国家自然科学基金(30900980)
- 作品数：4 被引量：95H指数：4
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- 相关机构：广东省农业科学院华南农业大学华南师范大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家现代农业产业技术体系建设项目广东省自然科学基金更多>>
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- 利用SNP和EST-SSR分子标记鉴定荔枝新种质御金球被引量：22
- 2013年
- 本研究利用自主开发的荔枝SNP和EST—SSR两种分子标记技术，对近年发掘的荔枝优稀种质御金球进行分子鉴定，明确其与现有的363份荔枝种质的亲缘关系，以探索其是否为新种质，并揭示亲本来源，为进行新品种保护提供分子证据。结果表明，13对EST—SSR引物在364份种质中共产生122条谱带，其中多态性条带112条（91．8％）；筛选出的17对SNP引物均表现为二等位性。御金球与363份荔枝种质的演化分化系数介于0．043～1．924之间，遗传相似性系数介于0．123—0．877之间。可见，御金球与现有的363份荔枝种质在分子水平上存在差异，证实御金球为一份全新荔枝种质。通过对该种质与22份疑似亲本进行EST—SSR和SNP分析，并结合表型资料及品种起源信息，初步认为御金球是杂交后代，且母本为糯米糍，父本为焦核怀枝的可能性最大。SNP分型技术首次成功地用于荔枝新种质御金球的亲本来源鉴定，为今后荔枝种质的鉴别提供了可借鉴手段。
- 孙清明李永忠向旭陈道明杨晓燕方静吴绪波周东辉马帅鹏马文朝
- 关键词：荔枝新种质SNP
- 荔枝品种选育进展被引量：12
- 2010年
- 荔枝是原产中国的重要的亚热带果树,在解决农民就业和实现农民增收方面发挥着重要作用。但近年荔枝产业出现停滞不前的局面,新品种的选育是荔枝产业持续发展的必要保障。通过分析荔枝产业发展中存在的若干问题,提出应以培育不同熟期、优质、抗生物、非生物胁迫及耐贮运、适加工等特性的荔枝新品种为现阶段荔枝育种目标;总结了近50年来传统育种技术在荔枝新品种选育上所取得的成就,并指出生物技术与传统育种手段相结合也逐渐受到重视并在育种中开始应用;对今后荔枝育种工作提出建议。
- 孙清明欧良喜向旭陈洁珍邱艳萍李志强蔡长河
- 关键词：荔枝选育种
- 荔枝两个F1杂交群体的EST-SSR鉴定及多样性分析被引量：12
- 2014年
- 为了更好地在荔枝杂交育种中判别真杂种,以荔枝两个人工杂交群体‘雪怀子’ב桂味’和‘雪怀子’ב焦核三月红’的F1代为材料,利用EST-SSR标记进行真假杂种鉴定,创建作图群体,并对两个群体进行遗传多样性分析。结果表明,分别采用4对引物组合即可实现对两个杂交群体F1代单株100%的鉴定,两个群体的159个单株均为真杂种;且两个群体后代叶片形态存在变异,基因型上产生了不同于亲本的扩增谱带。经聚类分析发现,群体‘雪怀子’ב桂味’113个F1单株被聚为6大类(相似性系数0.68),63.72%(72株)后代与父本聚为一类,28.3%(32株)单株与双亲距离较远,推测这些单株中出现了较大的遗传重组或变异。在相似系数0.642处,‘雪怀子’ב焦核三月红’组合的46株杂种后代分为两大类,该组合大部分单株(60.87%)与母本亲缘关系较近,具有偏母本遗传倾向。可见,EST-SSR标记适合荔枝真假杂种鉴定,两个F1作图群体的创建为荔枝遗传连锁图谱构建奠定基础,同时为荔枝的品种改良积累材料。
- 孙清明马帅鹏马文朝赵俊生方静杨晓燕向旭
- 关键词：荔枝
- 荔枝EST资源的SSR信息分析及EST-SSR标记开发被引量：55
- 2011年
- 【目的】明确荔枝EST序列中SSR的总体特点,开发荔枝EST-SSR引物,为利用EST-SSR分子标记进行荔枝种质资源遗传多样性、连锁图谱构建及亲缘关系研究奠定基础。【方法】应用SSRIT软件,按照设定标准从自行构建的一个荔枝果皮发育关键期的cDNA文库中的1 331条Unigene(惟一序列)中搜索SSR位点。利用软件Primer primer5.0设计EST-SSR引物。选用16份表型差异较大的荔枝种质资源检测引物的有效性及多态性,利用聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)进行片段分离。【结果】荔枝的1 331条EST序列中共搜索出220个SSR位点,分布于189条EST中,出现频率是16.53%。这些EST-SSR的平均长度为18.43 bp,平均分布频率1/4.42 kb。在1—6 bp的重复基元中,二核苷酸和三核苷酸重复类型占主导地位,共占总SSR的69.09%,二者出现的频率分别为37.27%和31.82%。共观察到72种重复基元,出现频率最高的是GA/TC(16.82%);其次是AG/CT、A/T、AT/TA及GAA/TTC,频率分别为14.55%、11.82%、5.00%和3.64%。不同核苷酸数目的重复基元的重复次数差异很大。设计、合成150对EST-SSR引物,122对(81.33%)引物在荔枝中获得有效扩增,100对引物具有多态性。【结论】荔枝EST资源中含有高频率的SSR位点,且EST-SSR标记开发效率较高。本研究为利用EST-SSR标记开展荔枝遗传研究提供了100对EST-SSR引物,并为进一步开发荔枝EST-SSR标记提供了含SSR位点的候选序列。
- 孙清明马文朝马帅鹏赵俊生白丽军陈洁珍蔡长河向旭欧良喜
- 关键词：荔枝ESTSSR
