邓丽娟
- 作品数：4 被引量：11H指数：2
- 供职机构：石河子大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：新疆特殊环境微生物重点实验室开放课题新疆维吾尔自治区自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 新疆典型微咸水湖泊原核微生物多样性
- 目的：微咸水湖是指湖水矿化度介于1—35g/L之间的湖泊，中国的此类湖泊主要分布在干旱、半干旱的西部地区。内陆封闭型湖泊受无出流或出流量少及干旱气候等因素的影响，导致湖水盐份浓度逐步增高，总体上呈现由淡水湖向微咸水湖、咸...
- 邓丽娟
- 关键词：原核微生物物种多样性群落组成
- 文献传递
- 新疆两典型微咸水湖水体免培养古菌多样性被引量：5
- 2012年
- 微咸水湖是湖泊演化过程中的一个重要中间状态,以新疆两典型微咸水湖-赛里木湖和柴窝堡湖水为研究对象,采用微孔滤膜收集菌体,SDS-酚-氯仿抽提法直接提取湖水总DNA,利用古菌16S rRNA基因通用引物进行PCR扩增,分别构建两湖古菌16S rRNA基因克隆文库。用限制性内切酶HaeⅢ对随机挑选的阳性克隆子进行酶切分型,分别得到7个和8个可操作分类单元(Operational Taxonomic Units,OTUs),两文库覆盖率均大于98%。BLAST比对和系统发育分析表明赛里木湖全部克隆子归属于泉古菌门(Crenarchaeota),97%的克隆子与不同环境免培养氨氧化泉古菌有较高的序列相似性(>97%)。柴窝堡湖水古菌归为3个门:Thaumarchaeota(81.2%)、广古菌门(Euryarchaeota)(13%)和泉古菌门(Crenarchaeota)(5.8%),81.2%的克隆子与具有氮代谢功能的氨氧化古菌纯培养物具有较高的序列相似性(97%—98%),13%的克隆子与已分离到的产甲烷古菌序列同源性大于97%。研究发现新疆微咸水湖可能存有大量新划分的古菌Thaumarchaeota门类群、可培养氨氧化及产甲烷古菌类群,两典型微咸水湖泊中古菌类群多样性较低且群落组成差异大。
- 邓丽娟娄恺曾军徐赢华史应武张煜星
- 关键词：古菌RRNA基因
- 日偏食对乌鲁木齐空气细菌多样性的影响
- 2012年
- 【目的】了解日偏食对乌鲁木齐空气细菌多样性影响。【方法】利用末端限制性片段长度多态性技术(T-RFLP,Terminal-restriction fragment length polymorphism)分析比较日偏食前后乌鲁木齐空气细菌多样性变化。【结果】日偏食当天的各项多样性指数均高于其他几天;酶切图谱和多样性指数结果显示,利用RsaⅠ酶切样品所得细菌多样性高于利用HhaⅠ酶切所得结果;聚类分析显示,日偏食前1 d,后1 d和当天空气细菌可聚为一类,其余聚为一类。【结论】乌鲁木齐空气细菌受日偏食的影响多样性有所增加。
- 邓丽娟马晶娄恺曾军张涛
- 关键词：日偏食空气细菌多样性T-RFLP
- 新疆顿巴斯他乌盐湖沉积物免培养古菌多样性被引量：9
- 2012年
- 【目的】了解新疆顿巴斯他乌盐湖沉积物免培养古菌组成及多样性。【方法】利用免培养法直接从顿巴斯他乌盐湖沉积物样品中提取环境总DNA,采用古菌通用引物对16S rRNA基因进行扩增,构建基因克隆文库。对随机挑选的59个阳性克隆进行HaeⅢ限制性酶切分型并测序、BLAST比对及构建16S rRNA基因系统发育树。【结果】文库覆盖率为89%,Shannon-Wiener指数为2.69,共得到21个不同的可操作分类单元,分属于广古菌门(Euryarchaeota,92%)和泉古菌门(Crenarchaeota,8%),其中多数为盐杆菌科(Halobacteriaceae,88%)的盐杆菌属(Halobacterium,24%)、盐盒菌属(Haloarcula,18%)、盐碱红菌属(Natronorubrum,14%)、盐红菌属(Halorubrum,8%)等,与海盐环境(thalassohaline)获得的16S rRNA基因序列相似性最高(﹥95%);整个文库中约11%的克隆与可培养古菌多个属的相似性小于97%。【结论】顿巴斯他乌盐湖古菌多样性略低于同类高盐环境,组成较为一致,只是各类群所占百分比稍有不同,且可能存在一些潜在新物种或新类群。
- 朱莉杨红梅王芸廖先燕邓丽娟李珊娄恺艾尔肯.热合曼
- 关键词：高盐环境古菌多样性
