胡加谊
- 作品数：18 被引量：32H指数：3
- 供职机构：中国热带农业科学院环境与植物保护研究所更多>>
- 发文基金：公益性行业(农业)科研专项海南省科学事业费项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生自动化与计算机技术更多>>
- 菠萝MADS-box基因家族的生物信息学分析被引量：10
- 2017年
- MADS-box转录因子是植物生长发育过程的重要调控因子。为了解菠萝MADS-box转录因子的序列特征和分类情况,本研究采用生物信息学方法,对菠萝全基因组的MADS-box进行序列分析,包括菠萝MADS-box转录因子的数量、外显子和内含子组成情况、编码蛋白的基本特性及系统进化树的分析。结果表明,菠萝基因组中有40个MADS-box转录因子,且基因结构分析表明8个菠萝MADS-box基因符合植物MADS-box基因的典型结构,具有6个内含子和7个外显子;27个菠萝MADS-box转录因子编码氨基酸在200~300个之间,其中最小的Ac MADS40仅有104个氨基酸组成,最大的Ac MADS08由436个氨基酸组成;40个MADS-box蛋白中有31个偏碱性,4个显酸性,5个呈中性;二级结构分析结果表明,6个MADS-box蛋白无规卷曲所占比例最高,Ac MADS02α-螺旋和无规卷曲都为25个,β-转角为5个;其余33个菠萝MADS-box蛋白均以α-螺旋所占比例最高;亚细胞定位预测结果表明,大多数MADS-box蛋白定位于细胞核,其他零星分布于其他细胞器;保守基序查找分析表明,包含基序1和基序2的MADS-box蛋白所占比率均在85%以上,说明基序1和基序2是菠萝MADS-box蛋白中的重要保守基序;系统进化树分析表明,属于Ⅰ型的菠萝MADS-box基因有14个,属于Ⅱ型的菠萝MADS-box基因有26个,且可细分为11个亚组,除了FLC和AGL15这两个亚组中没有菠萝MADS-box的成员,其他9个亚组均有菠萝MADS-box基因的分布。
- 胡加谊陈哲胡福初罗志文年宇薇何凡张治礼
- 关键词：菠萝MADS-BOX生物信息学系统进化树
- 从橡胶树叶片中分离筛选拮抗细菌的方法
- 本发明涉及一种从橡胶树叶片中分离筛选拮抗细菌的方法，该方法采用常规的采样分离方法从病叶上分离到细菌，通过将细菌与供试菌橡胶树炭疽菌RC178进行对峙培养，获得一株对橡胶树炭疽病病原菌RC178有明显抑制作用的拮抗细菌。所...
- 郑肖兰梁艳琼胡加谊吴伟怀习金根郑金龙贺春萍易克贤
- 文献传递
- 一种菠萝果腐病病原初步鉴定及生物学特性研究被引量：2
- 2014年
- 从海南菠萝产区的一种菠萝果腐病疑似样本中分离到了7株形态相近的真菌菌株,形态学鉴定结果表明该菌为链格孢菌[Alternaria alternata(Fr.)Kiessler];生物学特性研究结果表明,菠萝果皮榨汁培养基和PDA为病原菌生长适宜培养基;菌丝生长和孢子萌发最适生长温度均为28℃;菌丝生长和孢子萌发最适pH值分别为9和8;麦芽糖、果糖和半乳糖有利于菌丝生长,而果糖、半乳糖和蔗糖为病原分生孢子萌发的最适宜碳源;病原菌生长的适宜氮源为硝酸铵、酵母浸粉和天冬氨酸,酵母浸粉和天冬氨酸则有利于孢子萌发;完全光照最利于菌丝生长,分生孢子在光/暗交替条件下萌发率最高;病原孢子在RH≥95%的条件下才能萌发,水滴条件下孢子萌发率最高;病原菌致死温度为55℃处理20 min。
- 罗志文李向宏范鸿雁胡加谊何凡
- 关键词：菠萝果腐病病原鉴定生物学特性
- 海南黑金刚莲雾四季生产技术被引量：3
- 2012年
- 黑金刚莲雾是一个优良、具有较强商业和观赏价值的台湾莲雾新品种。本文针对黑金刚莲雾的生长特性,着重介绍该品种在海南生产过程中的水肥管理、树体管理、花果管理等关键技术,为提高黑金刚莲雾周年生产提供一定的技术依据。
- 胡加谊罗志文何凡李向宏
- 关键词：产期调节
- 菠萝MADS-box基因家族的生物信息学分析
- MADS-box转录因子是植物生长发育过程的重要调控因子。为了解菠萝MADS-box转录因子的序列特征和分类情况,本文采用生物信息学方法,对菠萝全基因组的MADS-box进行序列分析,包括菠萝MADS-box转录因子的数...
- 胡加谊陈哲年宇薇胡福初罗志文张治礼
- 关键词：菠萝转录因子MADS-BOX系统进化树
- 海南莲雾果腐病病原鉴定
- 果腐病是海南莲雾果实上发生的重要病害，也是莲雾主要病害之一.笔者从海南海口、琼海和三亚的莲雾园中采集果腐样本中分离到23株形态相近的真菌菌株，经柯赫氏法则验证，该菌为海南莲雾果腐病病原菌.以代表菌株SMP2010005为...
- 罗志文范鸿雁胡福初胡加谊彭超余乃通刘志昕何凡李向宏
- 关键词：果腐病
- 同步检测PMWaV-1、PMWaV-2和PMWaV-3的三重RT-qPCR方法的初步建立被引量：2
- 2017年
- 目前我国菠萝产区已相继报道3种菠萝凋萎相关病毒(PMWaV-1、PMWaV-2和PMWaV-3)。通过建立这3种菠萝凋萎相关病毒实时荧光定量RT-PCR(RT-q PCR)同步定量检测方法,为菠萝凋萎病毒的定性定量研究提供技术手段。根据这3种菠萝凋萎相关病毒的外壳蛋白基因序列分别设计特异性引物和Taq Man水解探针,在优化PMWaV-1、PMWaV-2、PMWaV-3三重RT-q PCR反应体系后,以PMWaV-1、PMWaV-2、PMWaV-3 CP基因目的片段的重组质粒为标准品绘制标准曲线,初步建立了PMWaV-1、PMWaV-2、PMWaV-3三重RT-q PCR检测方法。其中PMWaV-1标准曲线为y=-3.283logx+39.02,其扩增效率达101.7%,线性相关系数R2=0.999;PMWaV-2标准曲线为y=-3.393logx+37.53,其扩增效率为97.1%,线性相关系数R2=0.998;PMWaV-3标准曲线为y=-3.171 logx+38.48,其扩增效率为106.7%,线性相关系数R2=0.996;这表明3种菠萝凋萎相关病毒质粒标准品在同一反应体系中可稳定扩增,且线性关系表现良好,可用于后续试验。灵敏度试验数据表明,该方法对PMWaV-1、PMWaV-2、PMWaV-3的最低检测线分别为99,98,868拷贝;重复性试验表明PMWaV-1、PMWaV-2、PMWaV-3三重RT-q PCR扩增曲线的标准差小于0.267,变异系数小于1.44%。这表明建立的三重RT-q PCR检测方法可快速、准确、稳定地定量检测PMWaV-1、PMWaV-2、PMWaV-3等3种病毒,为PMWaV的定性定量研究和复合侵染机制的探索提供了技术基础。
- 胡加谊罗志文何凡李向宏胡福初范鸿雁刘志昕张治礼
- 关键词：实时荧光定量RT-PCRTAQMAN探针
- 菠萝凋萎相关病毒-3实时荧光定量PCR检测方法的建立被引量：4
- 2015年
- 【目的】建立菠萝凋萎相关病毒-3实时荧光定量PCR检测方法。【方法】根据PMWa V-3外壳蛋白基因的保守区域设计特异性引物和探针,通过优化PMWa V-3实时荧光定量PCR检测体系,构建以重组质粒为标准品的标准曲线,建立起PMWa V-3实时荧光定量PCR检测方法。【结果】该方法能特异性地检测PMWa V-3,且灵敏度是普通RTPCR的10倍;该方法重复性良好,组间和组内变异系数均小于1.73。【结论】建立的实时荧光定量PCR方法是一种快速、简便、可信度高的PMWa V-3定量检测方法。
- 胡加谊李向宏罗志文范鸿雁张治礼刘志昕何凡
- 关键词：TAQMAN探针
- 菠萝凋萎相关病毒-2实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立
- 菠萝凋萎相关病毒(Pineapple Mealybug Wilt Associated Virus,PMWaV)被认为是引起菠萝凋萎病(Mealybug Wilt of Pineapple,MWP)的关键因素,对菠萝生产...
- 胡加谊罗志文范鸿雁李向宏刘志昕何凡
- 关键词：TAQMAN探针实时荧光定量RT-PCR
- 菠萝凋萎相关病毒-1实时荧光定量RT-PCR检测体系的建立与应用被引量：3
- 2014年
- 菠萝凋萎相关病毒-1(Pineapple mealybug wilt associated virus-1,PMWaV-1)是田间检出率最高的菠萝凋萎病毒。本研究根据PMWaV-1CP基因保守序列设计特异性TaqMan探针和引物,建立并优化了PMWaV-1实时荧光定量RT-PCR检测方法。优化后的反应体系制备的标准曲线为y=-3.307×log x+38.18,相关系数r2为0.998。试验结果表明,该方法能特异性地检测PMWaV-1,对PMWaV-2、3和阴性对照均无反应;最低检测限达到40拷贝。重复性试验表明批内和批间变异系数均小于1.98%,是一种操作简便、特异性强、灵敏度高、重复性较好的PMWaV-1定量检测方法。样品检测结果表明PMWaV-1在菠萝植株老叶、嫩叶和吸芽中的病毒含量呈递减趋势。
- 胡加谊罗志文李向宏范鸿雁周朋章绍延张治礼刘志昕何凡
- 关键词：TAQMAN探针实时荧光定量RT-PCR
