孙丽华 作品数:15 被引量:10 H指数:2 供职机构: 中国科学院上海应用物理研究所 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 中国科学院知识创新工程领域前沿项目 国家重点基础研究发展计划 更多>> 相关领域: 生物学 文化科学 核科学技术 理学 更多>>
学术期刊数字化出版提高学术传播力实践 被引量:4 2021年 学术期刊的数字出版,使传统期刊从以产品为主转变为以产品和服务为主,从基于形式转变为基于内容。本文分析了当前学术期刊数字化中存在的问题,基于《核技术(英文版)》数字化出版的实践,提出了学术期刊借助内容数字化和智能化手段提升学术传播力,拓展学术服务的途径,以期对同行有所借鉴。 孙丽华关键词:数字化出版 传播力 1.9分辨率μ-crystallin蛋白晶体结构及其酮亚胺还原酶活性位点分析 被引量:2 2012年 采用不同的结晶条件生长了μ-crystallin晶体(CRYM)并解析了人源CRYM与NADPH复合物晶体结构(PDB code 2I99),将分辨率由2.6提高至1.9,修正了2I99的结构。CRYM单体相较2I99结构少3个β折叠和一个310螺旋。NADPH Pro-R面具有多个保守位点可能参与酮亚胺还原酶活性,通过与同源蛋白OCD和AlaDH比对,推测了底物结合位点和催化位点。 许新磊 李健 孙丽华 徐春艳 何建华Nuclear Science and Techniques期刊论文关联数据集出版的探索与实践 2024年 随着科学研究日益趋向数据密集型,科研创新愈发依赖于获取大量、系统化、高可靠性的数据。在此背景下,开放数据对于加速科技创新具有至关重要的作用。作为一种新兴的出版模式,科学数据出版促进了科学数据的共享,并有助于最大化科学数据的潜在价值。本文基于Nuclear Science and Techniques期刊论文关联数据集出版实践探索,探讨了与核科技论文相关的数据出版要求、数据政策框架制定、数据共享方式和数据重用策略等,以期为核科技领域论文关联数据集出版的深入发展提供参考。 孙丽华无机衬底表面的蛋白质晶体的外延生长 外延生长已被广泛地应用于无机晶体的晶体生长过程中并获得了很好的结果,近年来也陆续有文献报道利用无机衬底表面诱导多肽等生物大分子进行有机的组合、聚集。而80年代就有人开始尝试着将外延生长应用到蛋白质的晶体生长中,但鲜有成功... 孙丽华 唐琳 何建华采用裸云母作为蛋白质晶体生长基底的方法 本发明公开了一种采用裸云母作为蛋白质晶体生长基底的方法,其包括下列步骤:将蛋白及其沉淀剂溶液滴在硅烷化的云母表面,在液滴上面覆盖新解理的裸云母片,在覆盖之前先在两云母片之间设置隔离装置;再将得到的体系翻转覆盖在按常规加有... 唐琳 孙丽华 徐春艳 胡钧 何建华文献传递 热休克蛋白90的N端与ATP类似物的晶体结构揭示其功能调控 被引量:2 2012年 分子伴侣热休克蛋白90(Hsp90)对于许多涉及细胞周期调控、信号转导以及细胞生长调控蛋白质的折叠、成熟及稳定是必需的.Hsp90的N端结构高度保守,包含一个ATP结合口袋并具有ATP酶活性,Hsp90的功能依赖于ATP与Hsp90结合后诱导的构象重排及之后的ATP水解.为了深入研究ATP与Hsp90结合后N端的结构及其功能状态,使用悬滴法共结晶了Hsp90的N端与ATP类似物AMPPNP及ATPγS的复合物,并利用分子置换法对其结构进行了解析.两个复合物晶体结构都捕获到了核苷酸的电子密度,尤其是γ-磷酸的电子密度,从而观察到γ-磷酸与蛋白质之间的相互作用.ATPγS中γ-磷酸的捕获证实了之前报道的结构中没有捕获到γ-磷酸是其处于无序状态而非被水解.单体状态下的人源Hsp90N-AMPPNP与处于二聚体化的酵母Hsp90-AMPPNP结构对比可见S1和ATP lid的位置有明显区别,结构分析表明,E18-K100和N40-D127之间形成的氢键相互作用,在一定程度上阻碍了S1和ATP lid的摆动,很可能阻止了二聚体的形成. 李健 孙丽华 徐春艳 郁峰 周欢 唐琳 何建华关键词:相互作用 火球菌8-氧鸟嘌呤DNA糖苷酶基因克隆、表达纯化和酶学性质研究 2014年 【目的】在大肠杆菌中表达火球菌8-氧鸟嘌呤DNA糖苷酶,纯化得到重组火球菌8-氧鸟嘌呤DNA糖苷酶,在此基础上系统研究火球菌8-氧鸟嘌呤DNA糖苷酶的酶学特征。【方法】构建8-氧鸟嘌呤DNA糖苷酶重组表达质粒,将重组质粒转化Escherichia coli Rosetta(DE3),利用IPTG诱导表达重组蛋白,通过Ni2+亲和层析柱纯化重组蛋白;最后利用含8-氧鸟嘌呤损伤的寡核苷酸作为底物,测定8-氧鸟嘌呤DNA糖苷酶的酶学性质。【结果】在大肠杆菌中成功诱导表达了重组火球菌8-氧鸟嘌呤DNA糖苷酶,经Ni2+亲和纯化后蛋白纯度大于95%。在体外鉴定了重组火球菌8-氧鸟嘌呤DNA糖苷酶的酶学性质。结果表明重组火球菌8-氧鸟嘌呤DNA糖苷酶可以切除DNA中的8-氧鸟嘌呤(8-Oxo-G,GO)损伤碱基,并且具有AP裂解酶活性。重组火球菌8-氧鸟嘌呤DNA糖苷酶催化反应的最适pH值和温度分别是pH 8.5和55°C。除Zn2+对火球菌8-氧鸟嘌呤DNA糖苷酶的酶促反应有明显的抑制作用外,实验中测定的其它二价离子(Mn2+,Mg2+,Ca2+,Ni2+,Co2+,Cu2+)对其没有明显的影响。离子强度在50-100 mmol/L范围内对其酶促反应影响不大,超过100 mmol/L时有明显的抑制作用。与8-氧鸟嘌呤互补的碱基差异对火球菌8-氧鸟嘌呤DNA糖苷酶切除8-氧鸟嘌呤损伤的效率影响不大;但与单链DNA相比,双链DNA是优选底物,切割效率如下:GO/C≈GO/G≈GO/T≈GO/A>GO/-。【结论】在大肠杆菌中成功表达,并Ni2+亲和纯化了火球菌8-氧鸟嘌呤DNA糖苷酶,生化研究表明制备的重组蛋白具有8-氧鸟嘌呤DNA糖苷酶活性,可能负责切除火球菌基因组DNA中的8-氧鸟嘌呤损伤。 周欢 杨敏 陈亚星 刘亚辉 孙丽华 徐春艳 郁峰 何建华关键词:碱基切除修复 学术期刊利用电子邮件时事资讯推动期刊学术信息传播探析——以核科学资讯为例 2022年 在新媒体环境下,论文的传播更多地依赖第三方平台的算法分发,如何使数字出版传播从渠道为王回归到内容为王,需要期刊发挥主观能动性,立足期刊,认真分析国内外相关领域研究进展,并加强与读者之间的信息沟通,满足读者高质量信息的需求。《核技术(英文版)》通过“NST核科学资讯”将国内外核科技领域内的研究动态与期刊实时出版论文信息进行整合,以资讯的形式定期分发给读者,加深了期刊与读者之间的交流,通过与读者之间直接的信息沟通,使期刊出版活动逐步融入到学者的科研活动,在快速传播领域内学术研究动态和进展的同时,与读者间建立起了牢固的信任关系。 孙丽华关键词:信息分发 数字环境下学术期刊开展内容增值服务的实践 被引量:1 2018年 以《核技术(英文版)》为例,介绍了科技期刊在数字环境下开展内容增值服务的策略,包括语义出版、论文转发评论、专题内容推送、移动互动交流平台搭建服务等。 孙丽华火球菌RecJ蛋白的表达纯化及结晶 2013年 RecJ蛋白是一类在细菌和古菌中高度保守的蛋白,在细胞内参与同源重组、甲基指导的碱基错配修复和碱基切除修复等过程。RecJ蛋白除了可以从单链DNA的5端降解DNA外,还可以从单链RNA的3端降解RNA。为能够从结构上阐明古菌火球菌(Pyrococcus furiosus)RecJ蛋白在细胞内的功能和其对不同底物(RNA/DNA)的降解活性的影响,本实验采用蛋白质晶体学的方法,通过蛋白质的表达纯化,晶体筛选得到了火球菌RecJ蛋白的晶体,并通过结晶条件的初步优化得到了有衍射的晶体。 杨敏 李敏军 周欢 陈亚星 孙丽华 郁峰 徐春艳 唐琳 何建华关键词:X射线衍射