山东省农业良种工程项目(2007LZ10-05)
- 作品数:6 被引量:21H指数:3
- 相关作者:李秋玲王洪梅王长法仲跻峰侯明海更多>>
- 相关机构:山东省农业科学院青岛农业大学四川农业大学更多>>
- 发文基金:山东省农业良种工程项目公益性行业科研专项国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 中国荷斯坦牛TLR2基因遗传多态性的研究被引量:3
- 2008年
- 以297头中国荷斯坦奶牛为研究对象,以TLR2(Toll like receptor 2)基因为目的基因,扩增目的片段,结合测序结果采用PCR-RFLP和CRS-RFLP技术方法来检测TLR2基因第2外显子的遗传多态性。结果发现:exon 2存在10098(T/G),10111(G/A)和11541(C/T)3个单核苷酸突变,其中11541位点的T/C突变为首次报道。分别选择EcoRV、HaeⅢ、DraⅠ等3种限制性内切酶检测其多态性。10098位点有3种基因型(AA,AB,BB),A、B等位基因频率分别为0.784 5,0.215 5;10111位点有2种基因型(CC,CD),C、D等位基因频率分别为0.9858,0.0142;11541位点有3种基因型(EE,EF,FF),E、F等位基因频率分别为0.0993,0.9007。10098位点T-G碱基突变导致天冬氨酸突变为谷氨酸(Asp63Glu),10111位点G-A碱基突变引起甘氨酸突变为丝氨酸(Gly68Ser)。TLR2基因外显子2上的3个位点基因型在研究群体中的分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律(p>0.05)。10098,10111,11541 3个位点的多态信息含量、杂合度、有效等位基因数分别为0.2809/0.3381/1.5108,0.0279/0.0279/1.0287和0.1434/0.1789/1.2179。10098位点达到中度多态,其余2个位点处于低度多态。TLR2基因可作为候选遗传标记,进行深入研究。
- 张翠霞王洪梅李建斌王长法赖松家李秋玲仲跻峰
- 关键词:中国荷斯坦牛基因多态性PCR-RFLP
- 中国荷斯坦牛CXCR1基因第二外显子新SNPs与乳腺炎的关联分析被引量:4
- 2011年
- 通过研究中国荷斯坦牛趋化因子受体1(Chemokine(C-X-C motif)receptor1,CXCR1)基因多态性与乳腺炎间的相关性,找到对乳腺炎性状有显著影响的基因型和单倍型组合,为从遗传角度上解决奶牛乳腺炎问题提供参考。采用巢氏PCR、DNA测序和CRS-PCR-RFLP方法,对中国荷斯坦牛的CXCR1外显子2进行遗传多态性研究,分别利用SHEsis软件和PHASE软件进行配对连锁不平衡分析和单倍型分析。结果表明,找到了4个新SNPs,分别为291(C/T)、333(C/T)、337(A/G)和365(C/T)。各SNPs与中国荷斯坦牛体细胞评分(SCS)和产奶量的关联分析表明:337(A/G)和365(C/T)位点的等位基因G、C均为低SCS、高产奶量的优秀等位基因;另外,H3 H7(CCCTGGCC)单倍型杂合个体为低SCS、高产奶量的优秀单倍型组合。CXCR1基因的单倍型H3 H7(CCCTGGCC)在SCS和产奶量方面是优良的单倍型,可作为选择抗乳腺炎的分子标记。
- 周雷王洪梅王长法柳楠侯明海李秋玲仲跻峰
- 关键词:中国荷斯坦牛乳腺炎抗性单倍型
- 趋化因子受体CXCR1基因多态性与奶牛乳腺炎的关联性研究
- 引言趋化因子是能使细胞发生趋化运动的小分子细胞因子,趋化因子白介素-8被验证具有诱导中性粒细胞迁移等能力,其两受体α(IL8R-α,即CXCR1)和β(IL8R-β,即CXCR2)通过与趋化因子相结合并借助信号转导来实现...
- 周雷王洪梅王长法李秋玲侯明海仲跻峰柳楠
- 文献传递
- 中国荷斯坦牛GlyCAM1基因遗传多态性的研究
- 2009年
- 以273头中国荷斯坦牛为研究对象,利用CRS—PCR、PCR—SSCP及DNA测序技术检测了GlyCAM1基因外显子3、内含子3的遗传多态性。结果表明:GlyCAM1基因分别在外显子3和内含子3的第2081(A/C)、2417(C/T)位存在突变,2个位点的等位基因频率A/B分别为0.7525,0.2475和0.9046,0.0954;经菇。适合性检验,中国荷斯坦牛内含子3的突变达到Hardy—Weinberg平衡状态(P〉0.05),但其外显子3的突变未达到Hardy—Weinberg平衡状态(P〈0.05)。
- 李晶王洪梅王长法李秋玲侯明海李建斌柳楠仲跻峰
- 关键词:中国荷斯坦牛基因遗传多态性
- 中国荷斯坦牛白介素8受体基因编码区多态性与乳腺炎的关联分析被引量:11
- 2010年
- 【目的】通过研究中国荷斯坦牛白介素8受体的亚基A和B(IL8RA和IL8RB)基因编码区多态性与乳腺炎的关联性,找到与乳腺炎相关SNPs,为乳腺炎抗性分子育种提供可用的分子标记。【方法】采用巢氏PCR、DNA测序和CRS-PCR-RFLP方法,对中国荷斯坦牛的IL8RA和IL8RB编码区的遗传多态性进行了研究,分别利用SHEsis软件和PHASE软件进行配对连锁不平衡分析和单倍型分析。【结果】找到了8个SNPs,其中5个为新SNPs,分别为IL8RA的980(G/A)、995(G/A)和1008(C/T)和IL8RB的938(C/T)、959(C/T),这8个位点均不连锁。对IL8RA和IL8RB的单倍型分析发现,单倍型频率大于0.01的有15种。各SNPs与中国荷斯坦牛体细胞评分(SCS)和产奶量的关联分析表明,IL8RA735(C/G)、816(C/A)、819(A/G)位点与SCS、产奶量相关,IL8RA的735(C/G)、816(C/A)、819(A/G)位点的C、C、G等位基因和IL8RB的938(C/T)、959(C/T)位点的T等位基因均为低SCS、高产奶量的优秀等位基因。另外,IL8RA的CCGAAC单倍型纯合个体的SCS极显著低于CAGGGT和GCAGGC单倍型纯合个体(P<0.01),而其305d产奶量极显著高于另外两种单倍型纯合子;IL8RBCT单倍型纯合个体的SCS显著低于CC、TC和TT单倍型个体,其305d产奶量显著或极显著高于其余3种单倍型。【结论】IL8RA和IL8RB的单倍型CCGAAC和CT在SCS和产奶量方面是优良的单倍型,可作为选择抗乳腺炎的分子标记。
- 官久强王洪梅王长法李秋玲李建斌帅素容侯明海仲跻峰
- 关键词:中国荷斯坦牛单倍型乳腺炎抗性
- 牛趋化因子受体基因1第2外显子的单核苷酸多态性分析被引量:2
- 2010年
- 采用DNA测序、巢氏PCR和CRS-PCR方法对中国荷斯坦牛、鲁西黄牛、渤海黑牛的趋化因子受体基因1(CXCR1)的单核苷酸多态性(SNPs)进行研究,在第2外显子上发现了4个SNPs,分别为291 bp(C/T)、333 bp(C/T)、337 bp(A/G)和365 bp(C/T),这4个位点在中国荷斯坦牛、鲁西黄牛、渤海黑牛群体中均达到中度多态(0.25
- 周雷王洪梅王长法李秋玲侯明海仲跻峰柳楠
- 关键词:单核苷酸多态性