浙江省自然科学基金(LY12D06003)
- 作品数：2 被引量：23H指数：2
- 相关作者：王淑刚杨锐任继锐骆其君沈梅丽更多>>
- 相关机构：宁波大学更多>>
- 发文基金：浙江省自然科学基金公益性行业(农业)科研专项宁波市自然科学基金更多>>
- 相关领域：环境科学与工程生物学农业科学更多>>
- 坛紫菜养殖周期中的藻际微生物多样性被引量：19
- 2013年
- 【目的】坛紫菜是我国江浙海区栽培地主要经济藻类。观察紫菜养殖过程中藻际微生物的群落特点及变化,研究藻际环境中的微生物因素在紫菜栽培中的作用,为保证紫菜健康生长及病害防治提供理论与实验基础。【方法】采用传统纯培方法和PCR-DGGE技术分离归类坛紫菜养殖周期中的藻际微生物,并利用16S rDNA(细菌)和18S rDNA(真菌)序列测定及在线BLAST比对鉴定到属,比较分析不同生长阶段、不同养殖海区及养殖过程的坛紫菜藻际微生物的多样性特点。【结果】在坛紫菜养殖过程中总共分离到467株细菌,共41个属。分类结果显示藻际细菌归属于变形菌门(Alphaproteobacteria和Gammaproteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes),优势菌群为α-变形菌纲和γ-变形菌纲。分离到55株真菌,共15个属。分类结果显示绝大多数真菌归属于子囊菌门(Ascomycota),仅1株归属于担子菌门(Basidiomycota)伞菌纲(Agaricomycetes)。细菌多样性大于真菌。坛紫菜藻际细菌有19个特异菌属,对照海水细菌有13个特异菌属;从丝状体中分离到大部分真菌和放线菌,坛紫菜养殖丝状体和不同叶状体养殖阶段的藻际微生物类别差异明显。在分离的坛紫菜藻际微生物中发现了与引起细菌性红烂病的海科贝特菌(Cobetia marina)、引起白斑病的紫菜茎点菌(Phoma porphyrae)高度相似的菌株,以及与典型的腐霉如镰孢霉菌(Fusarium sp.)和曲霉(Aspergillus sp.)高度相似的菌株。【结论】坛紫菜养殖过程中藻际微生物的多样性受到紫菜生长形态、养殖时间及养殖环境等因素的影响。在藻际微生物中发现与紫菜致病菌高度相似的微生物,作为潜在致病微生物应得到重视。
- 沈梅丽杨锐骆其君王淑刚任继锐
- 关键词：坛紫菜细菌真菌多样性养殖周期
- 中国沿海9种红藻hsp70基因序列及系统进化分析被引量：4
- 2013年
- 本研究自山东青岛、浙江象山和江苏南通采集共9种红藻样品,隶属于2纲、5目、6科、8属(据NCBI),克隆各红藻hsp70基因,并对所获序列进行分析。利用特异性引物P1/P3扩增,得到的目的条带约630bp,分析所推导的氨基酸序列发现:所获得片段均位于HSP70的ATPase结构域附近。9种红藻hsp70序列之间的遗传距离在0.078～0.319之间,序列相似度在73%～92%之间,其保守性略低于HSP70蛋白;基因对A或T结尾的密码子表现出很高的偏好性,CGC与TGG这两种密码子在这9种红藻HSP70氨基酸密码子中未出现。上述表明hsp70及HSP70密码子偏好性可应用于红藻分子系统学研究。基于多物种HSP70构建的进化树可见,Cyanidium caldarium与Cyanidioschy-zon merolae strain 10D两种原始红藻的起源早于其他红藻,紫菜次之,本研究中9种红藻系统发生符合NCBI的描述。在真菌、藻类和植物中,营养方式的差异可能是造成HSP70进化树分化的基本原因,而相同形态类型的物种中,环境适应是抗逆能力强、遗传结构稳定的物种生物分子进化的重要因素。
- 杨锐王淑刚陈娟娟徐丽宁王亚军孙雪
- 关键词：红藻HSP70系统进化
