广西大学科研基金(XBZ130087)
- 作品数：2 被引量：9H指数：2
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- 陆川猪肌肉生长抑制素基因的克隆与序列分析被引量：7
- 2014年
- 【目的】对陆川猪肌肉生长抑制素(MSTN)基因进行克隆及序列分析,为后期开展MSTN基因表达与陆川猪肌肉生长发育及脂肪沉积的相关性研究奠定基础。【方法】根据GenBank中已发表的猪MSTN基因序列(NM_214435)设计引物,以陆川猪背最长肌组织总RNA为模板,RT-PCR扩增MSTN基因cDNA序列,扩增片段经纯化、克隆、鉴定和测序分析,并应用生物软件进行蛋白质二级结构预测。【结果】克隆得到陆川猪MSTN基因编码区1128 bp,与GenBank已公布的约克夏、汉普夏、杜洛克、梅山猪、藏猪、广西巴马小型猪的基因同源性均在99.8%以上。陆川猪MSTN基因第294位点存在特有的碱基G,但未引起氨基酸改变。蛋白质二级结构预测结果表明,陆川猪的MSTN成熟肽包含有α螺旋、β转角、延长线和无规卷曲4种二级结构元件。【结论】猪MSTN基因高度保守,可作为研究陆川猪肌肉生长发育和脂肪沉积的候选基因之一。
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- 关键词：陆川猪肌肉生长抑制素基因克隆
- 陆川猪脂蛋白脂酶基因的克隆与序列分析被引量：3
- 2014年
- 【目的】对陆川猪脂蛋白脂酶(LPL)基因进行克隆与序列分析,为后期开展LPL基因表达与陆川猪肌内脂肪沉积的相关性研究奠定基础。【方法】根据GenBank中已公布的猪LPL基因序列设计引物,以陆川猪背最长肌组织总RNA为模板,利用RT-PCR扩增其LPL基因,测序结果用Lasergene 7.0软件进行序列分析,用MEGA 6.0软件进行同源性比较及构建系统进化树,同时利用在线蛋白质结构分析软件(PMP)预测陆川猪LPL蛋白二级结构。【结果】成功克隆获得陆川猪LPL基因编码区长1437 bp,与GenBank中已公布普通猪、大白猪、杜洛克猪、通城猪、贵州白香猪的基因同源性分别为99.6%、99.7%、99.7%、99.7%和99.4%。陆川猪LPL基因第760位点存在特有的碱基A,该突变导致缬氨酸突变为蛋氨酸。由基于LPL基因碱基同源性构建的物种系统进化树可知,广西陆川猪与大白猪的遗传距离最近,其次是山羊,最远的是小鼠。蛋白二级结构预测结果表明,陆川猪的LPL蛋白二级结构包含有N-端结构域和C-端结构域两个区域,且存在PLAT/LH2。【结论】LPL基因可作为研究陆川猪脂肪沉积的主要候选基因之一。
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- 关键词：陆川猪脂蛋白脂酶基因克隆同源性蛋白二级结构
