国家教育部博士点基金(20091106120011)
- 作品数：3 被引量：47H指数：3
- 相关作者：刘美子姚辉刘萍罗焜宋经元更多>>
- 相关机构：中国医学科学院北京协和医学院中国人民解放军总医院天津中医药大学更多>>
- 发文基金：国家教育部博士点基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 党参及其易混伪品的ITS2分子鉴定被引量：14
- 2011年
- 目的:对中药党参及其易混伪品进行ITS2条形码鉴定,探讨ITS2条形码序列对党参及其伪品鉴定的可行性。方法:对党参样品进行DNA提取、PCR扩增和双向测序,用CodonCode A-ligner3.7.1进行序列拼接,MEGA4.1计算党参基原植物及其易混伪品的种间、种内的K2P距离,并采用P距离法建立N-J树,利用Koetschan等建立的ITS2数据库预测ITS2二级结构。结果:党参基原植物种内平均K2P距离均值为0.0339,与易混伪品的种间平均K2P距离为0.2688,党参的3个基原聚在一起,与易混伪品明显区分。党参与其易混伪品的ITS2二级结构Helix I和III区存在明显差异。结论:ITS2条形码序列能够鉴定党参及其易混伪品,为党参及其混伪品的鉴定提供了新思路。
- 刘美子刘萍李美妮姚辉
- 关键词：党参ITS2DNA条形码
- 应用ITS2序列鉴定垂盆草及其混伪品被引量：4
- 2011年
- 目的:通过对药食同源植物垂盆草及其混伪品进行分子鉴定,以保证该植物的临床药效及食用安全。方法:通过对样品DNA进行PCR扩增,获得ITS2基因片段,纯化后的PCR产物进行双向测序,运用CodonCode Aligner进行序列的拼接、MEGA5.0软件进行序列分析并构建K2P模型的NJ树。结果:垂盆草与其混淆品ITS2序列间存在明显变异,种内遗传距离小于种间遗传距离,从NJ树中可以明显看出不同来源垂盆草聚为一支,与混伪品可以很好地区分。结论:ITS2序列可有效地鉴别药用植物垂盆草及其混淆品,对中药鉴定具有潜在的应用价值。
- 刘美子罗焜姚辉刘萍
- 关键词：垂盆草ITS2混淆品分子鉴定景天科
- DNA条形码序列对9种蒿属药用植物的鉴定被引量：29
- 2012年
- 目的采用DNA条形码序列对9种常见的蒿属药用植物进行鉴定,为常见蒿属药用植物的鉴定提供分子依据。方法对9种常见蒿属药用植物的4条候选DNA条形码序列(ITS2、rbcL、matK、psbA-trnH)进行PCR扩增和测序,比较各序列的扩增和测序效率,应用BLAST1、Distance方法来评估各序列的鉴定效率。此外,基于MEGA5分析9种常见蒿属药用植物ITS2序列种间K2P遗传距离并构建NJ树。结果除matK外,其余3条片段的PCR扩增和测序效率均为100%,ITS2序列对9种蒿属药用植物的物种水平鉴定成功率最高,为100%,而psbA-trnH、rbcL、matK、matK+rbcL的鉴定成功率(BLAST1法)分别为83.3%、66.7%、54.5%、75%。通过ITS2序列的种间K2P遗传距离及NJ树均能将不同物种全部区分。结论 ITS2序列可以作为鉴定蒿属药用植物的潜在条形码。
- 刘美子宋经元罗焜林余霖刘萍姚辉
- 关键词：ITS2PCR扩增
