河北省卫生厅资助项目(20090579)
- 作品数:3 被引量:4H指数:1
- 相关作者:刘镭黄亮程露阳赵恩宏肖丽君更多>>
- 相关机构:承德医学院吉林市龙潭区妇幼保健院承德医学院附属医院更多>>
- 发文基金:河北省卫生厅资助项目河北省人口和计划生育委员会计划生育科研项目更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 乳腺癌高表达基因CKAP2L的生物信息学分析被引量:1
- 2013年
- 乳腺癌是严重威胁妇女健康的恶性肿瘤,筛查肿瘤生物标记物对早期诊断具有重要意义。本研究通过肿瘤基因组解剖计划(CGAP)SAGE数据库,筛选新的乳腺癌高表达基因,并对其中一条功能未知的新基因CKAP2L进行了初步的生物学分析,为进一步深入研究该基因的生物学功能及其参与乳腺癌发生、发展的分子机制奠定基础。
- 许亚娜许倩刘镭
- 关键词:乳腺癌生物信息学
- 乳腺癌高表达基因FAM83A的生物信息学分析被引量:3
- 2013年
- 目的筛选乳腺癌高表达基因,用生物信息学方法预测FAM83A生物学功能。方法使用肿瘤基因组解剖计划数据库的数字基因表达演示工具,在乳腺癌组织和乳腺良性肿瘤组织中筛选差异表达的基因。生物信息学方法预测FAM83A基因及其编码蛋白的序列同源性、理化性质、亚细胞定位、结构和表达谱。RT-PCR方法测定FAM83A在乳腺癌、乳腺纤维瘤和正常乳腺组织中的表达。结果筛选出差异表达基因FAM83A。发现其有3个不同的剪接体,基因进化保守,亚细胞定位于线粒体的可能性大。预测有PK,PKA等磷酸化位点,MAPK作用识别位点,SH2、SH3,RPEL和WH2结合基序。二级结构主要是α螺旋和无规则卷曲。RT-PCR证实FAM83A在乳腺癌组织中高表达,而在乳腺良性肿瘤和正常乳腺组织中均无表达。结论 FAM83A是一个乳腺癌高表达基因,可能作为乳腺癌分子机制研究的靶点。
- 刘镭黄亮车清海赵恩宏黄旭程露阳肖丽君
- 关键词:乳腺肿瘤生物信息学
- 一种快速检测乳腺癌患者外周血高表达基因FAM83A的巢式PCR法
- 2013年
- 目的建立一种快速简便检测乳腺癌患者外周血中FAM83A基因的巢式PCR法。方法设计退火温度分别为72℃和60℃的内、外侧两对引物,在一个PCR反应中,同时加入0.2μmol/L外侧引物和20μmol/L内侧引物,使两轮PCR扩增反应一步完成。分别用建立的巢式PCR法与传统巢式PCR法检测35例乳腺癌患者和8例健康人外周血样本,比较其特异性;将乳腺癌细胞株MCF-7系列稀释后分析两法的灵敏度。结果建立的巢式PCR法与传统巢式PCR法在43例标本中均检出16例阳性,并都能检测出10-6稀释的MCF-7细胞,两法特异性和灵敏度相同。本法步骤简便,所需时间缩短了24 min。结论建立的巢式PCR法敏感、特异,且快速、简便,适用于临床快速检测。
- 刘镭黄亮车清海黄旭程露阳赵恩宏肖丽君
- 关键词:乳腺癌巢式聚合酶链反应