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谭军
作品数:
4
被引量:2
H指数:1
供职机构:
上海大学
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发文基金:
上海市科学技术委员会资助项目
国家教育部博士点基金
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相关领域:
自动化与计算机技术
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合作作者
张武
上海大学计算机工程与科学学院
马进
上海大学计算机工程与科学学院
谢江
上海大学计算机工程与科学学院
文铁桥
上海大学
戴东波
上海大学计算机工程与科学学院
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机构
4篇
上海大学
作者
4篇
谭军
4篇
谢江
4篇
马进
4篇
张武
3篇
文铁桥
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戴东波
1篇
丁旺
1篇
郭毅可
传媒
1篇
计算机应用
年份
1篇
2016
1篇
2015
2篇
2013
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基于专家知识与拓扑相似的邻居优先生物分子子网搜索方法
本发明公开了基于专家知识与拓扑相似的邻居优先生物分子子网搜索方法。其步骤如下:A、根据生物分子的序列特征,构建网络T(G<Sub>t</Sub>)和B(G<Sub>B</Sub>)中生物分子的初始相似矩阵<Image f...
谢江
谭军
马进
张武
文铁桥
文献传递
生物分子网络拓扑结构比对的自适应方法
本发明涉及一种生物分子网络拓扑结构比对的自适应方法。该方法用于寻找两个生物分子网络生物学意义上的最优映射,其步骤如下:A、构建第一生物分子网络<Image file="DEST_PATH_IMAGE002.GIF" he...
谢江
马进
项超娟
谭军
丁旺
文铁桥
郭毅可
张武
文献传递
用于生物分子网络比对的自适应匈牙利贪心混合算法的并行化
被引量:2
2013年
生物分子网络比对是生物信息学中一个重要领域,是研究生物现象和生命机理的有效手段,而自适应匈牙利贪心混合算法(AHGA)是其中一个有效的生物分子网络比对算法。但是生物分子网络数据的规模都比较大,而且由于其拥有生物背景,生物分子网络数据具有一些特殊性。为了能够在可以接受的时间范围内获得大规模生物分子网络的比对结果,使用MPI和统一计算架构(CUDA)对自适应混合算法进行了并行化,在比对中充分考虑生物分子网络的生物学意义,对两种方式进行了对比分析,以寻找更合适生物分子网络的比对方法。
马进
谢江
戴东波
谭军
张武
关键词:
自适应
混合算法
并行化
基于专家知识与拓扑相似的邻居优先生物分子子网搜索方法
本发明公开了基于专家知识与拓扑相似的邻居优先生物分子子网搜索方法。其步骤如下:A、根据生物分子的序列特征,构建网络T(G<Sub>t</Sub>)和B(G<Sub>B</Sub>)中生物分子的初始相似矩阵<Image f...
谢江
谭军
马进
张武
文铁桥
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