山东省教育厅科技计划(J06P04)
- 作品数：10 被引量：10H指数：2
- 相关作者：于彬王广彬赵立宽王翼飞问浩更多>>
- 相关机构：青岛科技大学上海大学青岛大学更多>>
- 发文基金：山东省教育厅科技计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：理学生物学自动化与计算机技术更多>>
- 关于矩阵理论中一个定理证明的注记
- 2007年
- 指出了在某些矩阵理论中一个定理证明中的错误,并进行了修正.
- 赵立宽刘雪洁胡大海
- 基于离散小波变换的膜蛋白跨膜螺旋区段预测被引量：2
- 2008年
- 基因组计划所产生的大量蛋白质序列迫切需要从理论上预测跨膜螺旋区段.文中采用基于离散小波变换的方法预测膜蛋白跨膜螺旋区段的数目和位置.以PDB代码为1KQG的膜蛋白为例,描述了该方法对跨膜螺旋区段的数目和位置的预测分析过程.从最新的MPtopo数据库中随机抽取80条三维结构已知的膜蛋白序列作为测试集(含325个跨膜螺旋区),采用该方法对跨膜螺旋区段进行预测,其中312个跨膜螺旋区被准确预测到,预测准确率为96.6%.并将预测结果与7种常用预测方法的主要预测结果进行了比较.结果表明,该文提出的方法具有较高的预测准确度.
- 于彬王广彬王翼飞
- 关键词：离散小波变换膜蛋白疏水性
- 膜蛋白跨膜螺旋区段的预测研究被引量：1
- 2008年
- 提出了一种基于离散小波变换的预测膜蛋白跨膜螺旋区段数目和位置的方法,并以PDB代码为1F88的膜蛋白为例,描述了该方法对跨膜螺旋区段的数目和位置的预测分析过程。为了测试该方法的实际效果,采用25条膜蛋白序列作为测试集,并将预测结果与5种常用预测方法的主要预测结果进行比较。结果表明,提出的方法具有较高的预测准确度。
- 于彬
- 关键词：小波变换膜蛋白疏水性
- 基于小波变换的膜蛋白跨膜螺旋区段预测分析被引量：1
- 2008年
- 提出了一种基于离散小波变换的预测膜蛋白跨膜螺旋区段数目和位置的方法。以PDB代码为1F88的膜蛋白为例,描述了该方法对跨膜螺旋区段的数目和位置的预测分析过程。为了测试方法的实际效果,采用19条膜蛋白序列作为测试集,并将预测结果与DAS、PRED-TMR2、SOSUI、HMMTOP2.0、TMHMM2.0五种常用预测方法的主要预测结果进行比较。结果表明,本工作提出的方法具有较高的预测准确度。
- 于彬王广彬
- 关键词：小波变换膜蛋白
- 关于共同宽容的单机交错排序问题
- 2007年
- 研究关于共同宽容交货期的单机排序问题.当共同的宽容区间大小给定,位置不固定问题时,该问题证明是NP-hard的,并给出了求解上述问题的动态规划算法.
- 于彬王广彬许春明
- 关键词：排序动态规划算法
- 逆H矩阵的新性质被引量：1
- 2008年
- 本文在文[4]给出的逆H矩阵定义的基础上,给出了逆H矩阵的新性质.
- 王广彬问浩
- 关键词：H矩阵M矩阵
- 单机交错排序问题的复杂性证明
- 2007年
- 关于共同宽容交货的单机排序问题,对于宽容区间大小给定,位置不固定的情况,给出了5条性质,证明该问题是NP-困难的.
- 于彬王广彬赵立宽孙亮
- 关键词：NP-困难
- 基于SVM-OVA方法的多类别基因表达数据分类被引量：3
- 2008年
- 本研究针对多类别的癌症分类问题,首先运用似然比检验筛选出表达水平发生显著性变化的特征基因,然后把支持向量机(SVM)和One-Versus-All(OVA)方法结合,提出了SVM-OVA多类别分类判别模型,通过对多类别的乳腺癌DNA微阵列数据进行计算,达到了77.3%的分类准确度。
- 于彬
- 关键词：基因表达DNA微阵列
- 基于支持向量机的肿瘤基因数据挖掘被引量：1
- 2009年
- 针对两种类别的肿瘤分类问题,首先运用信噪比方法筛选出表达水平发生显著性变化的特征基因,然后采用支持向量机作为分类器进行肿瘤分类,通过对两种类别的白血病DNA微阵列数据进行计算,达到了97.1%的分类准确度。
- 于彬
- 关键词：DNA微阵列支持向量机
- 小波变换在膜蛋白跨膜螺旋区段预测中的应用被引量：1
- 2010年
- 膜蛋白跨膜螺旋区段的预测是当前生物信息学研究的一个重要领域.提出了一种基于离散小波变换的预测膜蛋白跨膜螺旋区段数目和位置的方法.以PDB代码为1KQG的膜蛋白为例,描述了该方法对跨膜螺旋区段的数目和位置的预测分析过程.为了测试方法的实际效果,从最新的MPtopo数据库中随机抽取80条三维结构已知的膜蛋白序列作为测试集(含325个跨膜螺旋区),采用该方法对跨膜螺旋区段进行预测,其中308个跨膜螺旋区被准确预测到,预测准确率为96.3%.并且按照膜蛋白的功能和类型,把80条序列划分成13组,对每一组膜蛋白序列进行跨膜螺旋区段预测,达到了令人满意的结果.
- 于彬
- 关键词：离散小波变换膜蛋白疏水性
