中国科学院知识创新工程重要方向项目(KSCX2-EW-G-12)
- 作品数：13 被引量：57H指数：4
- 相关作者：龙丽娟张偲董俊德黄小芳田新朋更多>>
- 相关机构：中国科学院中国科学院研究生院中国科学院大学更多>>
- 发文基金：中国科学院知识创新工程重要方向项目国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学天文地球农业科学医药卫生更多>>
- 中国南海沉积环境可培养细菌多样性研究被引量：18
- 2014年
- 【目的】探索海洋沉积环境中可培养细菌的多样性。【方法】采用纯培养分离及16S rRNA基因序列鉴定的方法,对我国南海海域20个沉积物样品进行细菌多样性分析。【结果】共获得200株细菌,分属于47个属,99个种。经系统进化分析,可培养菌株主要分布于4个类群:厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes),优势类群为Firmicutes,其中芽孢杆菌属(Bacillus)所占比例为55.6%;而Actinobacteria和Bacteroidetes两个类群获得菌株较少;在Firmicutes和Actinobacteria两个类群中发现8个潜在新种和3个潜在新属级类群。【结论】初步研究结果表明,南海海洋沉积环境可培养微生物资源丰富,新物种资源多样;其中,芽孢杆菌为海洋沉积环境中的优势类群,随着样品深度的增加,细菌多样性呈现递减的趋势,深度可能是影响细菌多样性的一个重要因素;其次,分离培养基和分离方法直接关系到样品中可培养微生物多样性的发现,有待深入研究。
- 刘玉娟田新朋黄小芳龙丽娟张偲
- 关键词：沉积环境细菌
- 澄黄滨珊瑚和丛生盔型珊瑚非培养放线菌多样性被引量：4
- 2014年
- 【目的】研究澄黄滨珊瑚(Porites lutea)和丛生盔型珊瑚(Galaxea fascicularis)联合放线菌物种多样性。【方法】实验提取两种珊瑚的总DNA,利用放线菌特异性引物对样品总DNA进行扩增,通过构建16S rRNA基因克隆文库和系统发育分析,对三亚鹿回头岸礁区优势物种澄黄滨珊瑚和丛生盔型珊瑚联合放线菌的多样性和群落结构进行研究。【结果】118个从澄黄滨珊瑚克隆文库中随机挑选的阳性克隆子归为58个OTUs,主要分布于酸微菌亚目、棒状杆菌亚目、微球菌亚目、丙酸杆菌亚目和未知类群。丛生盔型珊瑚克隆文库共获得96个序列,归为31个OTUs,主要分布于酸微菌亚目和未知的放线菌类群。多样性指数和稀疏度曲线分析结果显示澄黄滨珊瑚联合放线菌物种多样性比丛生盔型珊瑚更高。【结论】澄黄滨珊瑚和丛生盔型珊瑚拥有较高水平的放线菌物种多样性和复杂的群落结构,并隐藏着大量的高等级放线菌新分类单元。
- 陈淇龙丽娟张偲董俊德李洁
- 关键词：造礁珊瑚放线菌群落结构
- 慢原甲藻研究进展被引量：2
- 2012年
- 慢原甲藻(Prorocentrum rhathymum)是一种有毒甲藻,有报道称其会形成赤潮,不但可能危害海洋生态平衡,还会通过海洋食物链的富集威胁人类健康。对慢原甲藻形态学、生态学、生理学、毒理学等方面的研究进展进行综述,指出开展我国南海慢原甲藻研究的必要性与重要意义,并对其发展方向进行了展望。
- 刘俏龙丽娟
- 关键词：形态学生态学生理学毒理学
- 友菌素核苷转移酶amiE基因的克隆、表达和功能鉴定
- 2012年
- 【目的】克隆和表达二糖核苷类抗生素友菌素生物合成基因簇中的核苷转移酶基因amiE,并研究AmiE的体外催化功能。【方法】采用PCR技术将编码257个氨基酸的葡萄糖-1-磷酸核苷转移酶基因amiE克隆到表达载体pET28a上,构建质粒pCSG4001,转化入大肠杆菌E.coli BL21(DE3)中诱导表达;利用亲和层析分离纯化蛋白AmiE,以葡萄糖-1-磷酸和胸腺嘧啶三磷酸(TTP)或尿嘧啶三磷酸(UTP)为底物,利用高效液相检测AmiE的体外酶活;以甘露糖-1-磷酸、半乳糖胺-1-磷酸和半乳糖-1-磷酸和TTP作为底物,进一步研究AmiE对底物的选择性。【结果】N-末端融合组氨酸标签的AmiE蛋白在大肠杆菌中获得了可溶性表达,通过亲和层析纯化出的AmiE能够以TTP(或UTP)和葡萄糖-1-磷酸作为底物,催化形成胸腺嘧啶二磷酸葡萄糖(TDP-glucose)或者尿嘧啶二磷酸葡萄糖(UDP-glucose),但对其他三种底物,无明显催化活性。【结论】大肠杆菌中表达纯化的核苷转移酶AmiE能够体外催化形成TDP-葡萄糖(或UDP-葡萄糖),确证了AmiE作为核苷转移酶的催化功能,同时表明AmiE对底物具有一定的选择性。
- 胡涛张光涛朱义广李苏梅张海波张改云杨晓红鞠建华张长生
- 关键词：生物合成
- 利玛原甲藻形态特征及生活史的研究被引量：3
- 2013年
- 利用光学显微镜和电子显微镜对利玛原甲藻(Procentrum lima)形态特征及生活史进行了观察。结果表明,其细胞呈卵圆形,长33～44μm,宽23～33μm,壳孔62～87个,边缘刺胞孔52～68个。同时,对其生活周期及生殖方式进行了追踪观察,不同的生活周期存在着不同的细胞形态。二分裂是利玛原甲藻主要的分裂方式,并首次发现利玛原甲藻疑似横分裂、出芽生殖的生殖方式。利玛原甲藻面对不良环境时会形成薄壁囊胞。
- 曾玲龙超林红军
- 关键词：生活史无性生殖有性生殖
- 1株红海榄根际纤维素降解真菌的分离鉴定及其酶学性质被引量：5
- 2012年
- 利用刚果红纤维素培养基,从海南三亚红海榄植物根际土壤中筛选得到1株纤维素降解真菌,将其命名为Z-2-4。形态学初步鉴定结果为曲霉属(Aspergillus),对其ITS、β-微管蛋白(β-tubulin)、钙调节蛋白(calmodulin)基因序列进行了扩增并测序。结果表明:该菌的ITS序列与其亲缘关系最近的Aspergillus insulico-la(EF661430.1)只有94%的相似性,β-微管蛋白序列与Aspergillus insulicola(FR775320.1)的相似性为89%,钙调节蛋白序列与Aspergillus insulicola(EF661396.1)的相似性为93%,推测该菌为Aspergillus属的1个新种。对该菌株进行了酶学性质的初步研究,结果显示该菌株所产纤维素酶的最佳反应温度为40℃,最佳反应pH值为6.0,产纤维素酶活力最高出现在发酵4天时,达到2.57 U/mL。
- 潘虎董俊德卢向阳田云张偲龙丽娟
- 关键词：红海榄纤维素降解ITS序列曲霉属
- 有毒甲藻细胞密度测定方法的比较研究被引量：3
- 2012年
- 采用显微镜计数法、荧光分光光度法、叶绿素a含量测定法、可见分光光度法对利玛原甲藻(Prorocentrum lima)指数生长期不同浓度的培养液进行细胞密度测定。结果表明,后3种细胞计数方法与显微镜计数法相比较,均有较好的线性关系;同时对不同生长期的利玛原甲藻培养液进行测定,结果表明,4种方法的生长曲线一致性良好。比较分析发现,可见分光光度法适用于不同细胞密度范围的测定,操作简单、耗时短、不需要破坏样品、适于批量操作,可确定为便捷、有效、可行的利玛原甲藻细胞计数法。
- 曾玲龙丽娟梁计林龙超
- 关键词：利玛原甲藻细胞计数法
- 环境因子对慢原甲藻(Prorocentrum rhathymum)生长的影响被引量：3
- 2013年
- 慢原甲藻是一种有毒甲藻,有报道称其能够形成赤潮,但国内外对其生长方面的研究几为空白。本文研究了温度、盐度、光照、起始密度、大量元素浓度、微量元素浓度以及维生素浓度等7种环境因子对慢原甲藻(Prorocentrum rhathymum)生长的影响。结果显示,慢原甲藻的适宜生长条件为温度20—30℃,盐度30‰—40‰,光照67.5—121.5μmol·m 2·s 1,大量元素、微量元素和维生素浓度分别为f培养基对应组分的1/2—2倍、1/8—1/2倍、1/2—4倍。起始密度小于8000个·mL 1时,最大细胞密度与起始密度正相关。
- 刘俏龙丽娟
- 关键词：环境因子
- 18株南海海洋真菌的初步鉴定及其发酵产物的细胞毒活性和抗菌活性筛选被引量：4
- 2013年
- 从南海海洋沉积物中分离得到18株真菌,经内转录间隔区(ITS)序列测定进行初步鉴定;采用3-(4,5-二甲基噻唑-2)-2,5-二苯基四氮唑溴盐(MTT)法对其发酵液及菌丝体的提取物进行体外细胞毒活性和抗菌活性筛选。结果显示,对人乳腺癌细胞株MCF-7增殖的抑制率在90%以上的菌株有5株;对金黄色葡萄球菌的抑制率在90%以上的有15株,占分离菌株总数的83.3%;对大肠杆菌和铜绿假单胞菌的抑制率在90%以上的各有2株,其中有1株对以上3种供试细菌都表现出较强的抑制活性,抑制率达90%以上。
- 张玲张庆波陈玉婵李浩华王磊章卫民
- 关键词：海洋真菌细胞毒抗菌
- 一株南海北部深海沉积环境真菌00457的鉴定及其活性研究被引量：3
- 2012年
- 从南海深海沉积环境样品中分离到一株编号为00457的真菌,基于形态学特征、ITS和5.8S rDNA序列比对分析,鉴定该菌株为白黄笋顶孢霉(Acrostalagmus luteoalbus)。活性研究表明,其代谢产物粗浸膏的卤虫致死活性明显,并具有一定强度的抑菌和DPPH自由基清除活性。此外,研究还发现代谢产物粗浸膏在25-100℃持续加热不超过30 min时,卤虫致死活性成分稳定,但在100℃持续加热超过60 min后卤虫致死活性成分显著减少,而一定强度的紫外光照射90 min内则无显著影响。
- 黄智王发左田新朋李洁张偲
- 关键词：抗菌活性
