河南省基础与前沿技术研究计划项目(092300410009) 作品数:14 被引量:68 H指数:6 相关作者: 周延清 张喻 张永华 陈娟娟 陈艳梅 更多>> 相关机构: 河南师范大学 驻马店市农业科学研究所 更多>> 发文基金: 河南省基础与前沿技术研究计划项目 河南省教育厅自然科学基金 河南省教育厅科学技术研究重点项目 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 医药卫生 更多>>
怀地黄新基因RgVP的克隆与序列特征分析 液泡质子泵焦磷酸水解酶(V-PPase)是植物生长和耐非生物胁迫过程中的关键酶。本研究基于5种已知植物ARGOS基因碱基序列的保守区,设计简并引物,采用RT-PCR和RACE技术获得一个495bp怀地黄cDNA序列。经过... 周延清 张永华 陈艳梅 张喻 李静云 陈娟娟关键词:怀地黄 RACE 文献传递 怀地黄3-酮酯酰CoA-硫解酶基因的克隆、序列特征和时空表达分析 被引量:16 2013年 目的对怀地黄3-酮酯酰CoA-硫解酶(Rehmannia glutinosa f.hueichingensis 3-ketoacyl CoA-thiolase,RghKAT)cDNA全长基因进行克隆及分析,为怀地黄分子育种提供候选基因和理论依据。方法根据其他植物ARGOS基因序列的保守结构域设计简并引物,采用RT-PCR和RACE技术,获得RghKAT cDNA全长序列;通过生物信息学技术对其核苷酸序列和氨基酸序列进行比对;利用实时荧光定量PCR技术检测了其在2个时期、10个组织的表达。结果 RghKAT基因全长1 713 bp,包含了1 395 bp的开放阅读框(ORF),编码464个氨基酸;同源比对和系统进化分析表明,RghKAT的核苷酸序列与葡萄、番茄、毛果杨、拟南芥和小麦的KAT核苷酸序列同源性分别达84%、82%、82%、79%、73%;RghKAT编码的氨基酸序列与矮牵牛、葡萄、黄瓜、拟南芥和小麦的KAT氨基酸同源性分别为88%、88%、86%、87%、78%;各物种KAT酶进化树符合物种进化规律;理化性质表明该蛋白为略成碱性的稳定蛋白质,蛋白质二级结构主要由α-螺旋、不规则卷曲、β-折叠和β-转角构成;在N端存在一个由70个氨基酸残基组成的信号肽;RghKAT蛋白三维结构具有硫解酶典型的特征序列;表达谱分析表明,RghKATmRNA在各时期、各组织中均有表达,盛花期花瓣中表达最强,而在幼苗期叶中表达量最低。结论成功克隆了RghKAT cDNA全长序列,具有KAT基因的结构特性及其产物硫解酶典型的特征序列,其在盛花期花瓣中表达量最高。 周延清 张永华 张喻 陈艳梅 白妍妍 魏海方 段红英 周春娥关键词:怀地黄 生物信息学分析 蛋白质二级结构 植物长链非编码RNA的研究进展 被引量:3 2014年 长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类长度大于200个核苷酸的非编码RNA,种类很多,能够在表观遗传水平、转录水平和转录后水平调控基因表达,广泛参与生物的生长发育、抗逆、生理和病理过程。相比动物和人类,lncRNA在植物中的研究相对较少,为深入了解植物长链非编码RNA的作用机制和拓宽应用范围提供理论依据,对lncRNA的研究方法、转录表达与调控方式及其在植物生殖发育和胁迫应答方面的作用进行了综述。 王婉珅 周延清 苑璐璐 李静云 陈娟娟关键词:长链非编码RNA 植物 胁迫应答 生殖发育 乳酸菌发酵山药果蔬饮料配方与工艺优化 被引量:13 2016年 以铁棍山药、葡萄、番茄、胡萝卜、苹果、蜂蜜为原料,优化出由50%山药浆、10%葡萄汁、20%番茄汁、10%胡萝卜汁和10%苹果汁组成的原浆,用植物乳杆菌CZ、植物乳杆菌CA、植物乳杆菌CB按照1∶1∶1比例制成的发酵剂,按照原浆78%、蜂蜜3%、蔗糖13%和发酵剂6%的比例配制混合,32℃发酵8h,获得功能型乳酸菌发酵山药果蔬饮料.其蛋白质、脂肪、还原性糖、钠和维生素C的质量浓度及pH值依次为0.004kg·L^(-1)、0.0121kg·L^(-1)、0.080kg·L^(-1)、0.000 182kg·L^(-1)、0.000 102kg·L^(-1)和4.0±0.2. 陈娟娟 周延清 王向楠关键词:山药 乳酸菌 发酵 果蔬饮料 基因特异性分子标记在植物育种中的研究进展 被引量:6 2018年 基因特异性分子标记是基于基因序列中功能性单核苷酸多态性(SNP)或插入和缺失(InDels)位点开发而成,具有选择效率高、共显性、与目标基因共分离、不受遗传背景影响等优点,且与生物表型性状高度相关,在生物表型性状的鉴定中更突显出其准确性和直接性,可以准确地跟踪、定位不同遗传背景下的目标等位基因,是农作物分子标记辅助选择育种中理想的分子标记类型。对基因特异性分子标记的原理、开发及在植物育种的应用进行论述,并探讨了基因特异性分子标记的发展趋势,以期为分子标记辅助育种提供参考依据。 张丹丹 周延清 杨珂关键词:SNP INDEL PCR检测 分子标记辅助育种 DNA分子标记技术在四大怀药研究中的应用概况 被引量:3 2012年 DNA分子标记技术是比形态标记、细胞标记和生化标记理想的遗传标记技术,已经广泛应用于动植物和微生物的诸多研究中。但是它在四大怀药中的应用相对较少。因此,对几种DNA分子标记技术在四大怀药的遗传多样性、指纹图谱、居群遗传结构、品种鉴定和真伪品鉴别等方面的研究成果和新进展进行了综述,以期为四大怀药的深入研究提供参考。 周延清 周鹏 郭静佩 张永华 陈艳梅 张喻 杨德勇 许春关键词:DNA分子标记 指纹图谱 高效热不对称交互式PCR技术克隆地黄基因 被引量:3 2015年 利用高效热不对称交互式PCR(hiTAIL-PCR)技术从地黄基因组中扩增出3个DNA片段,经过电泳检测、回收、纯化和测序获得2个片段的碱基序列.其中一个由578个bp组成,包含一个453bp的开放阅读框(ORF),编码151个氨基酸,与一些已知纤维素合酶基因在DNA水平和氨基酸水平的同源性分别高达81%~91%和83%~99%,而且推测蛋白质具有纤维素合酶的结构域;另一个由385个bp组成,没有ORF,不编码蛋白质,但是,预测其包含启动子元件.这些结果表明使用hiTAIL-PCR技术可以克隆地黄基因,克隆的基因将为地黄基因分子作用机制和分子育种研究奠定基础. 周延清 王婉珅 张喻 李静云 陈娟娟 苑璐璐 魏俊关键词:地黄 基因克隆 启动子 CAPS标记技术及其应用进展 被引量:15 2011年 酶切扩增多态性序列(CAPS)标记技术是一种简单、经济、可靠和共显性的技术,适用于生物研究的许多方面。本文综述了该标记技术的原理、过程、特点和在植物、动物和微生物的基因分型、分子标记辅助选择育种、品种鉴定、分子标记的开发、基因鉴定、基因定位、遗传图谱构建、基因分离、体细胞杂合植株的遗传鉴定与分析诸方面应用的新进展,并展望了其应用前景。 邢延豪 周延清 楚素霞 郭静佩 周鹏 范念斯关键词:CAPS DNA分子标记 基因 怀地黄基因片段及其中转座酶基因的克隆与序列分析 被引量:6 2012年 根据已知裂叶牵牛花PNZIP启动子碱基序列的相关信息设计引物,采用PCR方法,从怀地黄基因组中扩增出5个基因片段,回收和克隆出其中一个1 096bp的基因片段。经过NCBI对比分析,发现它是一个类似转座子的相关蛋白基因序列,含有一个完整的开放阅读框,大小为450bp,编码由150个氨基酸组成的转座酶。然后,基于该开放阅读框的碱基序列,设计另一对引物,用PCR方法,从中扩增出该完整开放阅读框的序列片段。 周延清 姚换灵 段红英 周春娥 张永华 陈艳梅 张喻关键词:怀地黄 基因克隆 开放阅读框 地黄纤维素合酶基因的克隆与生物信息学分析 被引量:5 2015年 根据以前克隆的地黄Rgh BNG基因碱基序列,利用Primer Premier 5.0设计特异引物,采用hi TAIL-PCR技术从怀地黄基因组DNA中扩增出578 bp DNA片段。经生物信息学分析发现,它与根癌土壤杆菌、土壤杆菌的纤维素合酶基因的同源性达81%-91%;它所含的453 bp的开放阅读框(ORF)编码蛋白质的氨基酸序列与根癌土壤杆菌、土壤杆菌、菜豆根瘤菌、豌豆根瘤菌纤维素合酶基因编码蛋白质氨基酸序列的同源性高达83%-99%,说明蛋白质可能具有纤维素合酶的结构域。用hi TAIL-PCR技术克隆怀地黄纤维素合酶基因,为进一步研究其分子作用机制和在地黄分子育种中的应用奠定了基础。 周延清 张喻 李静云 陈娟娟 王婉珅 苑璐璐 魏俊关键词:怀地黄 纤维素合酶 HI 生物信息学分析