陈国清
- 作品数：49 被引量：159H指数：8
- 供职机构：盐城市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：盐城市医学科技发展计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生政治法律理学经济管理更多>>
- 盐城市2017-2020年艾滋病检测实验室质量考评情况分析
- 2021年
- 了解盐城市艾滋病检测实验室(筛查实验室与检测点)的检测质量及日常管理情况,对存在的问题分析原因,更好地保证盐城市艾滋病检测实验室的质量控制工作。方法:通过制定血清学评分细则与现场督导表,对全市艾滋病检测实验室进行血清学考核与现场督导,并对结果资料进行综合分析。结果:从近四年的质量考评成绩来看,筛查实验室成绩优于检测点, 疾控机构与采供血机构筛查实验室考评结果均为优秀;医疗机构筛查实验室考评结果优秀率偏低,血清学考核与现场督导主要存在的问题是在原始记录、质控措施、报告完整性、生物安全等方面。结论:盐城市艾滋病检测实验室质量考评成绩总体良好,但是针对存在的问题,各级机构应该重视并且尽快解决。
- 仇思婕陈国清邵荣标
- 关键词：艾滋病质量考评
- 数字化监测系统在大气监测中应用的要点分析
- 2020年
- 现阶段我国的大气环境污染问题日益凸显,必须加大治理力度。在大气环境治理中,数字化监测系统和大气监测能够有效融合变得十分关键。为了能在大气环境中进行实时监控,本文对数字化监测系统的自身功能进行了简要分析,对该系统进行了全面的探究。
- 刘月琴杨建树黄连成陈国清
- 关键词：大气监测
- 2013—2017年盐城市流感流行病学特征分析被引量：8
- 2019年
- 目的了解2013-2017年盐城市流感样病例(ILI)流行病学及病原学特征,为流感预防提供理论依据。方法通过中国流感监测信息系统,收集2013—2017年盐城市ILI及实验室检测信息,采用描述性研究方法对监测数据进行分析。结果 2013—2017年共报告ILI 62 999例,各年ILI%差异有统计学意义(P<0.05)。2015-2017年每年均存在冬春季(第1～10周)和夏秋季(第30～36周)两个流行高峰,2013年和2015年秋季流行高峰较为明显。ILI发病人群以<15岁婴幼儿及儿童为主(占88.8%),各年度年龄组构成差异有统计学意义(P<0.05)。流行毒株以甲H1N1型、乙型和甲H3型中的两型交替出现为主。ILI标本阳性率为8.14%,其中甲H1N1占29.85%,季H3占38.20%,B型占30.69%,病毒阳性率峰值与ILI%高峰存在正相关(r=0.562,P <0.001)。≥60岁龄组阳性率(11.62%)高于5～岁组(7.75%)、15～岁组(5.92%),差异有统计学意义(P<0.05);不同年龄组感染流感核酸型别差异有统计学意义(P<0.05)。流感/ILI暴发疫情共报告25起,主要集中在2017年(14起)、2016年(7起),其中2017年以乙型为主,2016年以季H3型为主。结论 ILI流行时间分布与病毒阳性率趋势一致,流感病毒流行毒株存在年度变异,建议发病高峰期对中小学及托幼机构、老年人群接种流感疫苗。
- 李长城徐士林姜仁杰陈国清王瑶倪慧明
- 关键词：流感样病例流行性感冒流感病毒流行病学特征病原监测
- 基于线粒体COI基因鉴定技术的盐城市长角血蜱遗传多样性分析
- 2024年
- 目的了解盐城市长角血蜱的遗传多样性和不同地理种群间系统发育关系,为该地区长角血蜱及其蜱媒病的防控提供理论基础。方法2022年10月—2023年4月,在盐城市亭湖(枸杞灌木丛、盐地碱蓬区、海堤草丛、白茅、居民区)、东台(河堤草丛)两地共6种生境采集蜱虫,形态学鉴定后用普通PCR扩增线粒体细胞色素C氧化酶I亚基(COI)基因,进行分子鉴定。结果共采集38只蜱虫,包括25只成蜱和13只若蜱,经形态学与分子生物学鉴定均为长角血蜱,分布于两个进化分支,主要进化分支位于Compound分支中。不同地理种群分属于5个共享单倍型,25个为独享单倍型,其中盐城市共涉及3个共享单倍型,10个单倍型,H5、H10处于辐射中心位置,可能较为原始。结论本次采集的长角血蜱在不同地理种群无明显分化,在盐城种群中可能处于扩张突变积累中。
- 陈国清崔倩张红军李峰李春香燕清丽王富华徐兵安然杨鹏飞
- 关键词：长角血蜱系统发育种群遗传多样性种群遗传结构
- 2016-2017年盐城市手足口病CVA9型肠道病毒VP1基因分子进化特征被引量：8
- 2019年
- 目的研究2016-2017年盐城市手足口病病原CVA9型肠道病毒VP1基因分子进化特征。方法对2016-2017年盐城市疑似手足口病例标本进行病原体分子分型分析;以RT-PCR法扩增CVA9型肠道病毒VP1基因全长编码区并测序,采用生物信息学软件进行核苷酸及氨基酸序列比对及基因种系进化特征分析。结果2016-2017年盐城市共检测1 002例疑似病例标本,肠道病毒核酸阳性率38.32%,主要型别为EV71型112例(占29.17%),CVA16型94例(占24.48%),其他肠道病毒共178例(占46.35%)。检出2株CVA9型,其核苷酸、氨基酸同源性分别为94.7%、99.3%,与原型株Griggs(D00627)核苷酸、氨基酸同源性分别为80.4%~81.3%、92.7%;与引起其他症状各代表株(包括无症状健康儿童携带者)的核苷酸、氨基酸同源性为81.1%~97.2%、94.0%~99.3%。遗传进化树分析显示2毒株在C4分支中构成2条明显的传播链:CVA9/JS-yancheng/122/2016位于单独的小分支,CVA9/JS-yancheng/419/2016与2016年无症状健康儿童携带者四川株(LC361283)聚集成簇构成另一传播链。共检测31例重症病例,13例肠道病毒通用核酸阳性,阳性率41.93%,其中EV71型11例、CVA型2例。结论2016-2017年盐城市引起手足口病的CVA9病毒属于散在流行,非手足口病流行的主要基因型别,与国内部分省市引起手足口病的毒株共进化共循环,与引起其他症状类型的CVA9毒株存在差异。
- 许晓庆陈国清王瑶安然邵荣标
- 关键词：手足口病VP1基因分子流行病学
- 2017年盐城市1例人感染新布尼亚病毒全基因组分子特征分析被引量：3
- 2021年
- 目的分析盐城市2017年1例发热伴血小板减少综合征布尼亚病毒(SFTSV)全基因组序列,对其来源、地理分布特征以及病毒遗传特征进行分子溯源,为防控盐城市人感染新布尼亚病毒疫情提供实验室依据。方法采用荧光定量RTPCR的方法,对该SFTSV病例及其相关媒介宿主进行核酸检测,测定其全基因组序列,采用相应的生物信息软件进行核苷酸及氨基酸序列比对及基因种系进化特征分析。结果确诊病例分离出SFTSV盐城株,其L、M、S基因与不同基因型参考株核苷酸同源性分别为94.9%~98.7%,94.1%~97.5%,94.6%~98.7%;氨基酸同源性分别为98.8%~100.0%,97.3%~98.7%,93.0%~98.4%;人与4种媒介宿主间毒株序列高度同源,L、M、S基因核苷酸序列同源性分别为95.8%~96.3%,94.3%~96.1%,95.7%~96.0%;氨基酸序列分别为98.8%~100.0%,98.2%~98.7%,93.6%~94.5%。遗传进化树显示:盐城株L、M、S基因属于C3基因亚群,具有独特的进化分支,为非主流优势流行株。结论盐城SFTSV毒株与江苏代表株不属于同一进化分支的毒株,可能有独特的传播途径。
- 刘伟陈国清徐丹张红军
- 关键词：分子特征分子流行病学
- 盐城市2013年手足口病病原学特征分析被引量：4
- 2014年
- 目的:对盐城地区2013年手足口病患儿及其临床重症病例进行病原学特征分析。方法:采集手足口病患儿咽、肛拭子,用肠道病毒实时荧光RT-PCR,对其病毒核酸进行肠道病毒检测定型。结果:491例(重症26例)患儿采集咽、肛拭子标本中,共检出肠道病毒核酸阳性193例(39.31%)中,EV71型35例(18.13%);CVA16型35例(18.13%),CVA6型96例(49.74%),其他未分型27例(13.99%)。临床重症病例14例中,EV71型3例,CVA16型0例,CVA6型9例,未分型2例,CVA6与EV71、CVA16三者发病比较,差异有统计学意义(χ2=8.0,P<0.01)。结论:检测的以往常见的EV71和CVA16型转变为CVA6型,它是引起重症病例的主要病原体,也是区域性手足口病的重要病原。
- 王瑶陈国清邵荣标许晓庆
- 关键词：手足口病EV71
- 盐城市1起病毒性脑炎疫情的肠道病毒Echovirus18VP1基因分子特征
- 2021年
- 目的对盐城市1起病毒性脑炎聚集性疫情分离的Echovirus18(E-18)型肠道病毒进行VP1基因分子进化特征分析。方法通过实时荧光RT-PCR方法,对2019年盐城市病毒性脑炎聚集性疫情标本进行肠道病毒的检测,对非EV71或CVA16其他肠道病毒进行分子分型,采用RT-PCR扩增E-18型肠道病毒VP1基因并测序,采用生物信息软件从核苷酸、氨基酸和分子进化3个层面进行分子特征分析。结果该起病毒性脑炎聚集性疫情是由E-18型肠道病毒感染引起,其6例病例;肛拭子肠道病毒核酸通用阳性4例,阳性率66.67%;均为轻症,全部治愈。4株E-18型肠道病毒株VP1基因片段均未见核苷酸的插入或者缺失,长度均为861bp、编码287个氨基酸,其核苷酸、氨基酸同源性分别为99.9%~100.0%和100.0%;与2019年E-18型手足口病盐城株(151/HFMD/JSYC/2019)VP1基因核苷酸、氨基酸同源性分别为99.5%~99.7%和100.0%;与原型株Metcalf VP1基因核苷酸、氨基酸同源性分别为79.0%~79.1%和93.4%。遗传进化树显示,2019年盐城市4株病毒性脑炎代表株与1株手足口病代表株聚集成簇,构成1个独立进化分支,属于C2基因亚群分支毒株。与原型株Metcalf相比,盐城市4株病毒性脑炎代表株涉及19个氨基酸位点的变异,变异率为6.62%,与1株手足口病代表株在VP1基因B-C loop区域发生了R84N氨基酸位点的变异。结论该起病毒性脑炎聚集疫情由E-18型肠道病毒引起,该病毒属于C2基因亚群优势进化分支,与本地手足口病代表株可能有共同的来源。
- 李春香陈国清王瑶李峰徐士林李长城
- 关键词：病毒性脑炎基因型VP1基因
- 荧光PCR的Ct值梯度对肠道病毒CVA6分离的接种剂量的影响
- <正>探讨荧光定量PCR的Ct值对CVA6分离的接种剂量影响,以提高病毒的分离率。采用荧光RT-PCR法对疑似手足口病例咽拭子与肛拭子标本病毒核酸进行检测,筛选出不同Ct值梯度(20≤Ct<25,25≤Ct<30,30≤...
- 陈国清王瑶许晓庆邵荣标
- 关键词：接种剂量PCR肠道病毒
- 文献传递
- 2016年盐城地区麻疹病毒分子分型及血凝素蛋白基因特征分析被引量：1
- 2017年
- 目的 鉴定2016年流行于盐城地区的麻疹野病毒的基因型别,并对血凝素蛋白基因进行分子进化特征分析.方法 通过实时荧光RT-PCR方法对2016年盐城市疑似麻疹病例咽拭子标本进行核酸检测,对麻疹病毒核酸阳性标本RT-PCR扩增核蛋白、血凝素蛋白基因并测序,采用相应的生物信息软件对核苷酸及氨基酸序列比对及基因亲缘关系进化特征分析.结果 2016年盐城地区麻疹病毒经基因型分型为H1a基因亚型和D8基因型.5株H1a代表株与江西代表株（KJ136545）聚集成簇形成独立的进化小分支,属H1a-1进化基因群分支;7株D8代表株与2009年美国代表株（JN635404）聚集成簇,属D8-3-2小分支基因群毒株.与疫苗株沪S191相比,盐城地区5株H1a基因亚型代表株240位氨基酸发生了S240 N的变异,丢失了238位N-连接的糖基化位点,7株D8基因型代表株未发生N-糖基化位点的变化.结论 2016年盐城地区麻疹病毒流行株主要为中国本土H1a优势基因亚型和D8输入基因型;除5株H1a基因亚型代表株丢失了238位N-连接的糖基化位点,盐城地区12株麻疹病毒HA基因大部分重要中和抗原位点未发生变异.
- 陈国清李春香王瑶李峰徐士林李长城邵荣标
- 关键词：麻疹病毒HA基因N基因
