詹科
- 作品数：2 被引量：0H指数：0
- 供职机构：中国科学院软件研究所更多>>
- 发文基金：中国科学院知识创新工程重要方向项目国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术更多>>
- 基于MPI和CUDA的蛋白质定量软件的设计和分析
- 2013年
- 介绍了蛋白质定量软件的设计及测试结果,分析结果表明:P-QuantWiz软件在曙光6000的Intel集群部分,测试规模达到2048核,在256核加速比仍在增加。相对P-QuantWiz软件在单CPU运行的结果,PG-QuantWiz软件在单GPU运行的加速比为8.1,在16个GPU上运行的加速比为14.18,并行效率为89%。
- 詹科王靖袁良张云泉
- 关键词：MPICUDA
- 基于Pthreads的并行DSRC压缩算法设计与实现
- 2015年
- 高通量测序仪产生大量的DNA数据,FASTQ是被广泛使用的存储DNA数据的数据格式。对FASTQ格式的数据进行压缩处理,能有效地节省存储空间。DSRC算法具有压缩比高的优点,因此对DSRC算法进行并行能提高压缩FASTQ格式的DNA数据的效率。基于Pthreads,实现了并行DSRC算法。测试结果表明,当使用4线程时加速比达到3.5。
- 詹科张云泉王婷郑晶晶张鹏
- 关键词：数据压缩DSRC
