上海市自然科学基金(04ZR14113)
- 作品数：4 被引量：37H指数：3
- 相关作者：刘继斌朱佩云刘茶珍施民新王文静更多>>
- 相关机构：南通市肿瘤医院上海市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：上海市自然科学基金江苏省科技计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 应用SELDI-TOF-MS技术分析南通地区食管癌血清差异表达蛋白被引量：9
- 2006年
- 目的:应用SELDI-TOF-MS技术寻找食管鳞癌血清中相关差异表达蛋白。方法:应用表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术,用WCX2芯片分析了24对食管鳞癌和正常对照的血清蛋白表达谱。结果:与正常对照相比,发现其中6个血清蛋白在食管鳞癌和正常对照组的差异有统计学意义(P<0.05),其中在食管鳞组低表达的有M/Z为4623,5012,5809和9422,而高表达的有5910,11681。结论:SELDI-TOF-MS技术是一种快速、简便易行且高通量的分析方法,不仅能直接筛选出食管癌患者血清中差异表达的潜在标记物,而且可能具有较好的临床应用前景。
- 施民新刘茶珍刘继斌强福林朱佩云廖萍王文静张一心杨磊
- 关键词：食管鳞癌生物标记物
- 应用IMAC3蛋白芯片分析食管鳞癌患者血清蛋白质谱的变化被引量：26
- 2008年
- 背景与目的:血清蛋白指纹图谱技术有助于筛选与食管上皮癌变相关的分子变化。本研究通过比较食管鳞癌患者与正常对照血清蛋白表达谱的差异,筛选食管鳞癌相关血清蛋白标志物并建立诊断模型,同时探讨其在食管鳞癌血清学诊断中的意义。方法:收集68例食管鳞癌患者和44例正常对照的血清,其中建模型组90例(55例为食管鳞癌,35例为正常对照),盲法筛选组22例(13例为食管鳞癌,9例为正常对照)。采用固定金属亲和表面(immobilized metalaffinity capture,IMAC3)芯片,经表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(surface enhanced laser desorption/ionization-time of flight-mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)测定得到蛋白质谱,通过Biomarker Wizard软件比较两组人群的血清蛋白质谱的差异,经生物信息学分析得到决策树模型并进行盲法验证。结果:在质荷比(m/z)1.5～20ku范围内,共检测到78个有效蛋白峰,其中25个峰差异有统计学意义(P<0.001)。对建模型组的蛋白质谱数据,通过1000次随机抽样,得到1000个决策树。结合3倍交叉证实方法,构建了"食管鳞癌-正常对照"分组诊断的20个决策树模型。用这20个决策树来对22个盲法筛选样本进行归类预测,预测正确的样本为18个,盲法验证的灵敏度为92.31%,特异度为66.67%。结论:应用SELDI-TOF-MS技术可以筛选出食管鳞癌相关的血清蛋白标志,建立的决策树模型可以对食管鳞癌做出较为准确的预测判断。
- 刘茶珍朱佩云施民新刘继斌廖萍项翠琴张一心王文静
- 关键词：鳞状细胞血清SELDI-TOF-MS蛋白质组
- 表达蛋白质组学技术及其在食管癌研究中的进展被引量：1
- 2006年
- 蛋白质组学研究包括两种相互补充的策略。一种策略是表达蛋白质组学，观察某种细胞或组织中蛋白质的整体表达，并分析不同情况下表达图谱的变化；另一种策略是细胞图谱蛋白质组学，旨在定义蛋白质间的相互作用，以建立细胞内信号转导通路的复杂网络图。表达蛋白质组学是现今使用的最为广泛的蛋白质组研究模式。肿瘤是一种涉及到多分子事件的疾病，多数肿瘤目前缺乏有效的特异性诊断。蛋白质组学为肿瘤的研究提供了新的平台，可以实现同时大规模地对细胞内的蛋白质表达进行定性、定量分析，从整体的水平了解细胞内信号转导通路，从而有希望发现控制肿瘤进程的关键分子，为肿瘤的诊断、分型、药物研制带来新的思路和途径。本文就表达蛋白质组学研究的相关技术及其在食管癌研究中取得的进展作一综述。
- 刘茶珍朱佩云施民新刘继斌王文静
- 关键词：蛋白质组食管癌肿瘤标志物
- WCX2蛋白芯片筛选食管鳞癌血清标志蛋白的研究被引量：8
- 2007年
- 背景与目的:蛋白质组学研究有助于筛选食管上皮癌变相关的分子变化。本研究通过比较食管鳞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)患者和正常对照血清蛋白表达谱的差异,来筛选食管鳞癌相关血清蛋白标志物,为筛选和建立食管鳞癌早期诊断的血清学指标提供依据。方法:应用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术,采用弱阳离子交换芯片(WCX2)首先对训练组44对食管鳞癌患者和性别年龄匹配的正常对照血清蛋白表达谱的差异进行了分析,建立决策树分类模型后,对测试组进行盲法验证。结果:在质荷比(M/Z)2000～20000范围内,共检测到84个有效蛋白峰,其中28个峰差异有显著性(P<0.05)。自动选用M/Z为2545、3371、3746、5009、5021和15886的6个差异蛋白峰,建立食管鳞癌决策树分类模型,其灵敏度为93.18%(41/44),特异度为97.73%(43/44)。对测试组进行双盲检测,结果显示灵敏度和特异度分别为77.27%(34/44)和75.00%(33/44)。结论:应用SELDI-TOF-MS技术可以筛选出食管鳞癌相关的血清蛋白标志,建立的决策树模型可能对食管鳞癌的诊断具有重要的临床价值。
- 刘茶珍朱佩云施民新刘继斌王文静廖萍项翠琴张一心
- 关键词：食管鳞癌肿瘤标志物SELDI-TOF-MS蛋白质组
