李明慧
- 作品数：35 被引量：234H指数：7
- 供职机构：中国疾病预防控制中心传染病预防控制所更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项国家自然科学基金科技部科研院所社会公益研究专项更多>>
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- 湖南省啮齿动物携带汉坦病毒的分子流行病学研究被引量：10
- 2007年
- 目的研究湖南省啮齿动物中汉坦病毒（HV）流行情况及病毒型别。方法采用IFA法检测鼠肺中HV抗原；用RT—PCR法扩增阳性标本中HV的部分S和M片段；构建系统发生树进行系统发生分析及分型。结果在湖南省HV流行的地区共捕获啮齿动物344只，其中6份标本HV抗原阳性．病毒携带率为1．74％。对扩增出的部分S与M片段的核苷酸序列分析表明。5份标本中的病毒为汉城型HV（SEOV），1份为汉滩型HV（HTNV）。用S（620～990nt）与M片段G2区（2001～2301nt）核苷酸序列所构建的系统进化树显示，湘乡褐家鼠、黄胸鼠及黄毛鼠携带的病毒均为SEOV的S4亚型；宁远褐家鼠携带的病毒为SEOV的一个新亚型；石门小家鼠携带的病毒为HTNV的H4亚型。结论湖南省为混合型HV疫区，以汉城病毒为主，并具有宿主多样性。
- 张永振肖奇友李明慧邹洋吕炜戴德芳陈化新
- 关键词：汉坦病毒基因型系统发生分析
- 武汉市啮齿动物中汉坦病毒分子流行病学研究被引量：1
- 2010年
- 目的研究湖北省武汉市啮齿动物中汉坦病毒(Hantavirus)流行情况及病毒型别。方法采用间接免疫荧光法(IFA)检测鼠肺中HV抗原;用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)法扩增阳性样品中HV的部分S片段及部分M片段;构建系统发生树进行系统发生分析及分型。结果在武汉市肾综合征出血热(HFRS)疫区共捕获啮齿动物231只,在9份鼠肺样品中检测到HV抗原,其中5只为褐家鼠,2只为黄胸鼠,2只为小家鼠,病毒携带率为3.90%。用汉城型病毒(SEOV)特异性引物从7份HV抗原阳性样品中扩增出部分S片段(620～999nt)及部分M片段(2001～2301nt)并测定序列。对扩增出的部分S片段和M片段核苷酸序列分析表明,7株病毒与Genebank已提交的SEOV有很高的同源性,均为SEOV。但在用部分S片段及部分M片段核苷酸序列所构建的系统发生树上,7株病毒的聚集模式不同。结论武汉市啮齿动物携带S1和S4亚型汉坦病毒,表现出SEOV在同一地区的遗传多样性。
- 熊海萍李明慧朱莹段正秀田俊华陈化新张永振
- 关键词：汉坦病毒系统发生分析基因分型
- 吉林省汉城型汉坦病毒基因分型研究被引量：1
- 2010年
- 为了研究吉林省褐家鼠中汉城型汉坦病毒的基因亚型及其分布情况，采用间接免疫荧光法（IFA）检测鼠肺中HV抗原；用逆转录聚合酶链式反应（RT—PCR）法扩增阳性样品中HV的部分S片段及部分M片段；构建系统发生树进行系统发生分析及分型。结果显示，在吉林省肾综合征出血热（HFRS）疫区共捕获啮齿动物120只，在9份鼠肺样品中检测到HV抗原，其中7只为褐家鼠，2只为小家鼠，病毒携带率为7．5％。用汉城型病毒（SEOV）特异性引物从7份HV抗原阳性样品中扩增出部分S片段（620—999nt）及部分M片段（2001—2301nt）并测定序列。对扩增出的部分S片段和M片段核苷酸序列分析表明，7株病毒与GenBank已提交的SEOV有很高的同源性，均为SEOV。但在用部分S片段及部分M片段核苷酸序列所构建的系统发生树上，7株病毒的聚集模式不同。结论为吉林省褐家鼠携带S3亚型汉坦病毒。
- 熊海萍李明慧段正秀陈化新张永振
- 关键词：汉坦病毒系统发生分析基因分型地理分布
- 我国羊种布鲁氏菌rpoB基因遗传多态性分析被引量：3
- 2018年
- 目的调查中国羊种布鲁氏菌rpoB基因的多态性。方法利用AMOS-PCR对分离菌株进行种型鉴定;根据布鲁氏菌rpoB基因的4个多态性位点设计特异性引物,对299株羊种布鲁氏菌流行株(羊1型菌38株、羊2型菌19株、羊3型菌242株)的rpoB基因的4个多态性位点进行扩增,并将PCR产物测序结果与羊种布鲁氏菌标准菌株的扩增结果进行比对。结果羊种布鲁氏菌的rpoB基因检测发现,有169株为rpoB-2变异型、103株为rpoB-2型、24株为新的rpoB基因型(rpoB-4型)及3株为rpoB-1型。结论我国羊种布鲁氏菌rpoB基因具有较高的多态性,可作为羊种布鲁氏菌的分子流行病学调查靶基因,我国羊种菌rpoB基因型和生物型无相关性。
- 李明慧刘志国朴东日赵鸿雁田国忠姜海
- 关键词：羊种布鲁氏菌RPOB多态性基因型
- 北京市昌平区西伯利亚立克次体的分离和鉴定被引量：1
- 2014年
- 目的对北京市昌平区中国疾病预防控制中心园区内刺猬携带的中华革蜱进行斑点热群立克次体(SFGR)的分离和鉴定。方法采用形态学和分子生物学方法对SFGR进行鉴定,并进行系统进化特征分析。结果 SFGR对DH82细胞产生明显细胞病变;Gimenez染色后,可见较多清晰的立克次体被染成紫红色;细菌16S基因测定后,西伯利亚立克次体246株和西伯利亚立克次体BJ-90株相应核苷酸序列的同源性均为100%;系统进化分析显示,SFGR位于西伯利亚立克次体进化分支内,确认其为西伯利亚立克次体。结论北京市昌平区存在西伯利亚立克次体,该地区存在北亚热自然疫源地的可能性。
- 贺金荣李明慧陈小萍李辞修
- 巴彦淖尔市肾综合征出血热疫情分析
- 2008年
- 目的调查1999年后巴彦淖尔市及周围区域流行性出血热疫情呈逐年上升趋势的原因。方法对2005年春末在巴彦淖尔市临河区有HFRS病人的居民区捕获褐家鼠119只、小家鼠21只、获得鼠血条126份、9份病人血清和2份正常人血清样本。以间接免疫荧光和RT-PCR等流行病学检测技术,综合全市人文地理特征分析。结果恢复期病人及病人密切接触者的IgG均显示对SEO型L99株抗原的反应滴度高于HTN型76-118株,从褐家鼠筛选出9个阳性标本,对其部分S和部分M核苷酸序列进行系统发生分析,均为SEOⅠ亚型。结论汉城病毒为巴彦淖尔市流行性出血热暴发的主要病原体。褐家鼠为优势鼠种,有很高的感染率和带病毒率,是主要传染源和储存宿主。
- 高娜马超杨鹏飞李明慧张永振
- 关键词：汉坦病毒系统进化
- 呼伦贝尔市啮齿动物携带汉坦病毒的基因分型研究
- 2007年
- 为了研究内蒙古自治区呼伦贝尔市啮齿动物中汉坦病毒(HV)的型别及携带病毒情况,采用间接免疫荧光法(IFA)检测鼠肺中HV抗原,用RT-PCR法扩增阳性标本中HV的S(620~999nt)片段,使用clustalX(1.83)以及Phylip3.63构建系统发生树进行分型研究。结果表明,在呼伦贝尔市HFRS疫点共捕获啮齿动物185只,在7份鼠肺样品中检测到HV抗原,其中6只为黑线姬鼠,1只为大林姬鼠,病毒携带率为3.78%。扩增到其中6份HV抗原阳性样品中S片段(620~999nt),分析获得的序列表明与现有的HTNV有最高的同源性,均为HTNV。其中NAa90、NAa118、NAa121和NAp137这4株病毒与分离自黑龙江黑线姬鼠的Bao14株分在同一分支,与病毒的亲缘关系最近,而NAa78、NAa100这2株病毒构成另一分支,与A9株的同源性为94.5%~95.5%,用部分M(2001~2301nt)片断的核苷酸序列构建的系统进化树与S片段的结果一致。结论:呼伦贝尔市的黑线姬鼠与大林姬鼠携带不同亚型的HT-NV,表现出HTNV在同一地区的遗传多样性。
- 马超李明慧张凤贤张永振
- 关键词：汉坦病毒系统发生分析基因分型
- 河北省2株汉城病毒的遗传特征分析
- 2010年
- 目的 对河北省2株汉城病毒（SEOV）进行基因分型及系统进化分析.方法 用RT-PCR法扩增SEOV Li株和LF18株的S与M全基因片段;利用DNAStar软件分析S与M基因片段核苷酸序列同源性;利用Phylip软件构建系统进化树.结果 Li株与LFl8株的全S基因片段均由1772个核苷酸组成,开放阅读框（ORF）的位置均为43～1332核苷酸,编码429个氨基酸的核蛋白.2株病毒的M片段全基因序列均由3653个核苷酸组成,ORF的位置均为49～3450核苷酸,编码1133个氨基酸的糖蛋白前体.2株病毒的糖蛋白前体有62个半胱氨酸残基以及6个糖基化位点.2株病毒的全S、M基因片段的核苷酸序列与包括疫苗株L99、Gou3、Z37在内的已知SEOV的同源性分别为87.6%～99.2%和83.6%～97.3%.全S和全M基因片段构建的系统进化树显示2株病毒均为SEOV第Ⅲ亚型.结论 Li株和LF18株都属于SEOV,为SEOV的第Ⅲ亚型.河北省汉坦病毒的流行毒株的遗传特征与疫苗株Z37相似.
- 郭文平林献丹王文李明慧朱会宾张永振
- 关键词：系统进化分析
- 河南省两株狂犬病毒核蛋白和糖蛋白基因的序列分析被引量：11
- 2007年
- 目的分析河南省2株狂犬病毒核蛋白及糖蛋白的基因序列，了解狂犬病毒街毒株与人用及兽用狂犬病疫苗株间的差异。方法以免疫荧光法检测2004年采自河南省的100只犬脑标本，取阳性犬脑组织悬液接种鼠脑分离病毒。以RT-PCR法扩增病毒核蛋白及糖蛋白全基因，克隆测序后进行遗传学分析。结果分离到2株狂犬病毒，分别命名为Henan Hb1与Henan Sq1，序列分析表明2株病毒均为基因1型狂犬病毒，2株病毒的N基因与G基因核苷酸的同源性分别为99．3％和98．9％，氨基酸的同源性分别为98．7％和98．4％。2株病毒与CTN疫苗株同源性较高，N基因与G基因的核苷酸同源性分别为89．1％和85．6％～85．7％，氨基酸同源性分别为97．6％～98．0％和92．3％。与已知的基因1型狂犬病毒相比，2株病毒与印度尼西亚从犬中分离到的2株病毒同源性最高，N基因与G基因核苷酸同源性分别为92．1％～93．2％和91．9％～92．1％，氨基酸同源性分别为97．5％～98．6％和96．0％～96．2％。Henan Sq1株病毒在糖蛋白关键的毒力位点333位由W替换了R。系统发育分析表明Henan Hb1与Henan Sq1与印度尼西亚株、疫苗株CTN、中国分离株，以及泰国与马来西亚分离株进化关系最近，而与疫苗株3aG、PV、ERA及攻击毒CVS株等进化关系较远。结论2株狂犬病毒是基因1型狂犬病毒，但无论是N基因还是G基因的核苷酸序列，以及推导出来的氨基酸序列与已知的1型狂犬病毒株及疫苗株均有一定的差异。
- 熊成龙郝宗宇卢思奇李明慧王海峰孙建伟张彦平Zhen F. Fu张永振
- 关键词：狂犬病毒N基因G基因
- 褐家鼠携带2株汉坦病毒的遗传特征分析被引量：3
- 2010年
- 目的 分析来自内蒙古自治区呼和浩特市和河南省杞县两地褐家鼠标本中的汉坦病毒（HV）遗传特征,研究其与已知HV及疫苗株之间的关系.方法 提取病毒总RNA,用反转录-聚合酶链式反应法扩增阳性标本中HV的全M、S基因片段,测序后进行序列特征和系统发生分析.结果 成功扩增出2株HV（NM133株和Q12株）的全M、S基因片段,并测定序列.2株病毒的S基因片段核苷酸序列全长分别为1770nt和1772 nt,均仅有1个开放读码框（ORF）,编码429个氨基酸,M基因片段核苷酸序列全长均为3654 nt,编码1133个氨基酸.2株HV与绝大部分已知的汉城病毒（SEOV）具有很高的同源性;但与汉滩病毒（HTNV）等其他型HV同源性较低.2株病毒的核蛋白、糖蛋白氨基酸序列与疫苗株Z37具有一致的二级结构.另外,在用全S和M基因片段核苷酸序列所构建的系统进化树中,2株病毒被分在SEOV的Ⅰ亚型,与Hb8610、R22、HB55、L99以及K24-e7的亲缘关系最近.结论 2株病毒为SEOV的Ⅰ亚型,与包括疫苗株Z37在内的已知SEOV具有很高的同源性和一致的二级结构,提示当前的疫苗能有效预防SEOV引起的肾综合征出血热.
- 王文林献丹郭文平李明慧张永振
- 关键词：汉坦病毒基因分型
