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国家自然科学基金(30470261): 作品数：19 被引量：60H指数：5; 相关作者：侯万儒侯怡铃张田胡锦矗郝彦哲更多>>; 相关机构：西华师范大学广东省湛江教育学院中国科学院更多>>; 发文基金：国家自然科学基金四川省教育厅科学研究项目四川省应用基础研究计划项目更多>>; 相关领域：生物学农业科学更多>>

大熊猫核糖体蛋白L10亚基基因的cDNA克隆及序列分析被引量：1: 2010年; 目的了解大熊猫(ailuropoda melanoleuca)核糖体蛋白L10亚基基因(RPL10)的结构特点及其与已报道的人和其他哺乳动物核糖体蛋白亚基RPL10基因的异同。方法根据已报道的部分哺乳动物RPL10基因的相关信息设计引物,运用RT-PCR技术,从大熊猫的肌肉组织总RNA中对核糖体蛋白亚基RPL10基因的进行克隆、测序;采用Genescan软件,对所克隆的基因序列进行氨基酸序列推定;采用ORF finder软件进行DNA序列的开放阅读框查找;采用DNAMANVersion 6软件,对基因序列和氨基酸序列进行同源性比较;采用Ex2PASy Proteomics Server软件,进行蛋白质功能位点和生化特性预测分析;采用http://www.imtech.res.in/raghava/apssp2/对蛋白质二级结构进行模拟分析。结果大熊猫RPL10基因的表达序列长为685 bp,开放阅读框(ORF)为645 bp,编码214个氨基酸的蛋白质,该蛋白的相对分子质量为24.599 7×103,等电点为10.74,含有4个功能位点,分别为:2个蛋白激酶C磷酸化位点,2个N化位点,2个酰胺化位点,1个核糖体蛋白L10e信号位点。进一步分析发现,该基因的表达序列及其编码的氨基酸序列与已报道的人、牛、家犬、褐家鼠、小家鼠有很高的相似性,其表达序列同源性分别为92.4%、92.4%、97.21%、88.84%与89.61%;其编码的氨基酸序列除与牛的同源性为99.07%外,与其他哺乳动物同源性为100%。而且,其蛋白质的高级结构除牛外其他物种也具有一致性。结论无论是从RPL10基因的序列、结构、功能位点,还是从其编码的氨基酸的序列和二级结构进行分析,都表明大熊猫的RPL10基因和已报道的哺乳动物的RPL10基因具有高度的遗传稳定性和功能一致性。; 苏秀兰侯怡铃李俊孙冰吴光富宋嫣张田侯万儒; 关键词：大熊猫 RT-PCR 克隆

大熊猫核糖体蛋白S26亚基基因(rps26)的cDNA克隆及序列分析被引量：3: 2010年; 为了解大熊猫核糖体蛋白亚基rps26基因的结构特点及其与已报道的人和其他哺乳动物核糖体蛋白亚基基因rps26的异同,以大熊猫的肌肉组织为材料,根据已报道的部分哺乳动物核糖体蛋白S26亚基基因(rps26)的相关信息设计引物,运用RT-PCR技术,成功地克隆了核糖体蛋白亚基基因rps26的表达序列,并对其进行了测序及初步分析.结果表明:大熊猫rps26亚基基因的表达序列长为413 bp,开放阅读框(ORF)为348 bp,编码115个氨基酸的蛋白质,该蛋白的相对分子质量为13.025 2×103,等电点为11.61.拓扑预测显示该蛋白含有3个功能位点:1个N-糖基化位点,1个酪蛋白激酶Ⅱ蛄姿峄?位点和1个核糖体蛋白S26e signature位点.进一步分析发现,大熊猫rps26基因与已报道的人、西藏黄牛、野猪、褐家鼠和小家鼠5个哺乳动物物种的表达序列其编码的氨基酸序列具有很高的相似性:编码序列同源性分别为90.23%、91.67%、92.82%、87.36%和86.78%;氨基酸序列同源性均为99.86%.; 侯怡铃孙冰侯万儒; 关键词：大熊猫 RT-PCR

大熊猫Sjogren综合症/硬皮病自身抗原1基因(SSSCA1)的克隆及比较: 2010年; Scleroderma is a connective tissue disease characterized by the fibrosisization of skin and internal organs.In this study,the genomic sequence and cDNA of Sjogren’s syndrome/scleroderma autoantigen 1(SSSCA1)gene of the giant panda was cloned successfully using RT-PCR.The cDNA fragment cloned was 642 bp in length,and contained an open reading frame (ORF) of 600 bp encoding 199 amino acids.The genomic sequence was 1 262 bp,containing four exons and three introns. The deduced amino acid sequence showed that this protein was composed of 199 amino acids and its estimated molecular weight was 21.53841 kDa with a pI of 5.14. Three different patterns of functional sites were found:one protein kinase C phosphorylation site,five casein kinase Ⅱ phosphorylation sites,and three N-myristoylation sites. The SSSCA1 gene of the giant panda were highly homologous to those of some other mammals.; 侯怡铃张田侯万儒; 关键词：大熊猫 RT-PCR 克隆

南充高坪区嘉陵江畔鼠型小兽多样性调查被引量：5: 2008年; 2007年3月至10月,对南充高坪区嘉陵江畔农田及荒地生境的小型兽类多样性进行调查.投放有效铗日2760,捕获小型兽类318只,有褐家鼠(Rattus norvegicus)、社鼠(Niviventer confucianus)、黄胸鼠(Rattus tanezumi)、黑线姬鼠(Apodemus agrarius)、大足鼠(Rattus nitidus)、小家鼠(Mus musculus)、灰麝鼩(Crodura attenuata)、四川短尾鼩(Anourosorexsquamipes)等8种鼠型小兽,分属啮齿目(Rodentia)鼠形亚目(Myomorpha)的鼠科(Muridae)和鼩形目(Soricomorpha)的鼩鼱科(Soricidae)四川短尾鼩和黑线姬鼠为优势种,其种群性比通过X2检验,与1∶1无显著差异.测得多样性Shannon-wiener指数H=1.606,Margalef丰富度指数R=1.215,均匀性指数J=0.535,生态优势度指数D=0.394.; 刘清君胡锦矗吴攀文; 关键词：优势种丰富度指数

大中型兽类踪迹在野外考察及研究中的应用被引量：2: 2006年; 在野外兽类考察过程中,由于多数兽类喜欢晨昏活动或昼伏夜出,加上一些外界因素的影响,工作人员要对兽类进行直接的目的性观察和持续性研究有一定的难度.但由于动物的某些生物学特性,不同兽类的活动会在野外留下特定的踪迹,这为野外鉴别、观察和研究提供了重要的线索.本文总结了影响对大中型兽类进行直接性观察的因素、野外兽类踪迹的表现形式以及兽类的野外遗留物在有关研究中的应用,以期为野外考察与研究提供一定帮助.; 胡锦矗吴攀文; 关键词：兽类踪迹野外考察

亚洲黑熊四川亚种(Ursus thibetanus mupinensis)线粒体ATP合酶和亚基基因克隆及序列分析被引量：6: 2008年; 根据已报道的部分哺乳动物线粒体ATP合酶F0亚基的相关信息设计引物,运用PCR技术,首次从亚洲黑熊四川亚种(Ursus thibetanus mupinensis)的肌肉组织总DNA中成功克隆了线粒体ATP合酶F0亚基8(ATP8)和亚基6(ATP6)的序列,并对其进行了初步分析。结果表明:PCR扩增产物的总长度为942 bp,其中842 bp为四川黑熊ATP8和ATP6基因的编码区。ATP8和ATP6基因存在一段长43 bp的重叠区域。ATP8基因长204 bp,编码67个氨基酸残基的蛋白质,其蛋白分子质量为7.9 KD,等电点为10.35;ATP6基因长682 bp,编码226个氨基酸残基的蛋白质,其蛋白分子质量为24.8 KD,等电点为10.63。四川黑熊线粒体ATP合酶F0亚基8和亚基6与其他已报道的部分哺乳动物具有很高的同源性。以基因序列为数据构建的进化树表明四川黑熊和美洲黑熊的亲缘关系最近。本研究为在分子水平上探究黑熊线粒体基因组的遗传特点,探究物种进化关系和物种多样性提供了科学参考。; 郝彦哲杜玉杰吴夏张田侯万儒; 关键词：线粒体 ATP合酶亚基基因克隆

大熊猫核糖体蛋白L30亚基基因(RPL30)的cDNA克隆及序列分析被引量：1: 2010年; RPL30是核糖体大亚基60S的组成部分,由RPL30基因所编码,主要存在于真核生物中.根据已报道的部分哺乳动物核糖体蛋白L30亚基基因(RPL30)的相关信息设计引物,运用RT-PCR技术,以大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)的肌肉组织为材料,成功地克隆了核糖体蛋白L30亚基RPL30基因,并对其进行了测序及初步分析.结果表明:大熊猫L30亚基基因的表达序列长为388bp,开放阅读框(ORF)为348 bp,编码115个氨基酸的蛋白质,并含有6个功能位点.进一步分析发现,该基因的表达序列及其编码的氨基酸序列与已报道的人、牛、褐家鼠、小家鼠有很高的相似性,其表达序列同源性分别为93.97%,96.26%,89.66%和89.94%,其编码的氨基酸序列同源性分别为99.13%,98.26%,99.13%,99.13%,且其蛋白质的高级结构相似性也很高.; 侯怡铃侯万儒; 关键词：大熊猫 RT-PCR

大熊猫核糖体蛋白S11亚基基因(RPS11)cDNA的克隆及序列分析被引量：2: 2010年; RPS11是核糖体小亚基40S的组成部分,由RPS11基因所编码,属于核糖体蛋白S17p家族,主要存在于真核生物中。为了解大熊猫核糖体蛋白亚基RPS11基因的结构特点及其与已报道的人和其他哺乳动物核糖体蛋白亚基RPS11基因的异同,本研究根据已报道的部分哺乳动物核糖体蛋白S11亚基基因(RPS11)的相关信息设计引物,运用RT-PCR技术从大熊猫的肌肉组织总RNA中成功克隆了核糖体蛋白亚基RPS11基因,并进行了测序和序列分析。结果表明:大熊猫RPS11亚基基因的开放阅读框(ORF)长为477bp,编码158个氨基酸的蛋白质,该蛋白的相对分子量为18.4275kDa,pI为10.96。拓扑预测显示该蛋白含有14个功能位点:即2个N-糖基化位点,6个蛋白激酶C磷酸化位点,4个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,1个酪氨酸激酶磷酸化位点和1个核糖体蛋白S17 signature位点。进一步分析发现,大熊猫RPS11基因与已报道的部分哺乳动物的表达序列及其编码的氨基酸序列都具有很高的相似性。本研究结果为丰富和完善哺乳动物RPS11基因资源库提供了基础资料。; 孙冰侯怡铃李俊苏秀兰吴光富宋嫣张田侯万儒; 关键词：大熊猫

大熊猫RPS15 cDNA的克隆及序列分析被引量：10: 2008年; 本研究运用RT-PCR技术,首次从大熊猫Ailuropoda melanoleuca的肌肉组织总RNA中成功克隆了核糖体蛋白S15(RPS15)基因的表达序列,并对其进行了初步分析。结果表明:大熊猫RPS15基因的表达序列全长为442bp,开放阅读框(ORF)为438bp,编码145个氨基酸,该蛋白的分子量为17.0401KDa,等电点为10.3,含有2个依赖于cAMP和cGMP的蛋白激酶磷酸化位点,5个蛋白激酶C磷酸化位点,4个N-酰基化位点及1个RPS19蛋白signature位点。进一步分析发现,大熊猫RPS15基因的表达序列及其编码的氨基酸序列与已报道的部分哺乳动物具有很高的相似性。; 罗晓燕胡锦矗侯万儒; 关键词：大熊猫 RT-PCR

大熊猫核糖体蛋白S15A亚基基因(rps15A)的克隆及序列分析: 2011年; 根据已报道的部分物种的核糖体蛋白S15A亚基基因(rps15A)的相关信息设计引物,运用RT-PCR和Touchdown-PCR技术,分别克隆了大熊猫核糖体蛋白S15A亚基的cDNA和结构基因序列,并进行测序及分析.结果表明:大熊猫核糖体蛋白S15A亚基基因的表达序列全长为460 bp,开放阅读框(ORF)为393 bp,编码130个氨基酸,结构基因序列全长为6091 bp,含有4个外显子和3个内含子.RPS15A蛋白的相对分子质量为14.84 kD,pI为10.62.拓扑预测显示含有5个类型的功能位点,即:1个依赖cAMP和cGMP的蛋白激酶磷酸化位点,2个蛋白激酶C磷酸化位点,1个乙酰化位点,1个N-糖基化位点及1个核糖体蛋白S8 signature位点.进一步对RPS15A蛋白的结构分析及其与部分脊椎动物和果蝇RPS15A蛋白的同源性分析,发现该基因的表达序列及其编码的氨基酸序列具有很高的相似性,这表明真核生物核糖体蛋白亚基S15A在进化中具有较高的保守性.; 李俊丁祥侯怡铃孙冰苏秀兰吴光富宋嫣侯万儒; 关键词：大熊猫克隆

国家自然科学基金(30470261)

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