国家自然科学基金(30973946)
- 作品数：21 被引量：147H指数：9
- 相关作者：王耘乔延江肖斌顾浩李萌更多>>
- 相关机构：北京中医药大学首都医科大学附属复兴医院北京林业大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家科技支撑计划国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：医药卫生理学更多>>
- 基于虚拟基因敲除的疾病分子网络关键节点辨识方法
- 目的：提出基于虚拟基因敲除的疾病分子网络关键节点辨识方法，以疾病相关分子网络为载体，通过考察网络中节点虚拟敲除前后对于其他节点的节点影响力值产生的影响，来判定被敲除节点的关键性，从而在宏观和微观两个层面上对关键节点进行研...
- 尤章林王耘顾浩乔延江
- 关键词：阿尔茨海默病生物标记物
- 基于机器学习方法的中药化学成分作用靶点的识别研究被引量：2
- 2010年
- 与有效成分相作用靶点的识别是从分子水平阐明中药作用机理的关键步骤。本文提出1种新的思路来解决中药化学成分的靶点识别问题。该方法基于小分子化合物的结构,计算表征分子组成、电荷分布、拓扑、几何结构及物理化学性质的分子描述符,经BestFirst搜索策略和CfsSubsetEval评估策略相结合的方法筛选出与靶点作用活性相关的分子描述符。采用径向基神经网络、朴素贝叶斯和随机森林3种机器学习方法构建一系列靶点的识别模型,后期将所建模型整合成靶点识别系统,进而预测中药有效成分的作用靶点。采用10折交叉验证,3种方法得到总的预测正确率分别为83.33%～95.71%、84.62%～96.43%、82.14%～95.59%,识别过程在(0.02～0.19)秒完成。实验结果证明该方法不但简单有效,更主要的是满足面向中药化学成分的靶点识别任务对辨识效率的要求。
- 郝金玲王耘乔延江
- 关键词：中药化学成分机器学习方法
- 中药功效概念网络构建及其应用被引量：7
- 2013年
- 目的:建立中药功效概念网络,揭示中药功效间的联系,明确功效概念网络的应用途径。方法:通过整理2010年版《中华人民共和国药典》(一部)记载的中药功效,对中药功效概念间的关联关系进行系统分析,构建功效概念网络,并从中抽提特定功效的子网络,利用网络聚类算法发现连锁出现的功效群。结果:构建包含422个功效概念的中药功效概念网络,发现经常连锁出现的21个功效群,并以活血功效为例,构建了活血功效的子网络,分析子网络在药物配伍中的应用方法。结论:中药功效概念网络是中医基础理论和临床用药经验的集中体现,能够系统揭示中药功效之间的联系,有利于指导中药的合理应用配伍,为疾病的治疗提供新的思路。
- 过红玲顾浩王耘乔延江
- 关键词：中药功效概念网络配伍
- 基于实体语法系统的中药方剂有效成分群辨识方法研究被引量：2
- 2013年
- 目的:阐明中药方剂的化学成分作用机理及其与治疗目标之间的关系,从多种成分中发现有效成分群性。方法:以中药方剂及其治疗的某一疾病为研究对象,以实体语法系统为理论框架,构建中药方剂有效成分群辨识的实体语法系统,推断其化学成分对疾病的作用,并以此确定治疗该疾病的有效成分群。结果:本文从治疗Ⅰ型糖尿病的方剂"白虎汤合消渴方"中识别出16个作用于Ⅰ型糖尿病网络中12个蛋白的化学成分,其中9个化学成分对Ⅰ型糖尿病的治疗具有积极的作用,可作为有效成分群的候选对象。结论:本法能够用于辨识中药方剂的有效成分群,揭示中药方剂的分子作用机制,并为中药方剂的有效成分研究提供一条新途径。
- 罗计王耘乔延江
- 关键词：中药方剂
- 活血化瘀中药功效网络的构建方法被引量：2
- 2010年
- 针对目前大多数中药成分作用靶点不明,难以分析中药功效作用机理的问题,以活血化瘀功效为例,提出基于中药药理作用的功效模块网络构建方法,建立了活血化瘀功效网络。结果表明此方法不但能够在一定程度上为解释中药功效作用机理提供理论依据,而且能够为复杂性疾病的治疗与药物开发提供新的线索,为中药功效网络的构建提供了一条可行的方案。
- 王耘王刚肖斌乔延江
- 关键词：系统生物学活血化瘀
- 药性组合与脏腑关系的复杂系统模型研究被引量：3
- 2013年
- 药性组合是性味归经具体内容的特定组合,可以简洁地表达药性理论在药物临床应用中的作用。本文基于藏象思维模型,建立药性组合与脏腑精、神、元气、气、血、阴、阳关系的复杂系统模型,揭示药性组合的作用特征。该模型的构建有助于中药药性理论与藏象学说的整体关联研究,为药性理论的发展和应用提供新思路。
- 王兰王耘乔延江
- 关键词：复杂系统
- 基于药性组合的中药性效规律研究框架
- 针对药性科学内涵与性效规律研究，本文提出药性组合与功效相结合的研究思路。药性组合是指由两个或两个以上药性要素所表达的中药功效。药性组合并非随机排列，而是由各药性要素的作用特点决定临床可能存在的组合形式。基于药性组合开展性...
- 王耘张燕玲史新元乔延江
- 关键词：合理用药
- 基于药性组合的中药性效规律研究框架被引量：29
- 2012年
- 针对药性科学内涵与性效规律研究,本文提出药性组合与功效相结合的研究思路。以具有某类传统功用的中药为研究对象,以药性组合为切入点,通过药性组合间的研究结果对比,在整体层次上发现传统功用与药性组合的客观规律,在单味药层次上明确药性的药效特点与代谢特征,在分子水平层次上揭示药性的物质基础、作用靶点及其效应的组织分布,从而建立中药"证候-功效-药性"系统网络,阐释药性理论的科学内涵与应用规律,为临床合理用药与药物研发提供理论依据。
- 王耘张燕玲史新元乔延江
- 关键词：合理用药
- 基于靶点网络的参仙冰抗心肌缺血有效成分群研究
- 参仙冰是根据临床经验组方的抗心肌缺血有效方剂。在参仙冰基础上进一步开发成分相对明确、作用机制基本清楚的现代中药是心肌缺血临床治疗的紧迫需求,因此需要对参仙冰中抗心肌缺血有效成分群进行研究,以便能够根据关键有效成分群设计提...
- 顾浩张燕玲王耘马群乔延江
- 关键词：生物网络心肌缺血
- 文献传递
- 中药功能靶点的研究被引量：10
- 2010年
- 化学成分-靶点作用关系是在分子层面对中药作用机制的阐释,没能有效结合中医对"人"是功能性认识的特点,同时也难以体现中药整体作用的特色。本文在借鉴西药作用靶点思想的基础上,提出中药功能靶点的研究。通过对2005版《中华人民共和国药典》第一部中所有中药功效术语的整理,得到135个功能靶点。以功能靶点与作用方式作为网络的节点,两者之间的关系作为边构建了中药功能靶点作用网络,并结合四君子汤、麻黄汤对功能靶点及其作用网络的应用进行了探讨。本文对中药功能靶点的研究,紧密结合了中药整体作用的特点,有助于在整体层面阐释中药的作用机制,为中药方剂配伍理论的研究提供了理论依据,为中药复方的设计与优化奠定了理论基础。
- 肖斌王耘
- 关键词：中药
