柴丽红
- 作品数：14 被引量：126H指数：8
- 供职机构：云南大学云南省微生物研究所更多>>
- 发文基金：科技部基础研究重大项目前期研究专项国家自然科学基金云南省教育厅科学研究基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 青海柯柯盐湖16株细菌的ARDRA筛选及系统发育初步分析被引量：10
- 2003年
- 从青海柯柯盐湖泥样中分离的16株细菌,用2种限制性内切酶酶切进行ARDRA分析,其中12株菌的酶切带谱有较大差异.根据这12株菌的16SrDNA序列进行系统发育分析结果表明,12株菌有11株分布于芽孢杆菌科中的Halobacillus,Gracibacillus,Amphibacillus,Virgibacillus,Bacillus,Salibacillus和1个潜在的新属中,另1株属于Proteobacteria的Gamma亚群Halomonadaceae科,Halomonas属.而且16SrDNA系统发育分析提示这些菌株中存在3个新种和1个新属的可能.本研究得出的结论为:应用ARDRA来初步筛选菌株是可行的;青海柯柯盐湖这一极端环境中存在较丰富的新的芽孢菌种类.
- 柴丽红王涛崔晓龙彭谦徐丽华姜成林
- 关键词：ARDRA细菌系统发育分析芽孢菌
- 从腾冲热海免培养获得的5个16 S rDNA克隆分析被引量：2
- 2003年
- 用免培养法(culture-independentapproach)从腾冲大滚锅高温热泉中获得的16SrDNA,经克隆筛选,测定了其中5个克隆的16SrDNA插入片段的近全序列.构建的系统发育树分析结果表明,5个克隆中有2个是Bacillus属,1个是Hydrogenobacter属,1个是Pseudomonas属,还有1个在Thermodesulfobacteriaceae科,介于Geothermbacterium属和Thermodesulfobacteria属之间.
- 王涛柴丽红崔晓龙徐丽华彭谦姜成林
- 关键词：腾冲热海热泉免培养法RDNA种群生态学
- 青海两盐湖细菌多样性研究被引量：42
- 2004年
- 用DGGE法和纯培养法 ,对青海柯柯盐湖、茶卡盐湖底泥及周边土壤样品的细菌多样性进行了研究。结果显示 ,两个盐湖存在大量的未知细菌 ,分离到的纯培养仅占实有细菌的小部分。采用多相分类方法 ,鉴定了 1 2株纯培养细菌 ,属 5个可能的新种 ,另有一株菌可能成立一个新属。认为提出新思路、设计新程序 ,从自然极端环境取样 ,分离未知菌 。
- 柴丽红崔晓龙彭谦徐丽华姜成林王涛李文均段若玲
- 关键词：细菌多样性DGGE
- 滇西热泉中9个16S rDNA克隆的分析被引量：8
- 2003年
- 用免培养法 (Culture independentapproach)从腾冲大滚锅和龙陵大沸泉两个高温热泉中获得的 1 6SrDNA ,经克隆筛选 ,测定了其中 9个克隆的 1 6SrDNA插入片段的近全序列 ,构建系统发育树进行分析。结果表明 ,9个克隆中有 4个是Thermus属、 2个是Bacillus属、1个是Hydrogenobacter属、 1个是Pseudomonas属 ,还有 1个在Thermodesulfobacteriaceae科 ,介于Geothermbacterium属和Thermodesulfobacteria属之间。
- 王涛柴丽红郭春雷崔晓龙徐丽华彭谦姜成林
- 关键词：热泉免培养法克隆
- 云南腾冲热海三热泉细菌多样性的研究被引量：12
- 2004年
- 应用变性梯度凝胶电泳 (DGGE)对云南腾冲热海 3个高温热泉中菌藻席和泉底沉积物的细菌多样性进行了初步研究。直接从环境样品中提取总DNA ,用两套细菌通用引物进行PCR扩增 ,分别得到包含V8和V9高变区的 1 6SrDNA片段 ,进行DGGE分析。结果表明 :菌藻席和泉底沉积物中不仅物种组成差异较大 ,而且都存在丰富的细菌多样性 ;一些关键的生态因子 ,如氧气、温度等会对群落中微生物的物种组成有很大影响。
- 李沁元崔晓龙张东华彭谦徐丽华王涛柴丽红姜成林
- 关键词：DGGE细菌多样性
- 腾冲热海温泉高温菌研究
- 彭谦崔晓龙林连兵和致中徐丽华陈朝银李沁元张东华郭春雷王涛柴丽红
- 该项目研究发现腾冲热海主要代表性高温环境存在丰富的微生物群落多样性和物种多样性，至少包含了10个细菌门的细菌类群。热泉的水化学成分是影响热泉微生物生态系统群落结构与组成的重要环境因子；热海的微生物菌属与世界其它地热区的微...
- 关键词：
- 关键词：微生物多样性
- 云南腾冲热海两热泉菌藻席细菌多样性的研究被引量：13
- 2004年
- 应用显微形态观察和变性梯度凝胶电泳 (DGGE)对云南腾冲热海两热泉菌藻席的细菌多样性进行了比较分析。直接从环境样品中提取总DNA ,用两套细菌通用引物进行PCR扩增 ,得到包含V8和V9高变区的 1 6SrDNA片段 ,进行DGGE分析 ,结合形态观察 ,结果显示 ,热泉菌藻席中存在丰富的细菌多样性 。
- 李沁元崔晓龙张东华彭谦徐丽华王涛柴丽红姜成林
- 关键词：菌藻席多样性变性梯度凝胶电泳DGGE
- 免培养法对一热泉细菌多样性的初步研究被引量：16
- 2003年
- 应用免培养法 (Culture independent)对云南腾冲热海大滚锅高温热泉中细菌的多样性进行初步的分析。经过克隆筛选 ,测定了 5个克隆的 1 6SrDNA插入片段的近全序列 ,系统发育分析的结果表明 ,它们分属于Bacillus、Hydrogenobacter和Pseudomonas,有一个克隆尚难确定其分类地位 ,它属于Thermodesulfobacteriaceae科 ,介于Geothermbacterium属和Thermodesulfo bacteria属之间。经PCR扩增出上述 5个克隆 1 6SrDNA插入序列中及环境样品总DNA中的1 6SrDNAV8高变区约 60 0bp片段 ,进行变性梯度电泳 (DGGE)。所得电泳图谱和 5个序列的系统发育树不仅表明该高温热泉存在着丰富的细菌多样性 。
- 王涛柴丽红崔晓龙彭谦姜成林
- 关键词：免培养法热泉细菌多样性
- DGGE技术在微生物生态学研究中的应用被引量：16
- 2003年
- 简要介绍了DGGE (denaturinggradientgelelectrophoresis)的基本原理 ,及其在研究微生物类群多样性、环境中微生物变化的动态监测、微生物新物种的发现、不同DNA提取方法效果的比较和功能基因多样性研究等微生物生态学领域中的应用 ,并对该技术自身存在的缺限进行了评价。
- 柴丽红彭谦徐丽华姜成林
- 关键词：DGGE技术微生物生态学基因多样性
- 应用DGGE法对青海相邻两盐湖中细菌多样性的快速检测被引量：27
- 2003年
- 分别对青海相邻两盐湖柯柯盐湖、茶卡盐湖土样、泥样进行富集培养后 ,从中提取的DNA用两套不同的细菌通用引物进行扩增 ,分别得到包含V8和V9高变区的 16SrDNA片断。经变性梯度凝胶电泳 (DGGE)分析 ,结果显示这两个盐湖富集样品中细菌多样性具有较大的差异 ,而且同一盐湖不同性质样品中的细菌多样性差异也较大 ,两湖的泥样富集样品中均表现出了稍丰富的多样性。
- 柴丽红王涛李沁元崔晓龙彭谦徐丽华姜成林
- 关键词：细菌多样性土样
