孙命 作品数:64 被引量:197 H指数:8 供职机构: 中国科学院生物物理研究所 更多>> 发文基金: 天津市科技攻关项目 天津市教委基金 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 理学 化学工程 医药卫生 生物学 更多>>
具有抗艾滋病毒活性的多肽T22([T_(yr)^(5,12),L_(ys)~7]-Polyphemusin Ⅱ)骨架构象模拟 被引量:2 2001年 用势能平滑搜索方法,在平滑修饰的势能面上对具有抗艾滋病毒HIV-l活性的肽T22([T5,12yr,L7yr]-PolyPhemusin Ⅱ)骨架结构进行了全程搜索,得到该分子骨架结构在修饰势能面上的分子构象全集.用多构象优化方法,选择较适用于肽OPLS力场,采用GB/SA水溶剂模型,优化上述构象集,得到T22骨架结构在水溶液中优势构象集.结果表明势能平滑搜索与多构象优化相结合的构象分析方法是解决含有环结构的柔性分子构象分析中多重最小问题的有效方法. 孙命 车晔 缪方明 G.R.Marshall关键词:势能面 多肽 邻香兰素氨基酸希佛碱过渡金属配合物合成及表征 被引量:8 2000年 采用分步合成方法合成了以邻香兰素氨基酸 (甘氨酸、丙氨酸、苯丙氨酸 )希佛碱为配体的多种过渡金属 ( Cu、Zn、Ni、Co)配合物 ,并进行了元素分析和红外光谱表征 .结果表明配体通过亚胺氮、邻酚氧、羧基氧以三齿形式与金属形成一个五元环和一个六元环 ,另外有一个水分子与金属成配合状态 . 孙命 李雯 段月琴 缪方明关键词:邻香兰素 氨基酸 过渡金属配合物 L-精氨酸-顺丁烯二酸超分子复合物晶体组装中的氢键 2003年 一些结构简单的羧酸类有机小分子可能存在于生命起源前的地球上.对这些有机小分子与氨基酸分子相互作用得到的超分子复合物单晶体结构的研究,对于我们理解化学进化过程,探讨生物分子的聚合形式和分子间相互作用的实质有重要意义[1,2].…… 孙命 曲娜 金英 赵玉芬邻香兰素 氨基酸席夫碱及其配合物对O_2^-的抑制作用 被引量:11 2003年 The activity on O-2 of ligands from ovanillin and amino acid and their complexes were studied in this paper.Results showed that ligands and their complexes may inhibit the formation of O-2.Zn(Ⅱ)complexes display remarkable activity of inhibiting the formation of O-2. 乔艳红 孙命关键词:配合物 邻香兰素 生物活性 抗癌活性 抗痴呆症药中加兰他敏对映异构体的毛细管电泳分离及药物质量控制 被引量:14 2004年 建立了以 α-环糊精为手性选择剂的毛细管区带电泳用于分离治疗老年性痴呆病药物加兰他敏手性异构体的方法 ,测定了加兰他敏对映体与 α-环糊精包结物的键合常数和手性识别过程的热力学参数 .通过计算机模拟构象分析 ,探讨了分离机理 .研究结果表明 ,对映异构体最大分离度为 3 .60 ,R和 S对映异构体与α-环糊精的键合常数分别为 KR- CD=3 3 .98L/ mol和 KS- CD=2 3 .90 L/ mol.将该方法用于加兰他敏原料药分析 ,分离出 1 0种结构相似的化合物 ,测得非药效成分 R型异构体含量为 0 .82 % ,测定的线性范围为0 .0 1 5~ 1 .0 mmol/ L,迁移时间和峰面积的精度分别为 0 .2 0 %和 2 .6% . 颜流水 赵基源 罗国安 孙命 王义明 杨学东关键词:加兰他敏 对映异构体 药物质量控制 Α-环糊精 磷酸化对多肽中Xaa-Pro片段肽脯酰胺键顺反异构的影响研究(英文) 被引量:1 2007年 多肽和蛋白质中Xaa-Pro片段肽脯酰胺键顺反异构对其构象与功能有重要影响.设计合成了一系列模型多肽及其磷酸化多肽,并采用核磁共振实验和分子动力学模拟的方法,研究了所合成多肽中肽脯酰胺键的顺反异构化.结果表明,对脯氨酸之前的Xaa残基进行侧链O-磷酸化会极大地影响该顺反异构化过程,进而调节肽链构象.此外,磷酸化使得多肽顺式构象比例增加,且当磷酸基团不带负电荷时顺式构象所占比例最大.同时,分子动力学模拟所得结果与核磁共振实验相一致,包括最稳定构象和顺反构象统计分布.磷酸基团所带电荷及其空间位阻可能是影响这类磷酸化多肽构象变化的主要因素. 朱振泰 孙命 郭燕婷 李艳梅关键词:异构化 磷酸化 分子动力学模拟 3,4-二甲氧基-4′-硝基茋的合成和晶体结构 2002年 合成了 3,4 -二甲氧基 -4′-硝基 艹氐 化合物 ,用 X-射线衍射分析方法测定了该化合物的晶体结构 .该晶体属单斜晶系 ,空间群 P2 1 /c,a=1 .34 6 0 ( 3) nm,b=0 .76 5 8( 2 ) nm,c=1 .4 85 1 ( 3) nm,β=1 1 3.4 6 ( 1 ) 0 ,V=1 .4 0 4 1 1 nm3 ;Z=4 ,Dx=1 .35 g/cm3 ,μ=0 .91 cm- 1 .分子式 C1 6H1 5NO4,Mw=2 85 .30 ,F( 0 0 0 ) =6 0 0 .最终偏离因子 R=0 .0 5 1 ,Rw=0 .0 6 7.结构分析表明 ,晶胞中的四个分子头尾对称堆积 ,形成具有对称中心的空间排列结构 .虽然该化合物分子具有较高的二阶非线性极化率 ,但形成的中心对称晶体不具备二阶非线性光学性质 . 杜建云 孙命 周一民关键词:非线性光学性质 晶体结构 2′-胺基-6′-(二乙胺基)萤烷的晶体结构研究 1995年 2′-胺基-6′-(二乙胺基)萤烷的晶体结构研究陈红丽,孙命,刘景旺,刘小兰,缪方明(天津师范大学晶体化学研究所天津300074)关键词萤烷,晶体结构萤烷类化合物是现今各国集中研究的一类压敏色素,用于压敏复写纸的制造,特别是随着电子技术和计算机技术的... 陈红丽 孙命 刘景旺 刘小兰 缪方明关键词:晶体结构 胺基 乙胺基 咪唑啉酮类化合物的量子化学研究 被引量:10 1999年 采用 P M3 方法对灭草烟分子的4 种构象进行了量子化学计算, 进一步证实了模板分子构象的正确性;计算了19 种5取代咪唑啉酮化合物的原子净电荷、前线分子轨道能级分布, 讨论了它们可能的活性部位, 为咪唑啉酮类除草剂的合理设计提供了良好的理论基础。 王瑾玲 孙命 苏华庆 翟秀红 缪方明关键词:量子化学 除草剂 四-邻香兰素缩D,L-甲硫氨酸四铜的合成及晶体结构研究 作者在接近生物体内环境温度的条件下得到了邻香兰素D,L-甲硫氨酸席夫碱为配体的氧桥联四核铜的配合物,同时对基晶体结构进行了确定. 乔艳红 孙命 缪方明关键词:配位化合物 文献传递