国家自然科学基金(20573011)
- 作品数：2 被引量：7H指数：2
- 相关作者：于建国彭亮丁万见刘若庄冯丰更多>>
- 相关机构：北京师范大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：理学更多>>
- DNA和RNA双链稳定性差异的理论研究被引量：3
- 2009年
- 利用适用于分子间弱相互作用,尤其是生物分子间的氢键相互作用的改进的半经验方法RM1BH和达到线性标度的新的半经验算法以及SimuCal_SE方法,与自主开发的量子化学程序包SimuPac1.0,对4组一系列DNA和RNA碱基的氢键结合能进行了计算.这些计算包括单一碱基类型和混合碱基类型两大类情形,最大的原子数达到1064个.计算结果表明,在碱基层数较少时,DNA和RNA氢键结合能差别不大;在碱基层数较多时,RNA的氢键结合能明显高于DNA的氢键结合能;嘌呤和嘧啶的排列方式对结合能略有影响,但不影响上述趋势.可见,氢键对于RNA的稳定性差异起到重要的作用,计算结果支持了实验的结论.
- 冯丰于建国方维海
- 硫代乙酰胺光化学反应机理的理论研究被引量：4
- 2008年
- 用B3LYP,MP2和CASSCF方法,采用cc-pVDZ和6-31++G**基组,研究了硫代乙酰胺在基态和最低三态上消除硫化氢以及其它光解离反应,并考虑了单个溶剂分子参与反应对质子迁移反应的影响,得到了消除硫化氢反应的反应机理,计算结果可以很好地解释实验结果.进而用CASSCF方法计算了第一激发单态上的各驻点,以及各交叉点.计算结果表明,在S1和T1态上发生除分子内转动以外的化学反应的可能性比较小,当分子被激发到S2态上时,将通过S2/S1交叉点到S1态,在S1态上的分子有两条途径去活化,通过S1/S0交叉点到热基态,通过S1/T1交叉点系间窜越到T1态.因而得出CH3CSNH2发生光解离反应的可能性不大.基于此,可将硫代酰胺结构引入蛋白或多肽中,有望在不破坏分子整体结构的情况下对其进行光化学研究.
- 彭亮丁万见于建国刘若庄
- 关键词：硫代乙酰胺密度泛函理论溶剂效应
