海南省重点科技计划项目(ZDXM20120007)
- 作品数:2 被引量:6H指数:2
- 相关作者:赵春萍侯冠彧刘雅芳张立岭于萍更多>>
- 相关机构:中国热带农业科学院海南大学海南东盛弘蟒业科技股份有限公司更多>>
- 发文基金:海南省重点科技计划项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学更多>>
- 缅甸蟒线粒体基因组全序列测定与分析被引量:5
- 2014年
- 采用LA—PCR(10ngandaccuratePCR)、巢式PCR及TA克隆测序技术,首次获得缅甸蟒Pythonbivittatus线粒体基因组全序列(GenBank登录号NC_021479)。分析结果表明:缅甸蟒线粒体全长17617bp,与其它多数蛇类线粒体基因组结构相似,由13个蛋白编码区、2个rRNA、22个tRNA和双控区组成,基因间排列紧凑;与蟒属其它物种相比,缅甸蟒线粒体在氨基酸数目上存在增减现象;tRNA中tRNA—Cys长度最短,只有57bp,二氢尿嘧啶环无配对的茎区;缅甸蟒在两个控制区各存在3个相同的串联重复,可能是造成个体问相差87~89bp的原因。
- 刘雅芳曹婷刘建才于萍赵春萍侯冠彧张立岭
- 关键词:线粒体基因组氨基酸控制区
- 海南与越南缅甸蟒线粒体控制区遗传多样性及差异性分析被引量:2
- 2015年
- 为了更有效地保护、管理和繁育缅甸蟒(Python bivittatus)濒危物种,有必要利用分子技术对地方物种多样性和遗传分化进行研究。试验采用TA克隆双向测序方法对来自海南的37条缅甸蟒和来自越南的28条缅甸蟒部分控制区II序列进行了测定。结果表明,两个地理群体共分为25个单倍型,单倍型多样度(Hd)为0.877±0.025,核苷酸多样性(π)为0.004 76±0.000 41,平均核苷酸差异数(k)为2.676,显示缅甸蟒整体遗传多样性不高;通过比较两群体遗传多样性,发现海南缅甸蟒的单倍型多样度要高于越南缅甸蟒,但核苷酸多样性和平均核苷酸差异数低于越南缅甸蟒;基于控制区构建ML树和Network网络分析显示,两群体均各自形成了明显的两大分支;通过计算得到两群体的固定指数(Fst)为0.201(P<0.001),显示海南缅甸蟒与越南缅甸蟒存在极显著差异。
- 刘雅芳侯冠彧于萍赵春萍曹婷张立岭
- 关键词:控制区