国家科技基础条件平台建设计划(505010)
- 作品数：7 被引量：14H指数：3
- 相关作者：骆清铭刘谦李亦学张国庆曹顺良更多>>
- 相关机构：华中科技大学上海生物信息技术研究中心东南大学更多>>
- 发文基金：国家科技基础条件平台建设计划国家高技术研究发展计划国家科技攻关计划更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术生物学医药卫生更多>>
- 大鼠骨骼系统的三维重建模型被引量：3
- 2007年
- 建立了大鼠骨骼系统的三维可视化模型。首先将大鼠连续断层解剖图像进行图像配准,然后分割、描绘出大鼠骨骼系统中所有的骨骼,最终利用Visual C++和可视化工具包(Visualization Toolkit,VTK)实现并行面绘制计算,建立大鼠骨骼系统的三维可视化模型。重建后的可视化模型结构明显、清楚,可以真实地在计算机中重现出大鼠的骨骼系统三维模型。
- 白雪岭李安安张杰余雳廖银萍龚辉刘谦
- 关键词：图像分割三维重建
- 基于Web的代谢网络仿真环境
- 2006年
- 针对实时服务的需求和大规模代谢网络的大计算量,构建了一个基于集群系统的多层体系结构的代谢网络仿真环境,主要采用Applet技术、系统生物学描述语言(SBML)、Servlet与Applet之间的通信技术、线程池技术和负载平衡机制来实现。基于这个仿真环境,结合已有的代谢网络仿真技术,提供了一个远程在线的代谢网络的仿真服务。该仿真环境不仅便于升级和维护,而且具有平台无关性、强大的计算性能和对重负荷的支持能力。
- 张升蓉罗若愚刘谦李亦学骆清铭
- 关键词：APPLETSERVLET线程池负载平衡机制
- 基于Web挖掘构建精神与行为相关基因数据库
- 2008年
- 建立自动化数据采集系统,通过自动搜索web信息及文本挖掘快速采集精神与行为相关基因信息,构建了精神与行为相关基因web数据库。采集系统和web数据库均具有可扩展性和可移植性,为其他领域相关基因数据库的构建提供了一种通用、高效的方法。
- 周远陈亮陶怡孙啸
- 关键词：基因数据库文本挖掘共词分析
- 基于集群的代谢网络计算平台研究
- 2008年
- 在生物代谢网络研究中,为提供面向多用户的高性能计算服务,开发了基于Linux计算机集群的代谢网络模拟W eb计算平台。该平台以集群为密集计算后台,以重建心肌细胞能量代谢网络为算例,采用集中式任务调度模型、加权结合轮询法的负载平衡技术以及消息传递接口并行编程模型,实现了对多用户并发任务的处理。通过实例应用和调度监控,验证了该平台在代谢网络模拟中的可用性,以及集群服务器并行处理多任务的有效性。
- 贾璐罗若愚刘谦李亦学骆清铭
- 关键词：LINUX集群并行计算负载平衡消息传递接口
- 上海生命科学数据中心的设计与实现被引量：4
- 2008年
- 上海生命科学数据中心通过整合实验数据、分析工具、相关文献,为研究人员提供一个具有中国特色、地方特点,以知识为导向、技术前瞻的生命科学数据共享、服务支撑平台。平台针对生命科学数据自身的特点,运用最新技术手段,在海量数据的管理、异构数据的整合、分布式数据访问,以及数据安全性管理方面进行了积极、有益的探索。目前,平台一期工作已经完成,并开始对外提供服务(http://lifecenter.sgst.cn/)。
- 许庆炜曹顺良李荣张国庆骆清铭李亦学
- 关键词：生命科学数据整合ORACLE数据库分布式管理
- 基于构件的生命科学主题数据库构建方法被引量：4
- 2007年
- 提出了一种生命科学主题数据库的快速构建方法。使用管理表和数据表共同管理生命科学数据,通过查询模板灵活控制对数据库的访问,采用构件化方法设计和构造数据库应用程序,从而快速构建主题数据库。基于该方法构建的主题数据库能够快速增删主题数据的类型,具有高度的灵活性。
- 张国庆曹顺良方焯许庆炜骆清铭
- 关键词：生命科学主题数据库
- 数字化大鼠动脉血管系统三维模型的建立被引量：3
- 2008年
- 采用含造影剂及显色剂的填充剂对成年SD大鼠动脉血管系统进行灌注,并借助数字X射线成像设备对灌注效果进行实时监测,通过断层解剖成像系统获取切削间距为100μm的二维断面解剖数据集(图像分辨率为4917×3446×24bit,共1464张),最后利用Visual C++结合可视化工具包编程实现数据集的动脉分割及三维可视化,得到数字化SD大鼠动脉血管系统的三维模型。该模型能提供大鼠动脉血管系统的空间结构信息,为实验大鼠血管系统的研究提供了更为准确可靠的形态学参考。
- 廖银萍余雳白雪岭刘谦骆清铭龚辉
- 关键词：三维模型
