目的:研究2012年5月-2013年4月肠道病毒71型(EV71)流行病学特征及 V P1区基因型特征,为该地区手足口病的防治提供科学参考。方法用实时荧光 PCR(FQ-PCR)方法对手足口病患儿咽拭子标本进行检测,对 EV71阳性样本通过 RT-PCR 方法扩增 V P1区全长基因,将扩增产物进行序列测定,利用生物信息学软件对序列进行分析,构建遗传进化树。结果196例 EV71感染患儿男124例,女72例,男女比例为1.72∶1,年龄以3岁以下为主,占93.9%;3~6月份为高发月份;6株来源于不同疾病程度的样本测序成功,6株 EV71 V P1基因间的核苷酸相似性为96.0%~99.7%,氨基酸相似性为94.6%~100.0%,来源不同疾病程度的 EV71 V P1基因未发现特异性核苷酸变异;在系统进化树上,均与 C4a 亚型代表株处于同一分支,核苷酸相似性为96.0%~98.6%,氨基酸相似性为98.0%~99.6%。结论手足口病患儿感染 EV71 以3岁以下的婴幼儿为主,在3~6月份多发,男性感染高于女性;EV71流行株属肠道病毒71型 C 基因型的 C4亚型,V P1基因与疾病的严重程度无明显关联。