孙全
- 作品数：36 被引量：58H指数：4
- 供职机构：重庆邮电大学生物信息学院更多>>
- 发文基金：重庆市自然科学基金国家自然科学基金重庆市科技攻关计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学文化科学更多>>
- 棉花腺体形成相关的miRNA差异表达研究被引量：1
- 2011年
- 植物miRNAs在基因表达、生长、发育等方面有十分重要的作用.本实验以棉花显性无腺体近等基因系为材料,利用miRNA基因芯片杂交技术,分析与腺体形成相关的miRNA的差异表达.结果表明,棉花腺体形成期共有30个miRNA有差异表达,其中表达上调的miRNA有24个,分别属于miR156,miR157,miR166和miR390家族.表达下调的miRNA有6个,分别属于miR149,miR169,miR289,miR705,miR1224和miR1227家族.miRNA家族作用的靶基因分析发现主要分布在发育、分化和多细胞机体分化等几类,这些miRNAs可能在细胞分化和腺体的形成中发挥重要作用.
- 蔡应繁何晓红孙全江怀仲莫剑川袁有禄石玉真
- 关键词：棉花MIRNA芯片腺体
- 棉花GbCaMBP基因在植物抗黄萎病中的应用
- 本发明公开了棉花GbCaMBP基因在植物抗黄萎病中的应用。本发明棉花GbCaMBP基因核苷酸基序列如SEQ ID NO.1、氨基酸序列如SEQ ID NO.1；本发明GbCaMBP基因在棉花中被沉默后植物抗黄萎病能力降低...
- 蔡应繁耿帅鹏孙全何琳龙璐高巍张骁
- 基于概念和路径视角构建生物信息学专业课程体系的实践
- 2022年
- 伴随生命科学和信息技术的进步,生物信息学日益得到飞速发展,同时也对生物信息学人才的培养提出了更为迫切的新要求。本文基于生物信息学的概念发展及其研究路径的视角分析了当前生物信息学专业课程体系设置的问题,并结合重庆邮电大学新版培养方案的修订,进行了生物信息学专业课程体系设置的实践分析,为高校生物信息学专业课程体系设置提供借鉴参考。
- 常平安何晓红孙全江怀仲李映红
- 关键词：课程体系
- 棉花GhLecRK1基因在植物抗黄萎病中的应用
- 本发明公开了棉花GhLecRK1基因在植物抗黄萎病中的应用。本发明棉花GhLecRK1基因核苷酸基序列如SEQ ID NO.1、氨基酸序列如SEQ ID NO.1；本发明GhLecRK1基因在棉花根中表达较其它组织高，且...
- 蔡应繁龙璐高巍何琳张慧孙全张骁
- 棉花GbABR1基因在抗黄萎病中的应用
- 本申请属于基因棉花抗性育种技术领域，具体涉及棉花<I>GbABR1</I>基因在棉花抗黄萎病中的应用的专利申请。所述<I>GbABR1</I>基因，蛋白序列分析表明，其含有一个典型的高度保守的AP2/EREBP结构域；该...
- 蔡应繁刘鑫龙璐孙全王微娜张骁
- 文献传递
- 蛹虫草菌种退化机理及预防措施研究进展被引量：20
- 2012年
- 蛹虫草作为虫草资源和健康食品,已人工栽培并实现产业化生产。其菌种在继代培养过程中的频繁退化不仅导致其产量急剧下降,经济损失严重,而且直接影响行业的发展。根据前人的研究,总结、阐述其退化的形态和机理及预防措施,为规范化栽培提供一定的理论基础和指导。
- 何晓红赵欢欢刘飞伍晓丽孙全
- 关键词：蛹虫草预防措施
- 棉花GbSLR1基因在植物根和分枝发育中的应用
- 本发明公开了棉花GbSLR1基因在植物激素信号响应、种子萌发、根发育和分枝发育中的应用。本发明棉花GbSLR1基因核苷酸基序列如SEQ ID NO.1，氨基酸序列如SEQ ID NO.1；本发明GbSLR1基因在拟南芥中...
- 蔡应繁张赛孙全何琳乔婧龙璐高巍张骁
- 棉花GbCML24基因的克隆及其功能分析被引量：1
- 2019年
- 钙调蛋白类似蛋白(CML)是一类Ca^2+感受蛋白,在植物生长发育和极性细胞起始伸长过程中发挥重要的作用。为了研究CML在棉花纤维发育过程中的功能,本研究从海岛棉7124中克隆到1个拟南芥ATCML24的同源基因,命名为GbCML24,并对其分子特征以及功能进行初步分析。结果表明,该基因序列包含1个465 bp的开放阅读框,编码1个由155个氨基酸残基组成的蛋白,生物信息学分析表明,GbCML24具有4个CML家族保守的EF-hand钙结合结构域。亚细胞定位主要位于细胞膜和细胞核,细胞质中也微弱可见。组织表达分析发现该基因在棉花的根、茎、叶、子叶、纤维中均有表达,在根中的表达量最高,在纤维中主要表达在纤维起始期(0 DPA)和第2次纤维快速伸长期(15 DPA)。启动子特异性分析表明转基因拟南芥的叶片、根和花器官中均检测到GUS活性,其中,莲座叶表皮毛中的GUS活性比较强。分析其ATG上游1 500 bp启动子序列顺式作用元件发现,在ATG附近500 bp处分布有大量和纤维发育有关的激素响应元件。荧光显微分析发现Ca^2+主要在纤维细胞中积累,胚珠培养发现低浓度的Ca^2+可以促进纤维伸长,而高浓度的Ca2+可以抑制纤维伸长,且随着外源Ca^2+的不同处理,纤维中GbCML24的表达量也发生变化,趋势与纤维长度相似。本研究克隆到1个棉花CML基因,在纤维发育的关键时期表达量升高,能感知Ca^2+的变化并随纤维伸长而变化,推测其与纤维发育有关,为后续纤维发育的机制研究提供了科学依据。
- 王艳鸽孙全李祖亮
- 关键词：纤维发育基因功能
- 海岛棉GbNAC1在抗黄萎病中的应用
- 本发明属于基因工程技术领域，具体涉及到海岛棉<I>GbNAC1</I>基因在抗黄萎病方面的应用专利申请。所述<I>GbNAC1</I>基因，GenBank ID:KP317496，与植物的黄萎病抗性相关。发明人发现在植物...
- 蔡应繁王微娜杨璨耿帅鹏孙全张骁宋纯鹏
- 文献传递
- 海岛棉单萜合酶基因克隆及其受黄萎病诱导的表达分析被引量：6
- 2016年
- 【目的】克隆海岛棉品种新海15中单萜合成酶基因（Gb TPS）,研究其受黄萎病诱导的表达情况,为进一步研究该基因在棉花抗黄萎病中的功能打下基础。【方法】克隆Gb TPS基因的开放阅读框（ORF）全长序列,对其蛋白序列进行生物信息学分析,并采用实时荧光定量PCR及病毒诱导的基因沉默对其抗病性进行分析。【结果】通过PCR扩增得到一个全长为1761 bp的ORF序列,命名为Gb TPS（Gen Bank登录号：KP247548）。生物信息学分析发现,该基因编码586个氨基酸,预测分子量为67.7 k D,等电点为5.79。系统进化树分析结果表明,Gb TPS属于Tps-g亚家族。Gb TPS基因经黄萎病菌诱导后,表达量在4~24 h内显著（P〈0.05）或极显著（P〈0.01）高于空白对照组。病毒诱导的基因沉默受黄萎病诱导后其病情指数为52.38,与对照组相比并无明显差异。【结论】Gb TPS基因仅在棉花抗黄萎病的早期发挥积极作用。
- 杨璨孙全王微娜耿帅鹏江怀仲蔡应繁
- 关键词：棉花黄萎病实时荧光定量PCR
