贵州医科大学生物与工程学院 作品数:328 被引量:424 H指数:8 相关作者: 贾义 薛慧 苏朝 邱炜 陈爽 更多>> 相关机构: 贵州大学数学与统计学院 贵州大学昆虫研究所 华中农业大学植物科学技术学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 贵州省科技计划项目 博士科研启动基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 文化科学 生物学 农业科学 更多>>
巨噬细胞与单核细胞黏附调控相关差异表达基因的分析 2020年 目的:通过筛选单核细胞(Mo)与巨噬细胞(Mφ)两个发育阶段黏附相关基因的表达差异,分析Mo分化成Mφ的过程中黏附相关基因的表达变化,为进一步研究Mo分化成Mφ过程中黏附特性变化的机制提供前期基础。方法:从NCBI基因表达数据库(GEO)中获得Mo和Mφ基因芯片数据(芯片编号:GSE11430),利用其内置的在线分析工具GEO2R筛选获得差异表达基因(DEGenes);STRING online数据库筛选可信度≥0.4的差异表达基因;Cytoscape软件中"MCODE"插件筛选出差异表达基因的核心模块。对STRING online工具筛选的差异表达基因进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析。结果:通过GEO2R筛选出Mφ相对于Mo的差异表达基因961个(Log|FC|≥2且P<0.05);进一步利用STRING online筛选得到差异表达基因670个;"MCODE"插件筛选出的核心模块中与黏附相关的上调差异表达基因为ANLN,与黏附相关的下调差异表达基因为FPR2;KEGG分析发现差异表达基因主要富集在细胞因子-细胞因子受体相互作用、吞噬体、细胞黏附分子等信号通路中,其中细胞黏附分子信号通路中PTPRM、CADM1、CD276等基因表达上调以及ITGAL、SELL、ICAM2、ICAM3等基因表达下调。结论:利用生物信息学揭示差异表达基因PTPRM、CADM1、CD276、ITGAL、SELL、ICAM2、ICAM3等可能在调控Mφ黏附功能中扮演重要作用。 童璐 岳萍 杨颖颖 黄瑾 曾柱 邱炜关键词:单核细胞 巨噬细胞 细胞黏附 细胞迁移 基因芯片 富氩保护焊混合气体供应方式的优化改进分析 2021年 对中车某车辆有限公司在富氩保护焊混合气体传统气瓶供应模式存在的缺点进行了分析,并提出了采用低温液体储罐替代气瓶进行集中供气的优化改进方案。优化改进后可有效提高富氩混合气的使用安全性、大幅度地降低富氩混合气的使用成本,提升公司的精益管理水平。 周小静 代志刚 胡思贵关键词:精益管理 原核表达家蝇抗菌肽Phormicin A,B蛋白对大肠杆菌标准株的影响 被引量:2 2019年 抗菌肽是近年来新型的抗菌剂药物候选者。以家蝇防御素家族Phormicin A、B抗菌肽为研究对象,探究了其对大肠杆菌的作用效果。采用原核表达法获得二者蛋白,将其作用于大肠杆菌标准株,通过微量液体稀释法测定其最小抑菌浓度分别为20和7.5 mmol/L,并绘制了二者作用于大肠杆菌标准株的时间生长曲线。结果显示:家蝇Phormicin A、B原核表达蛋白对于大肠杆菌标准株的生长具有一定的抑制作用,此研究为应用于抗临床大肠杆菌感染药物的研发提供了一定的参考。 王兵 王兵 王代琴 覃海 韦鹏威 姚杨 万珊 万珊 吴建伟关键词:家蝇 抗菌肽 鸡源性抗FB_1噬菌体单链抗体库的构建与鉴定 被引量:1 2015年 目的构建免疫鸡源性噬菌体单链抗体基因文库,筛选鉴定抗伏马菌素B1(fumonisin B1,FB1)的单链抗体。方法制备抗原免疫来亨母鸡,提取脾脏RNA反转录后通过PCR扩增获得单链抗体编码基因,构建单链抗体基因文库,噬菌体展示技术筛选抗FB1单链抗体,并利用表达ELISA检测抗体的亲和力。结果构建的单链抗体库的质量较高,通过噬菌体展示淘选和ELISA鉴定获得5个抗FB1的单链抗体。结论成功构建鸡源性抗FB1噬菌体单链抗体库,并鉴定获得抗FB1的单链抗体,表明鸡源性噬菌体单链抗体库可用于分离FB1等小分子半抗原的特异单链抗体。 胡祖权 李和平 张静柏 刘锦龙 廖玉才关键词:伏马菌素 噬菌体展示 酶联免疫吸附实验 复杂网络节点相似性算法及其在癫痫病辅助诊断的应用 被引量:3 2017年 节点相似性分析是链路预测和社团挖掘中的重要部分.引入CN(Common Neighbor,共同邻居)算法、RA(Resource Allocation,资源分配)算法、AA(Adamic-Adar)算法、Sorenson算法等四种节点相似性算法作用于真实网络以及仿真网络(即小世界网络和无标度网络)网络,计算AUC(Area Under the Curve,曲线下面积)曲线从而比较算法的预测准确性,结果表明RA算法的预测准确性优于其他三种算法.随后将四种算法用于分析8例全身性癫痫患者脑电数据功能连接网络,结果发现RA算法预测准确性最佳,通过RA算法能确定最大节点相似度组成的节点簇,为量化大脑功能状态提供客观指标,未来可以将该方法用于临床辅助诊断. 何艳 赵晓婷 于云莉关键词:复杂网络 链路预测 癫痫 《医用高等数学》课程思政的教学改革途径探析 2021年 医学院校肩负着培养德才兼备型人才的重担,课程思政是能将德育渗入各类课程、发挥全方位育人的新举措,因此,为医用高等数学开展课程思政改革有其时代性和迫切性。本文分析了医用高等数学融入思政的必要性,从提升教师思政感悟、挖掘潜在思政元素、融入思政课程建设、培养学生自主学习等方面探讨了教学改革的途径,期望通识教育与思政教育协同前行,做到全员全程全方位育人,培养一批具有崇尚医德、家国情怀的合格医务人员。 李秋德 吉胜芬 黄文竹关键词:医用高等数学 教学实践 乳酸对未成熟树突状细胞生物力学特性和基因组转录水平的影响 2021年 目的高浓度乳酸是肿瘤微环境的一个显著特性,已经证实其在肿瘤形成和进展中发挥了关键作用。从生物力学和基因组学的角度研究乳酸对树突状细胞(DCs)功能的影响,为临床上基于重塑肿瘤微环境中DCs免疫功能的抗肿瘤疗法提供理论依据。方法分离野生型C57BL/6J小鼠的骨髓细胞,利用重组鼠白介素4和重组鼠粒-巨噬细胞集落刺激因子定向诱导6 d为未成熟DCs(imDCs)。 黄瑾 杨颖颖 刘新宇 童路 曾柱 邱炜关键词:未成熟树突状细胞 C57BL/6J小鼠 生物力学特性 白介素4 肿瘤形成 基于荧光图像的水凝胶几何网格重建及其力学性能有限元的模拟 2024年 目的探讨通过荧光图像重建水凝胶的几何网络及其用于有限元模拟的可行性。方法取冷水鱼皮的明胶水溶液,分别与28.2、56.5、113.0、141.0 mg戊二醛交联16 h,制备明胶水凝胶;采用动态热机械分析技术测量各组明胶水凝胶的力学性能,并计算压缩模量(Emeas),用激光共聚焦显微镜和图像分割程序分析观测各组明胶水凝胶的孔隙结构;采用图像分割及行进立方体算法进行各组水凝胶支架几何模型的三维重建,对水凝胶荧光图像进行预处理、分割、重建及优化;采用ANSYS Workbench计算有限元,使用静态结构分析模拟各组水凝胶的压缩试验,计算模拟得到模型的压缩模量(Esim)以及水凝胶结构的负载情况。结果动态热机械分析获得水凝胶的应力应变数据,计算得到Emeas分别为(457.0±30.8)、(942.7±260.5)、(2053.3±115.0)及(2133.3±125.8)Pa;观测到经戊二醛交联的水凝胶孔隙发生变化,且戊二醛浓度越高,水凝胶的孔径越小、孔数量越多;三维重建程序生成了可用于有限元体网格划分的水凝胶几何模型;有限元模拟计算得到的Esim与Emeas一致,分别为447.2、829.9、1987.7及2181.6 Pa;有限元模拟结果显示,水凝胶结构承担的载荷增加,与基体相比,纤维网络承担主要载荷且载荷增加量更大;当基体弹性模量增加,纤维网络与基体界面处的应力分布的不均匀性降低,与纤维网络相比,基体共享负载增加。结论利用三维重建方法构建了水凝胶几何模型,模拟的有限元模型可反映明胶水凝胶的力学性能。 吴少东 朱思勉 曾柱关键词:有限元分析 水凝胶 图像分割 三维重建 瘤内注射OVA mRNA治疗小鼠结肠癌的研究 被引量:2 2021年 目的研究瘤内注射OVA mRNA对小鼠CT26结肠癌的治疗效果,为以OVA为基础的肿瘤治疗提供新的思路。方法建立小鼠CT26结肠癌皮下肿瘤模型,将OVA mRNA直接注射至结肠癌荷瘤小鼠皮下肿瘤内,观察肿瘤生长和小鼠存活情况;实时荧光定量PCR检测小鼠肿瘤组织中细胞因子IFN-γ、TNF-α、IL-12、IL-6、TGF-β的表达;免疫荧光染色检测肿瘤组织中CD8^(+)T细胞的浸润情况;TUNEL试剂盒检测肿瘤组织的细胞凋亡。结果每只小鼠皮下接种5×10^(5)个CT26细胞成功建立了小鼠结肠癌皮下肿瘤模型。荷瘤小鼠瘤内注射OVA mRNA能显著抑制结肠癌皮下肿瘤生长和延长小鼠的存活时间,并且上调肿瘤组织内细胞因子IFN-γ、TNF-α和IL-12的表达以及增加肿瘤浸润CD8+T细胞的数量和促进肿瘤组织的细胞凋亡。结论瘤内注射OVA mRNA通过促进肿瘤细胞凋亡和抗肿瘤免疫应答,以治疗小鼠CT26结肠癌。 谢颖 张瑾宬 刘雨 周雪 杨君仪 刘鲜梅 刘丽娜关键词:结肠癌 卵清蛋白 基于改进3D U-net的CT肺部影像Covid-19感染区域自动检测研究 被引量:2 2023年 目的 研究基于改进3D U-net和计算机断层扫描(CT)的新型冠状病毒2019 (Covid-19)对肺部感染区域的自动检测算法。方法 本文Covid-19病人数据来自Covid-19 Lung CT Lesion Segementation Challenge-2020挑战赛,其中共199例Covid-19(RTPRC)检测为阳性病例,被划分为训练集(n=160)和验证集(n=39),测试集(n=50)来自公开的MosMed新冠肺炎数据集;同时选取NSCLC数据集作为肺部分割训练集(n=78),以及选取Covid-19-CT-Seg数据集作为测试集(n=20);本研究在3D U-net的基础上集成注意力机制,提出一种改进的3D U-net网络模型用于Covid-19患者的肺部感染区域的检测,并采用Dice系数、敏感性和特异性指标评估模型的检测能力。结果 所提方法在公开的MosMed新冠肺炎数据集上取得0.53的Dice系数、0.74的敏感性、0.99的特异性。结论 所提方法相比于最新算法在肺部感染区域自动检测上有更高的精度,有助于医生更好的掌握Covid-19对肺部的整体感染情况。 曾雷雷 陈利红 杨帆 缪月红 吴裕慧 雷平贵关键词:CT 计算机辅助诊断