叶纬材
- 作品数:11 被引量:1H指数:1
- 供职机构:中山大学更多>>
- 相关领域:自动化与计算机技术理学生物学更多>>
- 由序列通项表达式驱动的并行计算传输列表实时压缩方法
- 本发明公开了一种由序列通项表达式驱动的并行计算传输列表实时压缩方法,包括:S1、传输列表的逻辑分解并将传输列表按对象归属地划分;S2、非线性部分优化,利用非线性部分不等式的表格化来继续缩小范围,用组内涉及的变量的范围来验...
- 吴峻峰许跃生张勇瑞林英展王健珊关文超何鸿恺李达超叶纬材张永东江颖
- 文献传递
- 基于FMD索引和快表的跨越式种子查找算法
- 本发明公开了一种基于FMD索引和快表的跨越式种子查找算法,包括下述步骤:S0、构建数据库的FMD索引以及快表;S1、从快表中取出查询序列中长度为k的子序列的双区间;S2、这个步骤通过向后搜索算法,逐步找出k种子左边的匹配...
- 许跃生陈颖叶纬材
- 文献传递
- 选择粗化函数优化并行稀疏矩阵向量乘法
- 2012年
- 讨论了如何分划稀疏矩阵的非零元素以减少并行矩阵向量乘法的通信代价。通过以粗化函数为工具,统一现有的数据分划方法;提出一种基于行列分划为初解的粗化函数选取方法,在理论上的证明其运行效率与分划质量不逊于一维数据分划方法;实验数据表明,该方法产生分划质量超过一维数据分划方法的结果,接近甚至超过二维细粒度方上法的结果。
- 叶纬材
- CC$:一种面向分布式众核平台的并行编程语言被引量:1
- 2013年
- CC$是一种并行编程语言,目的是解决分布式众核并行计算机的编程困难。CC$的编程模型以Multi-BSP模型为基础,将分布式众核并行计算机的硬件架构抽象为3层。数据按照存储的层次和共享范围分为5类,以便在不同层次上提供共享。CC$还提出一类虚拟指令来解决不同层次之间的数据交换,实现数据访问的逻辑化描述。并行程序按照3层Multi-BSP超步嵌套执行。CC$具有统一的编程风格、内建的多层公共地址空间、数据访问请求的表达式描述和数据传输编译优化4大特点。测试表明,CC$程序的运行效率高,易学易用,大幅地缩短了开发周期。
- 吴峻峰许跃生张永东江颖叶纬材
- 关键词:并行计算编程语言并行编程模型
- 一种基于分子动力学和带容错功能的分布式血小板聚集模拟方法
- 本发明公开了一个基于分子动力学和带容错功能的分布式血小板聚集模拟方法;该方法包括:计算带容错的血小板粒子位移;计算血小板力粒子在T+dt时刻所受的力;输出模拟的中间结果;更新模拟时长;判断结束循环。本发明通过错误识别、数...
- 叶纬材邹青松谭志军
- 并行计算与生物序列比对
- 序列比对是生物信息学的基本问题,是了解基因序列潜在功能、结构和进化关系的关键手段。随着高通量测序技术的发展,基因测序的速度越来越快,生物序列和数据库呈现爆发式增长,GB级短序列和GB级数据库之间的序列比对任务大量出现。序...
- 叶纬材
- 关键词:生物信息学并行计算
- 一种矩阵数据架构及其基于压缩稀疏列的加速SPMV的方法
- 本发明涉及一种矩阵数据架构,包括矩阵头和矩阵块;所述矩阵头包括了矩阵行、列数,非零元个数、矩阵块的个数和向量化长度S<Sub>VVec</Sub>;所述矩阵块包括矩阵块元素每一个所述矩阵块对应的x向量像素几何方块的边长为...
- 叶纬材江颖
- 数值求解麦克斯韦方程问题的新工具——FULLMAX^(TM)软件介绍
- 2006年
- 叶纬材黄月坤
- 关键词:麦克斯韦方程组APPLIED电子设计自动化频率偏移
- 一个基于分子动力学和带容错功能的分布式血小板聚集模拟方法
- 本发明公开了一个基于分子动力学和带容错功能的分布式血小板聚集模拟方法;该方法包括:计算带容错的血小板粒子位移;计算血小板力粒子在T+dt时刻所受的力;输出模拟的中间结果;更新模拟时长;判断结束循环。本发明通过错误识别、数...
- 叶纬材邹青松谭志军
- 文献传递
- 由序列通项表达式驱动的并行计算传输列表实时压缩方法
- 本发明公开了一种由序列通项表达式驱动的并行计算传输列表实时压缩方法,包括:S1、传输列表的逻辑分解并将传输列表按对象归属地划分;S2、非线性部分优化,利用非线性部分不等式的表格化来继续缩小范围,用组内涉及的变量的范围来验...
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