黄晓平
- 作品数:7 被引量:11H指数:2
- 供职机构:南通大学附属医院更多>>
- 发文基金:江苏省卫生厅医学科研项目更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学更多>>
- 应用基因芯片技术筛选肝细胞癌相关基因被引量:5
- 2007年
- 目的:探讨基因表达谱芯片技术在筛查肝细胞癌(HCC)相关基因群表达中的作用。方法:TRIzol法抽提2例HCC及正常肝脏组织总RNA,分离纯化两种组织的mRNA;逆转录合成掺入生物素标记的cDNA合成探针,与基因芯片(涵盖了18400个转录本,代表了14 500个明晰的基因)杂交,扫描芯片荧光信号图像,计算机分析,比较2种组织基因表达谱差异。结果:2例HCC组织与正常肝脏组织相比,有2756条基因(19.01%)共同表达差异,其中共同上调基因1772条和共同下调基因984条,对2756条共同差异表达基因作了初步功能分类,这些基因与HCC的发病机制存在相关性。结论:基因表达谱芯片技术可以筛选出HCC表达异常的相关基因群,有助于认识肝癌的发病机制。
- 张弘黄介飞黄晓平黄东风魏群鲍柏军华婷琰
- 关键词:基因芯片肝细胞癌基因表达谱
- 基因芯片在肝细胞癌相关基因筛选中的初步研究被引量:2
- 2007年
- 目的探讨基因表达谱芯片技术在筛查肝细胞癌相关基因群表达中的作用。方法采用美国Affymetrix公司的U133A2.0基因表达谱芯片,按一步法抽提肝细胞癌及正常肝脏组织总RNA,分离纯化两种组织的 mRNA;经逆转录合成掺入生物素标记的cDNA合成探针,与芯片杂交和严格洗片后,用荧光扫描仪扫描芯片荧光信号图像,分析肝细胞癌及正常肝组织中差异表达的基因。结果在18400条基因中,肝细胞癌组织与正常肝脏组织间有2756条(14.98%)存在差异表达的基因,其中上调基因1772条和下调基因984条,对2756条差异表达基因作了初步功能分类,这些基因与肝细胞癌的发病机制存在相关性。结论基因表达谱芯片技术可以筛选出肝细胞癌表达异常的相关基因群,对其进一步研究有助于认识肝细胞癌的发病机制。
- 张弘黄介飞黄晓平黄东风魏群
- 关键词:基因芯片肝细胞癌基因表达谱
- 肝细胞癌组织中差异表达基因的初步筛选
- 2007年
- 目的探讨基因表达谱芯片技术在筛查肝细胞癌相关基因群表达中的作用。方法采用美国Affymetrix公司的U133A2.0基因表达谱芯片,按一步法抽提肝细胞癌及正常肝脏组织总RNA,分离纯化两种组织的mRNA;经逆转录合成掺入生物素标记的cDNA合成探针,与芯片杂交和严格洗片后,用荧光扫描仪扫描芯片荧光信号图像,分析肝细胞癌及正常肝组织中差异表达的基因。结果在14500条基因中,肝细胞癌组织与正常肝脏组织间有2756条(19.01%)存在差异表达的基因,其中上调表达基因1772条和下调表达基因984条,对2756条差异表达基因作了初步功能分类,这些基因与肝细胞癌的发病机制存在相关性。结论基因表达谱芯片技术可以筛选出肝细胞癌表达异常的相关基因群,对其进一步研究有助于认识肝细胞癌的发病机制。
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- 关键词:基因芯片肝细胞癌基因表达谱
- 肝硬化及肝癌组织共同差异基因表达的筛选被引量:2
- 2010年
- 目的筛选肝硬化和肝细胞癌(HCC)共同表达的差异基因。方法按TRIzol法分别抽提2例肝硬化、2例HCC和1例正常肝组织总RNA,逆转录合成掺入生物素标记cDNA合成探针,应用基因芯片进行肝硬化及HCC的相关基因表达谱差异分析,扫描芯片荧光信号图像,计算机分析,比较三种组织基因表达谱差异。结果发现2例肝硬化组织中共有1424条基因(9.82%)表达差异;2例HCC组织中共有2756条基因(19.01%)表达差异;而2例肝硬化与2例HCC组织中有851条基因(5.87%)共同表达差异,其中共同上调基因有649条,共同下调基因有202条。结论基因芯片技术能快速筛选肝硬化及HCC相关基因,分析这些共同差异性表达的基因,为阐明肝硬化及HCC复杂的生物学特性与基因表达之间的内在联系,寻找识别肿瘤的标记物提供了可能。
- 张弘黄介飞黄东风黄晓平魏群华婷琰
- 关键词:肝硬化肝细胞癌基因表达谱
- 应用基因芯片技术筛选肝硬化相关基因被引量:7
- 2007年
- 目的:探讨基因表达谱芯片技术在筛查肝硬化相关基因群表达中的作用.方法:按TRIzol法抽提肝硬化及正常肝脏组织总RNA,分离纯化两种组织的mRNA.经逆转录合成掺入生物素标记的cDNA合成探针,与基因芯片(涵盖18400个转录本,代表14500个明晰的基因)杂交,扫描芯片荧光信号图像,计算机分析,比较二种组织基因表达谱差异.结果:2例肝硬化组织与正常肝脏组织相比,有1424条基因(9.82%)共同表达差异,其中共同上调基因980条和共同下调基因444条.对1424条共同差异表达基因作了初步功能分类,这些基因与肝硬化的发病机制存在相关性.结论:基因表达谱芯片技术可以筛选出肝硬化表达异常的相关基因群,对其进一步研究有助于认识肝硬化的发病机制.
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- 关键词:基因芯片肝硬化基因表达谱
- TRA1 mRNA在肝硬化及肝癌组织中表达的研究被引量:1
- 2014年
- 目的探讨肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)组织、肝硬化(liver cirrhosis,LC)组织及正常对照组织中肿瘤排斥抗原1(tumor rejection antigen 1,TRA1)mRNA的表达及关系。方法采用逆转录-聚合酶链反应的方法检测34例肝癌患者肝癌组织、癌旁肝硬化组织、非肝癌的肝硬化患者活检组织、肝血管瘤及肝内胆管结石等对照组织中TRA1 mRNA的表达,用捷达801分析软件对结果进行相对定量分析。结果肝癌组织、肝硬化组织、对照组织TRA1 mRNA表达率分别为95.00%、84.21%、50.00%,肝癌组与对照组间表达率的比较,差异有统计学意义(P<0.05),肝硬化组织、对照组织表达率之间差异无明显统计学意义(P>0.05);肝癌组织、肝硬化组织、对照组织TRA1 mRNA表达量分别为1.67±0.96、1.49±0.53、0.57±0.27;扩增产物表现出表达量的不同,呈现渐变趋势,肝癌组织、肝硬化组织与对照组之间差异有统计学意义(P<0.05),肝癌组织与肝硬化组织比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论 TRA1参与了肝硬化、肝癌的发生、发展,TRA1可能是肝硬化和肝癌潜在诊断标志物和治疗靶点。
- 黄东凤黄介飞黄晓平魏群李峰张弘
- 关键词:肝癌肝硬化MRNA
- 应用基因芯片技术筛选肝细胞癌相关基因的研究
- 目的探讨基因表达谱芯片技术在筛查肝细胞癌(HCC,以下简称肝癌)相关基因群表达中的作用。方法采用美国 Affymetrix 公司的 U133 A 2.0基因表达谱芯片,按一步法抽提肝癌及正常肝脏组织总 RNA,分离纯化两...
- 张弘黄介飞黄晓平黄东风魏群鲍柏军华婷琰
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