,也获得了较好的预测效果。结论:ARIMA模型能够较好地模拟我国甲型肝炎的发病趋势,预测效果良好,可为甲肝疫情的防控提供一定的科学数据。
- 王超丁勇陆群吴静
- 关键词:时间序列甲肝
- HIV抗体阴性的肺隐球菌病临床特点分析被引量:1
- 2011年
- 目的 探讨HIV抗体阴性的肺隐球菌病(PC)的临床特点及影像学表现等,提高对该病的认识.方法 回顾性分析14例HIV抗体阴性的PC患者的临床资料.结果 14例PC中免疫功能正常6例,有基础疾病8例.有症状12例,主要为发热、咳嗽、咳痰等.合并隐球菌性脑膜炎2例.影像学表现主要可分为:结节、团块型6例,片絮、斑片型3例,混合型5例.14例均经病理确诊.单纯药物治疗11例,手术+药物治疗1例,症状缓解11例,未治2例,未愈1例.结论 PC 临床表现缺乏特异性,非免疫缺陷的人群中也应提高诊断意识,避免误诊,尽早治疗.
- 吴静肖永龙蔡后荣张德平
- 关键词:隐球菌病HIV抗体影像学
- 中国人口数量的时间序列分析被引量:1
- 2012年
- 本文运用时间序列模型(ARIMA模型)对中国人口进行分析与预测,应用Eviews 6.0软件对1949~2007年中国人口数据进行拟合,建立ARIMA模型,运用2008~2010年的人口数据来验证模型,并对2011年的总人口数进行了预测。
- 杨君哲吴静王娟刘潋李强
- 关键词:时间序列ARIMA模型人口数量
- 急性脑梗死及血管性认知功能障碍患者血清IL-6与IL-18的表达被引量:12
- 2016年
- 目的探讨急性脑梗死(ACI)和血管性认知功能障碍(VCI)患者血清IL-6和IL-18的表达。方法采用ELISA法检测64例ACI患者(A组)、33例非脑梗死急性期的VCI患者(B组)和30例老年健康体检者(C组)的血清IL-6和IL-18水平。动态观察A组第1、3和7天IL-6和IL-18的水平。结果 A组血清IL-6水平高于B、C组,B组高于C组(P<0.05)。A组和B组血清IL-18水平高于C组(P<0.05)。A组IL-6水平第3天高于第1、7天(P<0.01);IL-18水平第1天高于第3、7天(P<0.05)。结论 IL-6和IL-18参与了脑梗死后的炎症反应;IL-18较高表达可能与VCI的发生有关。
- 侯晓夏涂曼丽俞刚吴静何川蒋理程虹
- 关键词:脑梗死血管性认知功能障碍白细胞介素6白细胞介素18
- 浅谈数学专业《数学分析》课程教学改革被引量:2
- 2008年
- 本文针对当前数学分析教学中存在的主要问题及其成因,探讨了该课程教学改革的必要性和紧迫性,并结合教学实际,借鉴初等数学和高等数学的教学经验,提出了注意"三基"训练、分层教学、研究性学习等若干有效的改进方法.
- 王忠谦吴静
- 关键词:数学分析分层教学研究性学习
- 医学院校高等数学教学改革的有益尝试
- 2009年
- 结合现代医学的发展方向,将医学学科特点与数学教学结合起来,改进现行的数学教学模式,从而提高医学生的数学思维与创新能力。
- 吴静郑宇韩新焕
- 关键词:高等数学教学改革
- 状态空间模型在我国肝炎发病率预测中的应用被引量:1
- 2016年
- 目的 :应用状态空间模型对我国甲肝、乙肝、丙肝的月发病率进行拟合和预测,分析预测准确率与发病周期规律的关系,为肝炎发病率的预测提供新方法。方法:对2005—2013年我国甲肝、乙肝、丙肝的月发病率建立状态空间模型,应用MATLAB软件中的SSM工具包对模型进行拟合,并对2014年1—12月的发病率进行预测;通过数据标准化,建立发病率周期规律性评价指标。结果:甲肝、乙肝和丙肝的月发病率预测相对误差的平均值分别为17.03%、6.30%和2.03%,标准化数据周期标准差均值分别为0.214 3、0.195 2和0.172 4。结论:状态空间模型能较好地应用于肝炎发病率的拟合和预测,标准化数据周期评价指标的标准差越小,预测效果越好。
- 阮俊王玥郁婷燕戚凯莉陈冠军丁勇吴静
- 关键词:状态空间模型肝炎