王黎明
- 作品数：13 被引量：71H指数：3
- 供职机构：中国科学院微生物研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划The Royal Society更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学生物学化学工程更多>>
- 一种条件致病节杆菌的分离与鉴定被引量：3
- 2003年
- 目的 对一株分离自慢性皮肤病变的少见细菌进行鉴定。方法 用表型性状、化学分类和 16SrDNA测序鉴定并作药敏试验。结果 为专性需氧具有杆 球循环的棒杆菌 ,在无机盐基础培养基上可利用单一有机化合物为碳源进行生长 ,其肽聚糖型为A3((Lys Ser Thr Ala) ,其 16SrDNA序列与氧化节杆菌和多色节杆菌极接近 ,同源性 99%以上。结论 此分离菌株属于节杆菌属中的氧化节杆菌群 。
- 尤敏管福来赵乃昕刘志恒黄英王黎明王红艳
- 关键词：感染菌节杆菌化学分类药敏试验皮肤病变抗生素
- 肠道微生物菌群共存网络的构建与分析被引量：3
- 2018年
- 【目的】将网络分析应用到肠道微生物的分析之中,探究肠道微生物共存网络拓扑结构等相关网络系数的分析,从而展现肠道微生物共存网络的特性。【方法】将之前研究中的肠道微生物数据根据雌马酚代谢能力划分成雌马酚产生者和非产生者两组,计算两组微生物相对丰度,得出菌种之间的相关系数,构建肠道微生物的共存网络,分析两组间共存网络参数的差异;运用随机网络检验现实网络拓扑结构的特异性,分析两组网络中菌种间的差异。【结果】共存网络中两组节点数分别为45个和47个,即分别有45个和47个不同菌种。比较两组网络结构的差异,发现雌马酚产生者组中的共存网络菌群具有更复杂的连接,且两组之间的其他网络参数存在一定的差异。通过将现实网络与随机网络对比可知,现实网络的拓扑结构具有一定的特异性。将具有代谢雌马酚相关物质能力的菌种在两组网络中标出,发现它们在雌马酚产生者组共存网络中更趋向与来自不同门的菌种产生相互联系。【结论】将网络分析应用于肠道微生物分析之中,可以发掘菌种之间的相互作用和网络拓扑结构的复杂性与差异性,展现肠道菌群结构中之前较少被认识到的一些特征。因而,网络分析的方法可以为未来肠道微生物的研究提供新的视角。
- 马越王军胡永飞陈亮李晶律娜刘飞王黎明封雨晴朱宝利
- 关键词：肠道微生物网络分析随机网络雌马酚
- 云南酸性土壤中度嗜酸链霉菌的多样性被引量：3
- 2008年
- 【目的】了解酸性土壤环境里中度嗜酸链霉菌的多样性,调查其物种资源。【方法】用分散和差速离心法及选择性分离培养基从14份云南酸性土壤样品中分离到367株具有链霉菌培养特征的放线菌,并进行了颜色分群。从各颜色类群中选取代表菌株共97株,通过显微形态观察和pH梯度生长实验确定其中的中度嗜酸链霉菌。进一步从中筛选出16株中度嗜酸链霉菌代表菌株,进行16SrRNA基因序列的相似性和系统发育分析,并结合基因组DNA-DNA相关性数据。【结果】分离菌株归为12同的颜色类群,其中80%属于中度嗜酸链霉菌,其代表菌株在系统发育树上形成了8个距离较远且与已知种不同的进化分枝,可能代表链霉菌属内至少8个不同的新基因种。【结论】用以上方法筛选出的中度嗜酸链霉菌可归为8个不同于已知种的进化群,说明云南酸性土壤含有丰富多样的中度嗜酸链霉菌新物种。
- 徐春光梁秀梅黄英王黎明崔庆峰
- 关键词：RRNA基因系统发育分析多样性
- 酸性土壤中嗜酸稀有放线菌的多样性研究被引量：23
- 2004年
- 从江西、云南、北京采集的 10份酸性土样中分离出嗜酸放线菌 2 5 2株 ,其绝大部分为链霉菌。通过形态观察、pH梯度生长实验和细胞壁化学组分分析筛选出稀有放线菌代表菌株 2 0株。ARDRA分析表明 ,它们呈 11种不同的图谱类型 ,其中 9株的图谱相同 ,另外 4株的图谱与之差异不大 ,而其余 7株的图谱与之差异很大且各不相同。16SrDNA序列分析表明 ,2 0株稀有放线菌中的 18株分别属于 6个已知属 ,其中 13株属于诺卡氏菌属 (Nocardia) ,它们在系统发育树上处于多个进化分枝 ;各有 1株分别属于壤球菌属 (Agrococcus)、节杆菌属 (Arthrobacter)、北里孢菌属 (Kitasatospora)、考克斯菌属 (Kocuria)和嗜酸链霉菌属 (Streptacidiphilus) ;其余 2株是迄今尚未定名的一个新科 (“Ellin5 0 34group”)中的成员。实验结果显示 ,酸性土壤中的嗜酸稀有放线菌具有较丰富的种属多样性 ,其中诺卡氏菌属 (Nocardia)是一优势菌群。
- 崔庆锋王黎明刘志恒杨公明黄英张亚美
- 关键词：稀有放线菌ARDRA多样性
- 诺卡氏菌及相关放线菌的多相分类研究
- 该文的重点是对诺卡氏菌型放线菌的多相分类研究,分别依据形态和培养特征、生理生化特性、化学分类特征、分子分类特征和系统发育分析等多相分类方法对所研究的诺卡氏菌进行了系统与进化研究.描述并发表两个诺卡氏菌属新种:北京诺卡氏菌...
- 王黎明
- 关键词：诺卡氏菌系统发育
- 文献传递
- 用于防治妇女泌尿生殖道感染的弯曲乳酸杆菌
- 本发明公开了用于防治妇女泌尿生殖道感染的弯曲乳酸杆菌。本发明所提供的弯曲乳杆菌具体为弯曲乳杆菌(Lactobacillus.crispatus)IMC‑25，本发明的弯曲乳杆菌(Lactobacillus.crispat...
- 朱宝利张瑞芬律娜王黎明李晶
- 文献传递
- 用于鉴定哺乳动物肉类的引物及方法
- 本发明公开了用于鉴定哺乳动物肉类的引物及方法。本发明用于鉴定哺乳动物肉类的引物，由上游引物1、上游引物2、上游引物3、上游引物4、下游引物1、下游引物2、下游引物3和下游引物4组成。本发明提供的引物、试剂盒及方法可以在短...
- 朱宝利律娜秦宇轩胡永飞王黎明李晶张瑞芬
- 文献传递
- 西藏地区土壤放线菌种群多样性及拮抗活性研究被引量：34
- 2005年
- 从西藏不同海拔、不同气候条件的5个地区采集的10份土样中,使用选择分离培养基、ISP2(Yeast extract-malt extract agar)和高氏一号培养基,通过分散差速离心法(Dispersion and differential centrifugation,DDC)分离得到放线菌156株。根据形态和培养特征将其归入32个类群,并从中选出65个代表菌株进行全细胞壁氨基酸组分分析,结果表明:9株菌为非链霉菌胞壁类型,其余为链霉菌胞壁类型。16SrDNA扩增片段长度多态性(ARDRA)分析得到不同带型,对其序列分析结果表明:分离菌株分属链霉菌属(Streptomyces)和5个稀有放线菌属。同时测试了代表菌株抗耐药细菌和真菌的活性,其中38.5%的菌株具有拮抗活性。
- 罗红丽黄英王黎明刘志恒谢建平胡昌华
- 关键词：放线菌ARDRA种群多样性拮抗活性
- 宏基因组测序法检测市售益生菌产品的菌种组成被引量：3
- 2020年
- 目的:通过微生物宏基因组测序方法检测10种市售益生菌产品的菌种组成。方法:从益生菌产品中直接提取微生物宏基因组DNA,采用第二代高通量基因测序方法进行宏基因组测序,对测序结果进行生物信息学分析,确定每种产品中益生菌的菌种组成以及相对丰度。结果:所检测的10种产品中,仅有2种产品的检测结果与产品说明中所标注的菌种组成完全相符,其他产品均与各自标注有不符合之处,主要表现为菌种缺失或(和)含有其他混杂菌种。两次独立抽样检测结果一致。结论:监管部门需要对益生菌产品质量进行严格监控,而微生物宏基因组测序技术为监管部门提供了一个检测益生菌产品菌种组成的新方法。
- 曹淑曼王雪涵田薇赵雨婷朱宝利王黎明吕志堂
- 关键词：益生菌宏基因组
- 用于防治妇女泌尿生殖道感染的弯曲乳酸杆菌
- 本发明公开了用于防治妇女泌尿生殖道感染的弯曲乳酸杆菌。本发明所提供的弯曲乳杆菌具体为弯曲乳杆菌(Lactobacillus.crispatus)IMC-25，本发明的弯曲乳杆菌(Lactobacillus.crispat...
- 朱宝利张瑞芬律娜王黎明李晶
