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陈维洋
作品数:
2
被引量:1
H指数:1
供职机构:
湖南大学
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发文基金:
国家自然科学基金
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相关领域:
生物学
理学
自动化与计算机技术
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合作作者
廖波
湖南大学信息科学与工程学院软件...
苏志中
湖南大学信息科学与工程学院软件...
申众
湖南大学信息科学与工程学院软件...
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湖南大学
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苏志中
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计算机与应用...
年份
2篇
2009
共
2
条 记 录,以下是 1-2
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蚁群算法和编码理论在序列分析中的应用
随着人类基因组计划的开展,以及各种生物基因序列的研究,产生了越来越多的分子序列数据。对这些序列数据进行科学的分析、处理可以推动生物信息学的发展。序列分析是生物信息学中的基本操作,通过分析序列之间的相似性可以预测它们之间的...
陈维洋
关键词:
双序列比对
多序列比对
蚁群算法
文献传递
1种基于信息理论的新分子序列度量法
2009年
传统的方法度量序列之间的距离需要序列比对,使一些主观因素破坏数据的原始状态,导致计算结果因人而异。本文拟介绍一些基于信息理论的度量法,提出1种类似的新度量法,建立数学依据。这些度量法度量序列之间的距离不需要序列比对,没有主观因素干涉。同时,选取了20种胎生哺乳动物的线粒体全基因序列,分别使用这些度量法计算出他们的距离,再利用NEIGHBOR法构建系统树。由比较结果看来,新方法用较少时间构建的系统树完全不逊色于以往的方法。这为研究分子序列的差异性提供了1种新方法。
苏志中
廖波
陈维洋
申众
关键词:
信息熵
系统树
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