刘默芳
- 作品数：32 被引量：109H指数：5
- 供职机构：中国科学院上海生命科学研究院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划中国科学院知识创新工程重要方向项目更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生文化科学更多>>
- RNA的免疫共沉淀分离及检测被引量：1
- 2010年
- 非编码RNA的发现使得RNA领域再次成为了生命科学研究关注的焦点。因为RNA是一种不稳定的生物大分子,绝大多数的RNA都需要与特定的RNA结合蛋白质结合形成RNA/蛋白复合物才能稳定存在于细胞中;不仅如此,RNA与RNA结合蛋白之间的动态关联贯穿和伴随了RNA的转录合成、加工和修饰、胞内运输和定位、功能发挥及降解的整个生命循环。鉴于此,利用RNA结合蛋白分离或发现鉴定功能性RNA分子是RNA研究领域中一个不可或缺的研究方法。简单地说,就是利用RNA结合蛋白的抗体免疫沉淀RNA/蛋白复合物,再从沉淀的RNA/蛋白复合物中分离得到特定RNA结合蛋白的RNA;分离得到的RNA可以通过末端标记和变性胶电泳对RNA分子的大小进行鉴定,也可以利用高通量RNA测序方法对RNA序列进行分析。
- 苟兰涛赵爽刘默芳
- 关键词：非编码RNA共沉淀分离免疫沉淀RNA结合蛋白生物大分子蛋白复合物
- 精子形成中的表观遗传调控被引量：2
- 2017年
- 精子形成是指单倍体球形精子细胞分化发育成为精子的过程。这一连续进程包含一系列复杂的生化事件和剧烈的形态变化,涉及顶体和尾部形成、组蛋白-鱼精蛋白转换、细胞核压缩和细胞质丢弃等。近期研究发现,表观遗传调控在精子形成过程中发挥重要作用,对确保精子细胞正常发育和精子生成至关重要。现总结近期的相关研究进展,从DNA甲基化和组蛋白修饰两个方面简介精子形成过程中的表观遗传调控功能和机制。
- 康俊炎苟兰涛刘默芳
- 关键词：精子形成表观遗传调控DNA甲基化组蛋白修饰
- miR-155和miR-21在乳腺癌组织中的表达被引量：2
- 2011年
- 微小RNA（miRNA）是近年来发现的一类新型内源性小分子非编码RNA，参与调控许多细胞生理过程，它们的异常表达与癌症发生密切相关。本研究旨在探讨miRNA家族成员miR-155及miR-21在乳腺癌组织中的表达及其与乳腺癌临床病理学特征的关系。
- 傅少梅张宏伟刘默芳蒋帅陆明华
- 关键词：MIR-155MIR-21乳腺癌组织临床病理学特征生理过程癌症发生
- miR-143靶向抑制己糖激酶-2治疗乳腺癌的实验研究被引量：1
- 2014年
- 目的在乳腺癌细胞MDA-MB-231中验证miR-143靶向抑制己糖激酶-2(HK2)改变其能量代谢达到治疗作用,并探讨18F-氟代脱氧葡萄糖(18F-FDG)和3'-脱氧-3'-18F-氟代胸苷(18F-FLT)在评估其疗效中的价值。方法实验分为三组,实验组转染miR-143模拟物(miR-143 mimic),阴性对照组转染无义序列小RNA,空白组不做任何处理。通过qRT-PCR和Western blot分别检测治疗前后HK2 mRNA和蛋白表达水平的改变,检测葡萄糖代谢和乳酸生成速率的变化,MTT法检测细胞增殖活性的变化,测定细胞对18F-FDG和18F-FLT摄取的动态变化,判断两种示踪剂在评估其疗效中的价值。结果实验组HK2 mRNA和蛋白的表达均降低;葡萄糖消耗和乳酸生成速率、细胞增殖活性较阴性对照组明显下降。18F-FDG与18F-FLT分别孵育细胞30、60、90和120 min后,摄取呈时间依赖性递增的趋势,并且各时间点的18F-FLT摄取率均低于18F-FDG。30 min时,实验组18F-FDG摄取率明显低于阴性对照组(21.81±2.75 vs.36.71±4.36),差异具有统计学意义(P<0.05),此时两组摄取18F-FLT无明显差异(12.03±1.53 vs.15.23±2.31,P>0.05)。60 min时,18F-FDG与18F-FLT在两组中的摄取率均出现统计学差异(P<0.05)。结论 miR-143能靶向抑制HK2改变其能量代谢达到治疗作用,18F-FDG在评估其疗效中具有更好的价值。
- 苗莹张凌飞梁胜石朔刘默芳李彪
- 关键词：乳腺癌18F-FDG18F-FLT
- 精氨酰-rRNA合成酶、基因及表达调控研究
- 大肠杆菌精氨酰-tRNA合成酶(ArgRS)是由577个氨基酸残基组成的单链蛋白.从其基因序列推导的蛋白质序列可知该酶含有四个半胱氨酸裂残基,分别位于第24位,第320位,第520位和第537位.从前的实验证明,ArgR...
- 刘默芳
- 关键词：精氨酰-TRNA合成酶半胱氨酸残基化学修饰定点突变
- 文献传递
- PIWI蛋白在后期精子细胞中泛素化修饰降解为精子形成所必需
- piRNA是新近从动物生殖细胞中发现的一类小分子非编码RNA,因其与生殖细胞特异性PIWI家族蛋白相互作用,故称之为PIWI-interacting RNA,简称piRNA.有证据表明,piRNA的生成和功能都必需要PI...
- 苟兰涛赵爽刘默芳
- 关键词：PIWIPIRNAAPC/C精子形成无精症
- piRNA/PIWI在小鼠后期精子细胞中的协同降解调控功能与分子机制
- piRNA是新近从动物生殖细胞中发现的一类小分子非编码RNA,因其与生殖细胞特异性PIWI家族蛋白相互作用,故称之为PIWI-interacting RNA,简称piRNA.有证据表明,piRNA的生成和功能都必需要PI...
- 苟兰涛赵爽刘默芳
- 关键词：PIWIPIRNAAPC/C精子形成
- MicroRNA作用机制研究的新进展被引量：26
- 2009年
- microRNA(miRNA)是一种非蛋白质的新型基因表达调控因子,对真核生物基因表达起非常重要的调控作用.关于miRNA的功能及作用机制方面的研究是当前生命科学研究的前沿热点,研究人员陆续提出了一些假说模型,诸如翻译起始抑制、翻译起始后抑制、mRNA降解、P小体(Processing Body),SG(Stress Granules)颗粒扣押靶mRNA等来阐述miRNA如何抑制其靶基因的表达.此外,最近还有文献报道了一些全新的miRNA作用方式,如去抑制和miRNA激活作用等.本文将简要介绍一些miRNA作用机制研究的新进展及相关作用模型.
- 赵爽刘默芳
- 关键词：MIRNA负调控去抑制
- 小RNA介导组蛋白3赖氨酸27的三甲基化(H3K27me3)
- 2015年
- 生物体内存在大量的不编码蛋白质序列的非编码RNA（noncoding RNA,nc RNA）,这些非编码RNA广泛参与生命活动的各个过程,包括基因表达调控、基因组稳定性维持、抵抗外源核酸侵染、个体生长发育和生殖等生理过程以及肿瘤发生等病理过程.在真核生物中,长双链RNA（double-stranded RNA,ds RNA）被摄取到细胞内后,
- 刘默芳
- 关键词：三甲基化蛋白质序列真核生物甲基化修饰组蛋白
- 绿色荧光蛋白被引量：40
- 2000年
- 来源于水母Aequoreavictoria的绿色荧光蛋白 ( greenfluorescentprotein ,GFP)现已成为在生物化学和细胞生物学中研究和开发应用得最广泛的蛋白质之一 .其内源荧光基团在受到紫外光或蓝光激发时 (λmax=395nm ,小峰在 4 79nm )可高效发射清晰可见的绿光 .GFP的高分辨率晶体结构为了解和研究蛋白质结构和光谱学功能关系提供了一个极好的机会 .GFP已成为一个监测在完整细胞和组织内基因表达和蛋白质定位的理想标记 .通过突变和蛋白质工程构建的GFP嵌合蛋白在生理指示剂、生物传感器。
- 刘默芳王恩多
- 关键词：水母绿色荧光蛋白生色团变种
